RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa7.58□□□□□ -1.2
PRAME-212ENST00000485532 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.57□□□□□ -1.2
PRAME-212ENST00000485532 NDUFC2O95298 119 aa7.57□□□□□ -1.2
PRAME-212ENST00000485532 IGKV2D-28P01615 120 aa7.57□□□□□ -1.2
PRAME-212ENST00000485532 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.56□□□□□ -1.2
PRAME-212ENST00000485532 M0R143 59 aa7.56□□□□□ -1.2
PRAME-212ENST00000485532 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.55□□□□□ -1.2
PRAME-212ENST00000485532 NCR3O14931 201 aa7.55□□□□□ -1.2
PRAME-212ENST00000485532 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.54□□□□□ -1.2
PRAME-212ENST00000485532 A6NJY4 79 aa7.54□□□□□ -1.2
PRAME-212ENST00000485532 CFC1BP0CG36 223 aa7.54□□□□□ -1.2
PRAME-212ENST00000485532 CFC1P0CG37 223 aa7.54□□□□□ -1.2
PRAME-212ENST00000485532 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.54□□□□□ -1.2
PRAME-212ENST00000485532 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7.53□□□□□ -1.2
PRAME-212ENST00000485532 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.53□□□□□ -1.2
PRAME-212ENST00000485532 C22orf24Q9Y442 160 aa7.53□□□□□ -1.2
PRAME-212ENST00000485532 A0A1B0GWB2 263 aa7.52□□□□□ -1.21
PRAME-212ENST00000485532 K7ERJ3 54 aa7.52□□□□□ -1.21
PRAME-212ENST00000485532 M0R378 163 aa7.52□□□□□ -1.21
PRAME-212ENST00000485532 BATFQ16520 125 aa7.52□□□□□ -1.21
PRAME-212ENST00000485532 SNHG12Q9BXW3 62 aa7.52□□□□□ -1.21
PRAME-212ENST00000485532 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PRAME-212ENST00000485532 A0A0B4J2C4 111 aa7.51□□□□□ -1.21
PRAME-212ENST00000485532 GAGE10A6NGK3 116 aa7.51□□□□□ -1.21
PRAME-212ENST00000485532 PRR4Q16378 134 aa7.51□□□□□ -1.21
PRAME-212ENST00000485532 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PRAME-212ENST00000485532 ZNF861PO60384 105 aa7.5□□□□□ -1.21
PRAME-212ENST00000485532 LINC00167Q96N53 147 aa7.5□□□□□ -1.21
PRAME-212ENST00000485532 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa7.49□□□□□ -1.21
PRAME-212ENST00000485532 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.49□□□□□ -1.21
PRAME-212ENST00000485532 A6NDN8 102 aa7.49□□□□□ -1.21
PRAME-212ENST00000485532 IGLV6-57P01721 117 aa7.49□□□□□ -1.21
PRAME-212ENST00000485532 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PRAME-212ENST00000485532 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.49□□□□□ -1.21
PRAME-212ENST00000485532 RAB37Q96AX2 223 aa7.49□□□□□ -1.21
PRAME-212ENST00000485532 TSPAN13O95857 204 aa7.48□□□□□ -1.21
PRAME-212ENST00000485532 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
PRAME-212ENST00000485532 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.48□□□□□ -1.21
PRAME-212ENST00000485532 A0A087X002 238 aa7.47□□□□□ -1.21
PRAME-212ENST00000485532 RPL37AP8A6NKH3 93 aa7.47□□□□□ -1.21
PRAME-212ENST00000485532 TMEM126AQ9H061 195 aa7.47□□□□□ -1.21
PRAME-212ENST00000485532 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.47□□□□□ -1.21
PRAME-212ENST00000485532 H7C2G1 150 aa7.45□□□□□ -1.22
PRAME-212ENST00000485532 ANAPC11Q9NYG5 84 aa7.45□□□□□ -1.22
PRAME-212ENST00000485532 BCE1O60756 84 aa7.44□□□□□ -1.22
PRAME-212ENST00000485532 SMIM11BQ8TCY0 68 aa7.44□□□□□ -1.22
PRAME-212ENST00000485532 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.44□□□□□ -1.22
PRAME-212ENST00000485532 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7.43□□□□□ -1.22
PRAME-212ENST00000485532 PRYO14603 147 aa7.43□□□□□ -1.22
PRAME-212ENST00000485532 TAX1BP3O14907 124 aa7.42□□□□□ -1.22
