RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558936.5

RABGGTA-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTA, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-207ENST00000558936 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTA-207ENST00000558936 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTA-207ENST00000558936 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTA-207ENST00000558936 SPANXCQ9NY87 97 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTA-207ENST00000558936 TSPAN13O95857 204 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGGTA-207ENST00000558936 MUC17Q685J3 4493 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTA-207ENST00000558936 Q6ZRX8 168 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTA-207ENST00000558936 C20orf202A1L168 122 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGGTA-207ENST00000558936 LINC00483Q53H64 154 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGGTA-207ENST00000558936 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGGTA-207ENST00000558936 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGGTA-207ENST00000558936 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGGTA-207ENST00000558936 S100A12P80511 92 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGGTA-207ENST00000558936 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGGTA-207ENST00000558936 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGGTA-207ENST00000558936 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
RABGGTA-207ENST00000558936 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RABGGTA-207ENST00000558936 LINC00304Q8N9R0 145 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGGTA-207ENST00000558936 S100A2P29034 98 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGGTA-207ENST00000558936 PRR4Q16378 134 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGGTA-207ENST00000558936 MUC2Q02817 5179 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGGTA-207ENST00000558936 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGGTA-207ENST00000558936 S100A6P06703 90 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGGTA-207ENST00000558936 AKR1D1P51857 326 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGGTA-207ENST00000558936 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGGTA-207ENST00000558936 GAGE2AQ6NT46 116 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGGTA-207ENST00000558936 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGGTA-207ENST00000558936 IFITM1P13164 125 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGGTA-207ENST00000558936 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
RABGGTA-207ENST00000558936 CTAG1AP78358 180 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGGTA-207ENST00000558936 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
RABGGTA-207ENST00000558936 C6orf99Q4VX62 202 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGGTA-207ENST00000558936 LINC00518Q8N0U6 118 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGGTA-207ENST00000558936 SCGB1D1O95968 90 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGGTA-207ENST00000558936 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RABGGTA-207ENST00000558936 Q8NBF4 154 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGGTA-207ENST00000558936 CBY1Q9Y3M2 126 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGGTA-207ENST00000558936 COX8AP10176 69 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGGTA-207ENST00000558936 SPRR1BP22528 89 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGGTA-207ENST00000558936 SPAG11AQ6PDA7 123 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGGTA-207ENST00000558936 Q6ZVH6 145 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGGTA-207ENST00000558936 A4D1N5 150 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGGTA-207ENST00000558936 C2orf91Q6ZV80 131 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGGTA-207ENST00000558936 SMIM11BQ8TCY0 68 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGGTA-207ENST00000558936 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
RABGGTA-207ENST00000558936 SMIM29Q86T20 159 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGGTA-207ENST00000558936 C14orf144Q96I85 54 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGGTA-207ENST00000558936 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTA-207ENST00000558936 MOBPQ13875 183 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTA-207ENST00000558936 PYY3Q5JQD4 70 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTA-207ENST00000558936 COPS9Q8WXC6 57 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGGTA-207ENST00000558936 DLEU1O43261 78 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTA-207ENST00000558936 COX7BP24311 80 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTA-207ENST00000558936 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTA-207ENST00000558936 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTA-207ENST00000558936 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTA-207ENST00000558936 PAM16Q9Y3D7 125 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTA-207ENST00000558936 A6NDN8 102 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTA-207ENST00000558936 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTA-207ENST00000558936 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTA-207ENST00000558936 A0A0G2JQZ4 141 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTA-207ENST00000558936 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTA-207ENST00000558936 SPINK1P00995 79 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTA-207ENST00000558936 C12orf57Q99622 126 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTA-207ENST00000558936 SPATA45Q537H7 98 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTA-207ENST00000558936 Q8N377 158 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTA-207ENST00000558936 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTA-207ENST00000558936 CFC1BP0CG36 223 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTA-207ENST00000558936 CFC1P0CG37 223 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTA-207ENST00000558936 TPRXLQ17RH7 258 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGGTA-207ENST00000558936 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGGTA-207ENST00000558936 A0A1B0GWB2 263 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGGTA-207ENST00000558936 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
RABGGTA-207ENST00000558936 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGGTA-207ENST00000558936 HIGD1BQ9P298 99 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGGTA-207ENST00000558936 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
RABGGTA-207ENST00000558936 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
RABGGTA-207ENST00000558936 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGGTA-207ENST00000558936 Q1RN00 199 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTA-207ENST00000558936 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTA-207ENST00000558936 LINC00575Q6W349 94 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTA-207ENST00000558936 FAT4Q6V0I7 4981 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGGTA-207ENST00000558936 TAL2Q16559 108 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGGTA-207ENST00000558936 SLC25A34Q6PIV7 304 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGGTA-207ENST00000558936 HIST1H4GQ99525 98 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGGTA-207ENST00000558936 VAMP8Q9BV40 100 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGGTA-207ENST00000558936 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGGTA-207ENST00000558936 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGGTA-207ENST00000558936 FXYD2P54710 66 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGGTA-207ENST00000558936 CDIP1Q9H305 208 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGGTA-207ENST00000558936 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTA-207ENST00000558936 SLC25A20O43772 301 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTA-207ENST00000558936 HRCT1Q6UXD1 115 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTA-207ENST00000558936 CEND1Q8N111 149 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTA-207ENST00000558936 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTA-207ENST00000558936 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
RABGGTA-207ENST00000558936 A0A0B4J2C4 111 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTA-207ENST00000558936 VAMP3Q15836 100 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTA-207ENST00000558936 Q6ZQY7 126 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTA-207ENST00000558936 H7C2G1 150 aa6.99□□□□□ -1.29
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