RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583667.1

GGA3-217, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 531 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-217ENST00000583667 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.64□□□□□ -1.19
GGA3-217ENST00000583667 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
GGA3-217ENST00000583667 F8W1H4 67 aa7.63□□□□□ -1.19
GGA3-217ENST00000583667 LST1O00453 97 aa7.63□□□□□ -1.19
GGA3-217ENST00000583667 ATXN8Q156A1 80 aa7.63□□□□□ -1.19
GGA3-217ENST00000583667 H3BMG7 143 aa7.62□□□□□ -1.19
GGA3-217ENST00000583667 M0QXV9 152 aa7.62□□□□□ -1.19
GGA3-217ENST00000583667 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.62□□□□□ -1.19
GGA3-217ENST00000583667 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
GGA3-217ENST00000583667 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.62□□□□□ -1.19
GGA3-217ENST00000583667 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.62□□□□□ -1.19
GGA3-217ENST00000583667 A0A1B0GX51 115 aa7.61□□□□□ -1.19
GGA3-217ENST00000583667 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7.61□□□□□ -1.19
GGA3-217ENST00000583667 PRO0461Q9UI25 63 aa7.61□□□□□ -1.19
GGA3-217ENST00000583667 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-217ENST00000583667 NCR3O14931 201 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-217ENST00000583667 TRACP01848 142 aa7.6□□□□□ -1.19
GGA3-217ENST00000583667 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.59□□□□□ -1.19
GGA3-217ENST00000583667 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa7.59□□□□□ -1.19
GGA3-217ENST00000583667 KRTAP10-1P60331 282 aa7.59□□□□□ -1.19
GGA3-217ENST00000583667 GAGE2BQ13066 116 aa7.59□□□□□ -1.19
GGA3-217ENST00000583667 LINC01620Q4KN68 170 aa7.59□□□□□ -1.19
GGA3-217ENST00000583667 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.59□□□□□ -1.19
GGA3-217ENST00000583667 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
GGA3-217ENST00000583667 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.58□□□□□ -1.2
GGA3-217ENST00000583667 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.58□□□□□ -1.2
GGA3-217ENST00000583667 LRP2P98164 4655 aa7.58□□□□□ -1.2
GGA3-217ENST00000583667 A0A096LNI7 61 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-217ENST00000583667 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-217ENST00000583667 C7orf33Q8WU49 177 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-217ENST00000583667 CLEC2BQ92478 149 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-217ENST00000583667 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-217ENST00000583667 HAMPP81172 84 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-217ENST00000583667 C22orf24Q9Y442 160 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-217ENST00000583667 FAT3Q8TDW7 4589 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-217ENST00000583667 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-217ENST00000583667 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
GGA3-217ENST00000583667 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
GGA3-217ENST00000583667 C6orf99Q4VX62 202 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-217ENST00000583667 LINC00167Q96N53 147 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-217ENST00000583667 H3BT86 120 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-217ENST00000583667 SPRR1AP35321 89 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-217ENST00000583667 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
GGA3-217ENST00000583667 DIRC1Q969H9 104 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-217ENST00000583667 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-217ENST00000583667 A0A1W2PNN7 141 aa7.53□□□□□ -1.2
GGA3-217ENST00000583667 FAM168BA1KXE4 195 aa7.53□□□□□ -1.2
GGA3-217ENST00000583667 C9JAW5 83 aa7.53□□□□□ -1.2
GGA3-217ENST00000583667 SLC25A20O43772 301 aa7.53□□□□□ -1.2
GGA3-217ENST00000583667 SNCGO76070 127 aa7.53□□□□□ -1.2
GGA3-217ENST00000583667 LINC00575Q6W349 94 aa7.53□□□□□ -1.2
GGA3-217ENST00000583667 PRYO14603 147 aa7.52□□□□□ -1.21
GGA3-217ENST00000583667 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
GGA3-217ENST00000583667 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7.52□□□□□ -1.21
GGA3-217ENST00000583667 A0A087WYN8 130 aa7.51□□□□□ -1.21
GGA3-217ENST00000583667 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
GGA3-217ENST00000583667 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa7.5□□□□□ -1.21
GGA3-217ENST00000583667 OXTP01178 125 aa7.5□□□□□ -1.21
GGA3-217ENST00000583667 COX7BP24311 80 aa7.5□□□□□ -1.21
GGA3-217ENST00000583667 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
GGA3-217ENST00000583667 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.5□□□□□ -1.21
GGA3-217ENST00000583667 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.5□□□□□ -1.21
GGA3-217ENST00000583667 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa7.5□□□□□ -1.21
GGA3-217ENST00000583667 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa7.49□□□□□ -1.21
GGA3-217ENST00000583667 H3BQ85 93 aa7.49□□□□□ -1.21
GGA3-217ENST00000583667 TEN1Q86WV5 123 aa7.49□□□□□ -1.21
GGA3-217ENST00000583667 hADV29S1A0JD25 119 aa7.48□□□□□ -1.21
GGA3-217ENST00000583667 DNAL4O96015 105 aa7.48□□□□□ -1.21
GGA3-217ENST00000583667 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
GGA3-217ENST00000583667 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.48□□□□□ -1.21
GGA3-217ENST00000583667 CHTF8P0CG12 524 aa7.48□□□□□ -1.21
GGA3-217ENST00000583667 GHRHP01286 108 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-217ENST00000583667 ETDBQ3ZM63 59 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-217ENST00000583667 PANO1I0J062 215 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-217ENST00000583667 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-217ENST00000583667 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
GGA3-217ENST00000583667 MTURNQ8N3F0 131 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-217ENST00000583667 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-217ENST00000583667 RPL37AP8A6NKH3 93 aa7.45□□□□□ -1.22
GGA3-217ENST00000583667 B5MCH6 92 aa7.45□□□□□ -1.22
GGA3-217ENST00000583667 REG3GQ6UW15 175 aa7.45□□□□□ -1.22
GGA3-217ENST00000583667 ORMDL1Q9P0S3 153 aa7.45□□□□□ -1.22
GGA3-217ENST00000583667 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
GGA3-217ENST00000583667 DNAH8Q96JB1 4490 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-217ENST00000583667 H0Y9J4 135 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-217ENST00000583667 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-217ENST00000583667 Q6ZRX8 168 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-217ENST00000583667 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-217ENST00000583667 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-217ENST00000583667 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.42□□□□□ -1.22
GGA3-217ENST00000583667 K7ERU9 68 aa7.42□□□□□ -1.22
GGA3-217ENST00000583667 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
GGA3-217ENST00000583667 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.42□□□□□ -1.22
GGA3-217ENST00000583667 Q6ZSA8 131 aa7.41□□□□□ -1.22
GGA3-217ENST00000583667 DPH3Q96FX2 82 aa7.41□□□□□ -1.22
GGA3-217ENST00000583667 J3QR89 54 aa7.4□□□□□ -1.22
GGA3-217ENST00000583667 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.4□□□□□ -1.22
GGA3-217ENST00000583667 TNXBP22105 4242 aa7.39□□□□□ -1.23
GGA3-217ENST00000583667 UBE2BP63146 152 aa7.39□□□□□ -1.23
GGA3-217ENST00000583667 Q6ZQY7 126 aa7.39□□□□□ -1.23
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