RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		3.77	□□□□□ -1.81
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM126A	Q9H061	195 aa		3.77	□□□□□ -1.81
C4BPB-208	ENST00000492730	C14orf132	Q9NPU4	83 aa		3.77	□□□□□ -1.81
C4BPB-208	ENST00000492730	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		3.76	□□□□□ -1.81
C4BPB-208	ENST00000492730	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		3.76	□□□□□ -1.81
C4BPB-208	ENST00000492730		A0A1B0GV72	72 aa		3.76	□□□□□ -1.81
C4BPB-208	ENST00000492730	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
C4BPB-208	ENST00000492730	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		3.76	□□□□□ -1.81
C4BPB-208	ENST00000492730		Q6ZRP5	223 aa		3.76	□□□□□ -1.81
C4BPB-208	ENST00000492730	C2orf48	Q96LS8	159 aa		3.76	□□□□□ -1.81
C4BPB-208	ENST00000492730	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		3.76	□□□□□ -1.81
C4BPB-208	ENST00000492730	GAGE2E	Q4V326	116 aa		3.75	□□□□□ -1.81
C4BPB-208	ENST00000492730	UPK3B	Q9BT76	320 aa		3.75	□□□□□ -1.81
C4BPB-208	ENST00000492730	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		3.75	□□□□□ -1.81
C4BPB-208	ENST00000492730	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		3.75	□□□□□ -1.81
C4BPB-208	ENST00000492730	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
C4BPB-208	ENST00000492730		A0A1B0GX51	115 aa		3.74	□□□□□ -1.81
C4BPB-208	ENST00000492730	USP17L23	D6RBM5	183 aa		3.74	□□□□□ -1.81
C4BPB-208	ENST00000492730	SYCN	Q0VAF6	134 aa		3.74	□□□□□ -1.81
C4BPB-208	ENST00000492730	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		3.74	□□□□□ -1.81
C4BPB-208	ENST00000492730	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		3.74	□□□□□ -1.81
C4BPB-208	ENST00000492730	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		3.74	□□□□□ -1.81
C4BPB-208	ENST00000492730		Q6Q795	121 aa		3.74	□□□□□ -1.81
C4BPB-208	ENST00000492730		Q6ZR54	194 aa		3.74	□□□□□ -1.81
C4BPB-208	ENST00000492730	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		3.74	□□□□□ -1.81
C4BPB-208	ENST00000492730	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		3.73	□□□□□ -1.81
C4BPB-208	ENST00000492730	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		3.73	□□□□□ -1.81
C4BPB-208	ENST00000492730	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		3.73	□□□□□ -1.81
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM168B	A1KXE4	195 aa		3.73	□□□□□ -1.81
C4BPB-208	ENST00000492730	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		3.73	□□□□□ -1.81
C4BPB-208	ENST00000492730		M0R378	163 aa		3.73	□□□□□ -1.81
C4BPB-208	ENST00000492730	DNAL4	O96015	105 aa		3.73	□□□□□ -1.81
C4BPB-208	ENST00000492730	C7orf33	Q8WU49	177 aa		3.73	□□□□□ -1.81
C4BPB-208	ENST00000492730	LINC00846	Q9NV44	126 aa		3.73	□□□□□ -1.81
C4BPB-208	ENST00000492730	hADV29S1	A0JD25	119 aa		3.72	□□□□□ -1.81
C4BPB-208	ENST00000492730	RTL8C	O15255	209 aa		3.72	□□□□□ -1.81
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
C4BPB-208	ENST00000492730	SNCG	O76070	127 aa		3.72	□□□□□ -1.81
C4BPB-208	ENST00000492730	ACYP1	P07311	99 aa		3.72	□□□□□ -1.81
C4BPB-208	ENST00000492730	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		3.72	□□□□□ -1.81
C4BPB-208	ENST00000492730	GAGE2B	Q13066	116 aa		3.72	□□□□□ -1.81
C4BPB-208	ENST00000492730		F8WDY8	70 aa		3.71	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730	CCK	P06307	115 aa		3.71	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		3.71	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730	COX7B	P24311	80 aa		3.71	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730		Q6ZQY7	126 aa		3.71	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730	LINC00643	Q86TS7	51 aa		3.71	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730	DIRC1	Q969H9	104 aa		3.71	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		3.7	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	3.7	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730		Q6ZQT0	140 aa		3.7	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		3.69	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		3.69	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		3.69	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730	CCDC179	H3BU77	68 aa		3.69	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		3.69	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730	PSCA	O43653	123 aa		3.69	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	3.69	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730		Q6JHZ5	121 aa		3.69	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		3.69	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		3.69	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		3.69	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730	LOC110117498	A0A087WWA1	95 aa		3.68	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		3.68	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730	KRTAP5-9	P26371	169 aa		3.68	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		3.68	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		3.67	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730		A0A087WVE0	104 aa		3.67	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730		A0A096LNI7	61 aa		3.67	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730		A0A1W2PNN7	141 aa		3.67	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730		B5MCH6	92 aa		3.67	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730	JMJD7-PLA2G4B	H0Y9G9	81 aa		3.67	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730	ERC2-IT1	O76042	136 aa		3.67	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730	SPRR1A	P35321	89 aa		3.67	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	3.67	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	3.67	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730		Q9BRP9	147 aa		3.67	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		3.67	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		3.66	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM236A	A0A1B0GUQ0	79 aa		3.66	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM236B	A0A1B0GV22	79 aa		3.66	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		3.66	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730		Q8N377	158 aa		3.66	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		3.66	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730	RMI2	Q96E14	147 aa		3.66	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730	IMUP	Q9GZP8	106 aa		3.66	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		3.66	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
C4BPB-208	ENST00000492730		A0A087WTM6	91 aa		3.65	□□□□□ -1.83
C4BPB-208	ENST00000492730	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		3.65	□□□□□ -1.83
C4BPB-208	ENST00000492730		A0A1B0GVY2	172 aa		3.65	□□□□□ -1.83
C4BPB-208	ENST00000492730	CHTF8	P0CG12	524 aa		3.65	□□□□□ -1.83
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		3.65	□□□□□ -1.83

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