RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
NISCH-213ENST00000489895 RPS28P62857 69 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
NISCH-213ENST00000489895 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-213ENST00000489895 SPAG11AQ6PDA7 123 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-213ENST00000489895 LINC00336Q6ZUF6 198 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-213ENST00000489895 Q96NJ1 140 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-213ENST00000489895 CNBPP62633 177 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
NISCH-213ENST00000489895 ERC2-IT1O76042 136 aa11.15□□□□□ -0.63
NISCH-213ENST00000489895 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa11.15□□□□□ -0.63
NISCH-213ENST00000489895 A0A1B0GU69 56 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-213ENST00000489895 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
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NISCH-213ENST00000489895 ZNF575Q86XF7 245 aa11.13□□□□□ -0.63
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NISCH-213ENST00000489895 WIPF1O43516 503 aa11.08□□□□□ -0.64
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NISCH-213ENST00000489895 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
NISCH-213ENST00000489895 A0A1W2PNN7 141 aa11.03□□□□□ -0.64
NISCH-213ENST00000489895 C8orf17Q9NRJ1 99 aa11.03□□□□□ -0.64
NISCH-213ENST00000489895 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa11.03□□□□□ -0.64
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NISCH-213ENST00000489895 ITPR3Q14573 2671 aa11.01□□□□□ -0.65
NISCH-213ENST00000489895 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa11.01□□□□□ -0.65
NISCH-213ENST00000489895 CHD7Q9P2D1 2997 aa11□□□□□ -0.65
NISCH-213ENST00000489895 CEP350Q5VT06 3117 aa11□□□□□ -0.65
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NISCH-213ENST00000489895 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
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NISCH-213ENST00000489895 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa10.89□□□□□ -0.67
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NISCH-213ENST00000489895 A0A1W2PNM2 257 aa10.88□□□□□ -0.67
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NISCH-213ENST00000489895 ANAPC11Q9NYG5 84 aa10.87□□□□□ -0.67
NISCH-213ENST00000489895 CFAP46Q8IYW2 2715 aa10.87□□□□□ -0.67
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NISCH-213ENST00000489895 A0A0G2JQZ4 141 aa10.85□□□□□ -0.67
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NISCH-213ENST00000489895 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-213ENST00000489895 FAM104AQ969W3 186 aa10.83□□□□□ -0.68
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NISCH-213ENST00000489895 ZNF292O60281 2723 aa10.73□□□□□ -0.69
NISCH-213ENST00000489895 C5orf42Q9H799 3197 aa10.73□□□□□ -0.69
NISCH-213ENST00000489895 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
NISCH-213ENST00000489895 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa10.72□□□□□ -0.69
NISCH-213ENST00000489895 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa10.71□□□□□ -0.69
NISCH-213ENST00000489895 A8MUN3 132 aa10.71□□□□□ -0.69
NISCH-213ENST00000489895 HTTP42858 3142 aa10.71□□□□□ -0.69
NISCH-213ENST00000489895 FAM229BQ4G0N7 80 aa10.7□□□□□ -0.7
NISCH-213ENST00000489895 TRANK1O15050 2925 aa10.7□□□□□ -0.7
NISCH-213ENST00000489895 CENPEQ02224 2701 aa10.69□□□□□ -0.7
NISCH-213ENST00000489895 PLAC8Q9NZF1 115 aa10.68□□□□□ -0.7
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NISCH-213ENST00000489895 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
NISCH-213ENST00000489895 PRR26Q8N8Z3 221 aa10.57□□□□□ -0.72
NISCH-213ENST00000489895 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-213ENST00000489895 SPRR1BP22528 89 aa10.53□□□□□ -0.72
NISCH-213ENST00000489895 Q6ZSA8 131 aa10.51□□□□□ -0.73
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NISCH-213ENST00000489895 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-213ENST00000489895 PCNTO95613 3336 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa10.47□□□□□ -0.73
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NISCH-213ENST00000489895 TEX15Q9BXT5 2789 aa10.44□□□□□ -0.74
NISCH-213ENST00000489895 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
NISCH-213ENST00000489895 UNC79Q9P2D8 2635 aa10.43□□□□□ -0.74
NISCH-213ENST00000489895 LCE6AA0A183 80 aa10.42□□□□□ -0.74
NISCH-213ENST00000489895 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa10.42□□□□□ -0.74
NISCH-213ENST00000489895 COL6A5A8TX70 2615 aa10.4□□□□□ -0.75
NISCH-213ENST00000489895 CHD6Q8TD26 2715 aa10.39□□□□□ -0.75
NISCH-213ENST00000489895 SPINT4Q6UDR6 99 aa10.38□□□□□ -0.75
NISCH-213ENST00000489895 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
NISCH-213ENST00000489895 AKAP13Q12802 2813 aa10.37□□□□□ -0.75
NISCH-213ENST00000489895 IGSF10Q6WRI0 2623 aa10.37□□□□□ -0.75
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