RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366672.4

GALNT2-201, Transcript of polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GALNT2, Length 4,454 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT2-201ENST00000366672 C8orf17Q9NRJ1 99 aa11.84□□□□□ -0.51
GALNT2-201ENST00000366672 IGLV7-43P04211 117 aa11.83□□□□□ -0.52
GALNT2-201ENST00000366672 SPRR4Q96PI1 79 aa11.82□□□□□ -0.52
GALNT2-201ENST00000366672 FREM2Q5SZK8 3169 aa11.82□□□□□ -0.52
GALNT2-201ENST00000366672 A0A1B0GVX0 72 aa11.8□□□□□ -0.52
GALNT2-201ENST00000366672 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.52
GALNT2-201ENST00000366672 ZZEF1O43149 2961 aa11.77□□□□□ -0.53
GALNT2-201ENST00000366672 LINC00336Q6ZUF6 198 aa11.77□□□□□ -0.53
GALNT2-201ENST00000366672 Q96NJ1 140 aa11.77□□□□□ -0.53
GALNT2-201ENST00000366672 ANAPC11Q9NYG5 84 aa11.77□□□□□ -0.53
GALNT2-201ENST00000366672 LRBAP50851 2863 aa11.76□□□□□ -0.53
GALNT2-201ENST00000366672 COA5Q86WW8 74 aa11.74□□□□□ -0.53
GALNT2-201ENST00000366672 LINC00304Q8N9R0 145 aa11.72□□□□□ -0.53
GALNT2-201ENST00000366672 TNP2Q05952 138 aa11.72□□□□□ -0.53
GALNT2-201ENST00000366672 Q8NDZ9 215 aa11.7□□□□□ -0.54
GALNT2-201ENST00000366672 REV3LO60673 3130 aa11.7□□□□□ -0.54
GALNT2-201ENST00000366672 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa11.7□□□□□ -0.54
GALNT2-201ENST00000366672 HIVEP1P15822 2718 aa11.69□□□□□ -0.54
GALNT2-201ENST00000366672 A8MUN3 132 aa11.69□□□□□ -0.54
GALNT2-201ENST00000366672 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
GALNT2-201ENST00000366672 OCR1Q9BZK8 76 aa11.68□□□□□ -0.54
GALNT2-201ENST00000366672 EYSQ5T1H1 3165 aa11.67□□□□□ -0.54
GALNT2-201ENST00000366672 DSCR10P59022 87 aa11.67□□□□□ -0.54
GALNT2-201ENST00000366672 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
GALNT2-201ENST00000366672 APCP25054 2843 aa11.66□□□□□ -0.54
GALNT2-201ENST00000366672 DMXL1Q9Y485 3027 aa11.65□□□□□ -0.54
GALNT2-201ENST00000366672 SPRR1AP35321 89 aa11.65□□□□□ -0.54
GALNT2-201ENST00000366672 STAB2Q8WWQ8 2551 aa11.64□□□□□ -0.55
GALNT2-201ENST00000366672 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa11.63□□□□□ -0.55
GALNT2-201ENST00000366672 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa11.63□□□□□ -0.55
GALNT2-201ENST00000366672 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa11.63□□□□□ -0.55
GALNT2-201ENST00000366672 ZANQ9Y493 2812 aa11.63□□□□□ -0.55
GALNT2-201ENST00000366672 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP11.59□□□□□ -0.556e-7■□□□□ 10.3
GALNT2-201ENST00000366672 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa11.57□□□□□ -0.56
GALNT2-201ENST00000366672 SPEGQ15772 3267 aa11.56□□□□□ -0.56
GALNT2-201ENST00000366672 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa11.55□□□□□ -0.56
GALNT2-201ENST00000366672 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
GALNT2-201ENST00000366672 PLAC8Q9NZF1 115 aa11.54□□□□□ -0.56
GALNT2-201ENST00000366672 CD164Q04900 197 aa11.53□□□□□ -0.56
GALNT2-201ENST00000366672 UQCR11O14957 56 aa11.5□□□□□ -0.57
GALNT2-201ENST00000366672 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
GALNT2-201ENST00000366672 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
GALNT2-201ENST00000366672 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa11.48□□□□□ -0.57
GALNT2-201ENST00000366672 CELSR2Q9HCU4 2923 aa11.48□□□□□ -0.57
GALNT2-201ENST00000366672 SPRR1BP22528 89 aa11.47□□□□□ -0.57
GALNT2-201ENST00000366672 J3QL48 77 aa11.46□□□□□ -0.57
GALNT2-201ENST00000366672 C9orf92A6NGG3 77 aa11.46□□□□□ -0.58
GALNT2-201ENST00000366672 LOC400499M0QZD8 3231 aa11.44□□□□□ -0.58
GALNT2-201ENST00000366672 FAM229BQ4G0N7 80 aa11.44□□□□□ -0.58