PRAME-212ENST00000485532 RPL28P46779 137 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
PRAME-212ENST00000485532 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa7.42□□□□□ -1.22
PRAME-212ENST00000485532 MUC2Q02817 5179 aa7.42□□□□□ -1.22
PRAME-212ENST00000485532 SPRR1AP35321 89 aa7.41□□□□□ -1.22
PRAME-212ENST00000485532 Q1RN00 199 aa7.41□□□□□ -1.22
PRAME-212ENST00000485532 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.41□□□□□ -1.22
PRAME-212ENST00000485532 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PRAME-212ENST00000485532 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PRAME-212ENST00000485532 CRYGAP11844 174 aa7.4□□□□□ -1.22
PRAME-212ENST00000485532 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa7.4□□□□□ -1.22
PRAME-212ENST00000485532 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PRAME-212ENST00000485532 CBY1Q9Y3M2 126 aa7.4□□□□□ -1.22
PRAME-212ENST00000485532 C6orf99Q4VX62 202 aa7.39□□□□□ -1.23
PRAME-212ENST00000485532 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa7.39□□□□□ -1.23
PRAME-212ENST00000485532 TRIAP1O43715 76 aa7.38□□□□□ -1.23
PRAME-212ENST00000485532 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.38□□□□□ -1.23
PRAME-212ENST00000485532 C9orf118A6NHY6 69 aa7.37□□□□□ -1.23
PRAME-212ENST00000485532 UBE2AP49459 152 aa7.37□□□□□ -1.23
PRAME-212ENST00000485532 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.36□□□□□ -1.23
PRAME-212ENST00000485532 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.36□□□□□ -1.23
PRAME-212ENST00000485532 H3BUT2 72 aa7.36□□□□□ -1.23
PRAME-212ENST00000485532 PSMB2P49721 201 aa7.36□□□□□ -1.23
PRAME-212ENST00000485532 B5MCH6 92 aa7.35□□□□□ -1.23
PRAME-212ENST00000485532 COX7BP24311 80 aa7.35□□□□□ -1.23
PRAME-212ENST00000485532 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PRAME-212ENST00000485532 PRLHP81277 87 aa7.35□□□□□ -1.23
PRAME-212ENST00000485532 Q6ZRX8 168 aa7.34□□□□□ -1.23
PRAME-212ENST00000485532 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa7.34□□□□□ -1.23
PRAME-212ENST00000485532 VAMP3Q15836 100 aa7.33□□□□□ -1.24
PRAME-212ENST00000485532 A0A1W2PPM0 123 aa7.32□□□□□ -1.24
PRAME-212ENST00000485532 H0YGX0 51 aa7.32□□□□□ -1.24
PRAME-212ENST00000485532 CLEC2BQ92478 149 aa7.32□□□□□ -1.24
PRAME-212ENST00000485532 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.32□□□□□ -1.24
PRAME-212ENST00000485532 Q9BRP9 147 aa7.32□□□□□ -1.24
PRAME-212ENST00000485532 COX6CP09669 75 aa7.31□□□□□ -1.24
PRAME-212ENST00000485532 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.31□□□□□ -1.24
PRAME-212ENST00000485532 FAM229BQ4G0N7 80 aa7.31□□□□□ -1.24
PRAME-212ENST00000485532 LINC00575Q6W349 94 aa7.31□□□□□ -1.24
PRAME-212ENST00000485532 LINC00304Q8N9R0 145 aa7.31□□□□□ -1.24
PRAME-212ENST00000485532 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.3□□□□□ -1.24
PRAME-212ENST00000485532 TCL1BO95988 128 aa7.29□□□□□ -1.24
PRAME-212ENST00000485532 FABP2P12104 132 aa7.29□□□□□ -1.24
PRAME-212ENST00000485532 C3orf22Q8N5N4 141 aa7.29□□□□□ -1.24
PRAME-212ENST00000485532 ERC2-IT1O76042 136 aa7.28□□□□□ -1.24
PRAME-212ENST00000485532 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.28□□□□□ -1.24
PRAME-212ENST00000485532 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.28□□□□□ -1.24
PRAME-212ENST00000485532 A0A0U1RQV1 116 aa7.27□□□□□ -1.25
PRAME-212ENST00000485532 LST1O00453 97 aa7.27□□□□□ -1.25
PRAME-212ENST00000485532 HIGD2AQ9BW72 106 aa7.27□□□□□ -1.25
PRAME-212ENST00000485532 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
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