RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 KIAA0087Q14695 138 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGEF1-205ENST00000450873 Q5XG85 94 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGEF1-205ENST00000450873 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGEF1-205ENST00000450873 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGEF1-205ENST00000450873 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGEF1-205ENST00000450873 NDUFA1O15239 70 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGEF1-205ENST00000450873 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGEF1-205ENST00000450873 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-205ENST00000450873 Q6ZRU5 148 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-205ENST00000450873 Q8IZM0 81 aa6.82□□□□□ -1.32
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RABGEF1-205ENST00000450873 hADV29S1A0JD25 119 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-205ENST00000450873 C4orf26Q17RF5 130 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-205ENST00000450873 TIMM17BO60830 172 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-205ENST00000450873 SERP2Q8N6R1 65 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-205ENST00000450873 INAFM2P0DMQ5 153 aa6.8□□□□□ -1.32
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RABGEF1-205ENST00000450873 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.8□□□□□ -1.32
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RABGEF1-205ENST00000450873 COX7B2Q8TF08 81 aa6.8□□□□□ -1.32
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RABGEF1-205ENST00000450873 C10orf25Q5T742 122 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGEF1-205ENST00000450873 Q5VSD8 79 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGEF1-205ENST00000450873 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGEF1-205ENST00000450873 NDUFC2O95298 119 aa6.78□□□□□ -1.32
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RABGEF1-205ENST00000450873 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-205ENST00000450873 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-205ENST00000450873 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
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RABGEF1-205ENST00000450873 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.76□□□□□ -1.33
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RABGEF1-205ENST00000450873 DSCR8Q96T75 97 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-205ENST00000450873 FAT1Q14517 4588 aa6.76□□□□□ -1.33
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RABGEF1-205ENST00000450873 NPC2P61916 151 aa6.75□□□□□ -1.33
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RABGEF1-205ENST00000450873 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.75□□□□□ -1.33
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RABGEF1-205ENST00000450873 OXTP01178 125 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-205ENST00000450873 COPS9Q8WXC6 57 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM229AH3BQW9 127 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-205ENST00000450873 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-205ENST00000450873 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
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RABGEF1-205ENST00000450873 Q6ZRP5 223 aa6.73□□□□□ -1.33
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RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
RABGEF1-205ENST00000450873 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.71□□□□□ -1.33
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RABGEF1-205ENST00000450873 COX17Q14061 63 aa6.7□□□□□ -1.34
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RABGEF1-205ENST00000450873 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM236CP0DP71 79 aa6.69□□□□□ -1.34
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RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-205ENST00000450873 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-205ENST00000450873 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1-205ENST00000450873 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.62□□□□□ -1.35
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