RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494956.1

NELFE-213, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-213ENST00000494956 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.1□□□□□ -1.43
NELFE-213ENST00000494956 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.09□□□□□ -1.43
NELFE-213ENST00000494956 Q9BRP9 147 aa6.09□□□□□ -1.43
NELFE-213ENST00000494956 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.08□□□□□ -1.44
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NELFE-213ENST00000494956 Q8NBF4 154 aa6.08□□□□□ -1.44
NELFE-213ENST00000494956 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.08□□□□□ -1.44
NELFE-213ENST00000494956 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
NELFE-213ENST00000494956 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
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NELFE-213ENST00000494956 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.06□□□□□ -1.44
NELFE-213ENST00000494956 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.06□□□□□ -1.44
NELFE-213ENST00000494956 NDUFC2O95298 119 aa6.06□□□□□ -1.44
NELFE-213ENST00000494956 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.05□□□□□ -1.44
NELFE-213ENST00000494956 LINC00483Q53H64 154 aa6.05□□□□□ -1.44
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NELFE-213ENST00000494956 ATOH7Q8N100 152 aa6.03□□□□□ -1.44
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NELFE-213ENST00000494956 SPANXCQ9NY87 97 aa6.01□□□□□ -1.45
NELFE-213ENST00000494956 TIMM17BO60830 172 aa6□□□□□ -1.45
NELFE-213ENST00000494956 CTAG1AP78358 180 aa5.99□□□□□ -1.45
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NELFE-213ENST00000494956 C9orf153Q5TBE3 101 aa5.98□□□□□ -1.45
NELFE-213ENST00000494956 SPINK1P00995 79 aa5.97□□□□□ -1.45
NELFE-213ENST00000494956 SCGB1D4Q6XE38 83 aa5.97□□□□□ -1.45
NELFE-213ENST00000494956 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa5.97□□□□□ -1.45
NELFE-213ENST00000494956 PCP2Q8IVA1 136 aa5.97□□□□□ -1.45
NELFE-213ENST00000494956 C9orf118A6NHY6 69 aa5.96□□□□□ -1.46
NELFE-213ENST00000494956 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa5.96□□□□□ -1.46
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NELFE-213ENST00000494956 Q8N377 158 aa5.96□□□□□ -1.46
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NELFE-213ENST00000494956 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.95□□□□□ -1.46
NELFE-213ENST00000494956 C20orf202A1L168 122 aa5.95□□□□□ -1.46
NELFE-213ENST00000494956 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
NELFE-213ENST00000494956 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
NELFE-213ENST00000494956 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.95□□□□□ -1.46
NELFE-213ENST00000494956 COX7BP24311 80 aa5.94□□□□□ -1.46
NELFE-213ENST00000494956 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
NELFE-213ENST00000494956 HRCT1Q6UXD1 115 aa5.94□□□□□ -1.46
NELFE-213ENST00000494956 MUSTN1Q8IVN3 82 aa5.94□□□□□ -1.46
NELFE-213ENST00000494956 MUC2Q02817 5179 aa5.94□□□□□ -1.46
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NELFE-213ENST00000494956 HIST3H2BBQ8N257 126 aa5.93□□□□□ -1.46
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NELFE-213ENST00000494956 Q1RN00 199 aa5.92□□□□□ -1.46
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NELFE-213ENST00000494956 A6NDN8 102 aa5.91□□□□□ -1.46
NELFE-213ENST00000494956 RPS29P62273 56 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
NELFE-213ENST00000494956 HIST1H2BLQ99880 126 aa5.91□□□□□ -1.46
NELFE-213ENST00000494956 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa5.91□□□□□ -1.46
NELFE-213ENST00000494956 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa5.91□□□□□ -1.46
NELFE-213ENST00000494956 CBY1Q9Y3M2 126 aa5.91□□□□□ -1.46
NELFE-213ENST00000494956 SLC25A20O43772 301 aa5.9□□□□□ -1.46
NELFE-213ENST00000494956 IFITM1P13164 125 aa5.9□□□□□ -1.46
NELFE-213ENST00000494956 A0A0U1RQV1 116 aa5.89□□□□□ -1.47
NELFE-213ENST00000494956 C5orf52A6NGY3 159 aa5.89□□□□□ -1.47
NELFE-213ENST00000494956 TAL2Q16559 108 aa5.89□□□□□ -1.47
NELFE-213ENST00000494956 S100A2P29034 98 aa5.88□□□□□ -1.47
NELFE-213ENST00000494956 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
NELFE-213ENST00000494956 SMIM29Q86T20 159 aa5.88□□□□□ -1.47
NELFE-213ENST00000494956 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa5.88□□□□□ -1.47
NELFE-213ENST00000494956 H7C2G1 150 aa5.87□□□□□ -1.47
NELFE-213ENST00000494956 SMIM11BQ8TCY0 68 aa5.87□□□□□ -1.47
NELFE-213ENST00000494956 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa5.86□□□□□ -1.47
NELFE-213ENST00000494956 SLC25A34Q6PIV7 304 aa5.86□□□□□ -1.47
NELFE-213ENST00000494956 Q6ZVH6 145 aa5.86□□□□□ -1.47
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NELFE-213ENST00000494956 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa5.85□□□□□ -1.47
NELFE-213ENST00000494956 A0A1B0GWB2 263 aa5.85□□□□□ -1.47
NELFE-213ENST00000494956 S100A1P23297 94 aa5.85□□□□□ -1.47
NELFE-213ENST00000494956 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.85□□□□□ -1.47
NELFE-213ENST00000494956 COPS9Q8WXC6 57 aa5.85□□□□□ -1.47
NELFE-213ENST00000494956 A4D1N5 150 aa5.84□□□□□ -1.47
NELFE-213ENST00000494956 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
NELFE-213ENST00000494956 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa5.83□□□□□ -1.48
NELFE-213ENST00000494956 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa5.83□□□□□ -1.48
NELFE-213ENST00000494956 C9orf92A6NGG3 77 aa5.83□□□□□ -1.48
NELFE-213ENST00000494956 HSBP1L1C9JCN9 74 aa5.83□□□□□ -1.48
NELFE-213ENST00000494956 S100A6P06703 90 aa5.83□□□□□ -1.48
NELFE-213ENST00000494956 AKR1D1P51857 326 aa5.83□□□□□ -1.48
NELFE-213ENST00000494956 C12orf57Q99622 126 aa5.83□□□□□ -1.48
NELFE-213ENST00000494956 SCGB1D1O95968 90 aa5.82□□□□□ -1.48
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