GALNT2-201ENST00000366672 USP34Q70CQ2 3546 aa11.4□□□□□ -0.58
GALNT2-201ENST00000366672 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
GALNT2-201ENST00000366672 TENM4Q6N022 2769 aa11.36□□□□□ -0.59
GALNT2-201ENST00000366672 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa11.35□□□□□ -0.59
GALNT2-201ENST00000366672 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa11.35□□□□□ -0.59
GALNT2-201ENST00000366672 MIR22HGQ0VDD5 57 aa11.35□□□□□ -0.59
GALNT2-201ENST00000366672 Q1T7F1 81 aa11.35□□□□□ -0.59
GALNT2-201ENST00000366672 CYSTM1Q9H1C7 97 aa11.35□□□□□ -0.59
GALNT2-201ENST00000366672 NF1P21359 2839 aa11.34□□□□□ -0.59
GALNT2-201ENST00000366672 PRR26Q8N8Z3 221 aa11.34□□□□□ -0.59
GALNT2-201ENST00000366672 DCHS2Q6V1P9 2916 aa11.34□□□□□ -0.59
GALNT2-201ENST00000366672 LINC00472Q9H8W2 130 aa11.33□□□□□ -0.6
GALNT2-201ENST00000366672 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
GALNT2-201ENST00000366672 Q6ZR54 194 aa11.25□□□□□ -0.61
GALNT2-201ENST00000366672 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa11.23□□□□□ -0.61
GALNT2-201ENST00000366672 FBN2P35556 2912 aa11.22□□□□□ -0.61
GALNT2-201ENST00000366672 Q8N1X5 172 aa11.21□□□□□ -0.62
GALNT2-201ENST00000366672 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa11.2□□□□□ -0.62
GALNT2-201ENST00000366672 HRES1P13985 223 aa11.19□□□□□ -0.62
GALNT2-201ENST00000366672 KRTAP10-2P60368 255 aa11.19□□□□□ -0.62
GALNT2-201ENST00000366672 KRTAP10-1P60331 282 aa11.19□□□□□ -0.62
GALNT2-201ENST00000366672 PANO1I0J062 215 aa11.19□□□□□ -0.62
GALNT2-201ENST00000366672 Q5XG85 94 aa11.19□□□□□ -0.62
GALNT2-201ENST00000366672 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
GALNT2-201ENST00000366672 LCE6AA0A183 80 aa11.17□□□□□ -0.62
GALNT2-201ENST00000366672 COX6B2Q6YFQ2 88 aa11.16□□□□□ -0.62
GALNT2-201ENST00000366672 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa11.16□□□□□ -0.62
GALNT2-201ENST00000366672 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
GALNT2-201ENST00000366672 LINC00483Q53H64 154 aa11.13□□□□□ -0.63
GALNT2-201ENST00000366672 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa11.13□□□□□ -0.63
GALNT2-201ENST00000366672 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
GALNT2-201ENST00000366672 Q75L30 129 aa11.11□□□□□ -0.63
GALNT2-201ENST00000366672 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa11.1□□□□□ -0.63
GALNT2-201ENST00000366672 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
GALNT2-201ENST00000366672 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
GALNT2-201ENST00000366672 MXRA5Q9NR99 2828 aa11.06□□□□□ -0.64
GALNT2-201ENST00000366672 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
GALNT2-201ENST00000366672 Q5W150 140 aa11.04□□□□□ -0.64
GALNT2-201ENST00000366672 LCA10Q71F78 164 aa11.03□□□□□ -0.64
GALNT2-201ENST00000366672 MYO15AQ9UKN7 3530 aa11.03□□□□□ -0.64
GALNT2-201ENST00000366672 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
GALNT2-201ENST00000366672 OXTP01178 125 aa11.02□□□□□ -0.65
GALNT2-201ENST00000366672 Q6ZSA8 131 aa10.99□□□□□ -0.65
GALNT2-201ENST00000366672 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa10.99□□□□□ -0.65
GALNT2-201ENST00000366672 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa10.96□□□□□ -0.65
GALNT2-201ENST00000366672 CRIPTQ9P021 101 aa10.96□□□□□ -0.65
GALNT2-201ENST00000366672 Q5VV11 94 aa10.94□□□□□ -0.66
GALNT2-201ENST00000366672 SPINT4Q6UDR6 99 aa10.93□□□□□ -0.66
GALNT2-201ENST00000366672 A0A1B0GU33 70 aa10.92□□□□□ -0.66
GALNT2-201ENST00000366672 Q5VSD8 79 aa10.92□□□□□ -0.66
GALNT2-201ENST00000366672 A0A087X002 238 aa10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 187.9 ms