RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428450.5

DDX39B-209, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 4

Gene DDX39B, Length 633 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-209ENST00000428450 Q8NBF4 154 aa6.29□□□□□ -1.4
DDX39B-209ENST00000428450 PCOTHQ58A44 107 aa6.28□□□□□ -1.4
DDX39B-209ENST00000428450 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.28□□□□□ -1.4
DDX39B-209ENST00000428450 ORMDL3Q8N138 153 aa6.28□□□□□ -1.4
DDX39B-209ENST00000428450 C20orf78Q9BR46 151 aa6.28□□□□□ -1.4
DDX39B-209ENST00000428450 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.27□□□□□ -1.41
DDX39B-209ENST00000428450 F8VRH5 84 aa6.27□□□□□ -1.41
DDX39B-209ENST00000428450 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.27□□□□□ -1.41
DDX39B-209ENST00000428450 VCX2Q9H322 139 aa6.27□□□□□ -1.41
DDX39B-209ENST00000428450 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
DDX39B-209ENST00000428450 ATP5LO75964 103 aa6.26□□□□□ -1.41
DDX39B-209ENST00000428450 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
DDX39B-209ENST00000428450 Q8N377 158 aa6.26□□□□□ -1.41
DDX39B-209ENST00000428450 PRELID3AQ96N28 172 aa6.26□□□□□ -1.41
DDX39B-209ENST00000428450 SPRR4Q96PI1 79 aa6.26□□□□□ -1.41
DDX39B-209ENST00000428450 TMEM126AQ9H061 195 aa6.26□□□□□ -1.41
DDX39B-209ENST00000428450 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
DDX39B-209ENST00000428450 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
DDX39B-209ENST00000428450 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.26□□□□□ -1.41
DDX39B-209ENST00000428450 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.26□□□□□ -1.41
DDX39B-209ENST00000428450 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
DDX39B-209ENST00000428450 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.25□□□□□ -1.41
DDX39B-209ENST00000428450 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.25□□□□□ -1.41
DDX39B-209ENST00000428450 M0R378 163 aa6.24□□□□□ -1.41
DDX39B-209ENST00000428450 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
DDX39B-209ENST00000428450 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.24□□□□□ -1.41
DDX39B-209ENST00000428450 CEND1Q8N111 149 aa6.24□□□□□ -1.41
DDX39B-209ENST00000428450 PRO0461Q9UI25 63 aa6.24□□□□□ -1.41
DDX39B-209ENST00000428450 K7EMI3 77 aa6.23□□□□□ -1.41
DDX39B-209ENST00000428450 TMEM141Q96I45 108 aa6.23□□□□□ -1.41
DDX39B-209ENST00000428450 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.22□□□□□ -1.41
DDX39B-209ENST00000428450 D6R8Y8 96 aa6.22□□□□□ -1.41
DDX39B-209ENST00000428450 H3BMG7 143 aa6.22□□□□□ -1.41
DDX39B-209ENST00000428450 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
DDX39B-209ENST00000428450 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.22□□□□□ -1.41
DDX39B-209ENST00000428450 DPM2O94777 84 aa6.21□□□□□ -1.42
DDX39B-209ENST00000428450 IGKCP01834 107 aa6.21□□□□□ -1.42
DDX39B-209ENST00000428450 CKS2P33552 79 aa6.21□□□□□ -1.42
DDX39B-209ENST00000428450 FXYD2P54710 66 aa6.21□□□□□ -1.42
DDX39B-209ENST00000428450 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.21□□□□□ -1.42
DDX39B-209ENST00000428450 PCP2Q8IVA1 136 aa6.21□□□□□ -1.42
DDX39B-209ENST00000428450 Q8N8P6 123 aa6.21□□□□□ -1.42
DDX39B-209ENST00000428450 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.21□□□□□ -1.42
DDX39B-209ENST00000428450 LINC01549A6NIU2 74 aa6.2□□□□□ -1.42
DDX39B-209ENST00000428450 SLC25A20O43772 301 aa6.2□□□□□ -1.42
DDX39B-209ENST00000428450 CXCL5P42830 114 aa6.2□□□□□ -1.42
DDX39B-209ENST00000428450 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
DDX39B-209ENST00000428450 AMELXQ99217 191 aa6.2□□□□□ -1.42
DDX39B-209ENST00000428450 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.2□□□□□ -1.42
DDX39B-209ENST00000428450 NPYP01303 97 aa6.19□□□□□ -1.42
DDX39B-209ENST00000428450 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.19□□□□□ -1.42
DDX39B-209ENST00000428450 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.19□□□□□ -1.42
DDX39B-209ENST00000428450 CYSLTR1Q9Y271 337 aa6.19□□□□□ -1.42
DDX39B-209ENST00000428450 PLNP26678 52 aa6.18□□□□□ -1.42
DDX39B-209ENST00000428450 NMUP48645 174 aa6.18□□□□□ -1.42
DDX39B-209ENST00000428450 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6.18□□□□□ -1.42
DDX39B-209ENST00000428450 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.18□□□□□ -1.42
DDX39B-209ENST00000428450 RAB37Q96AX2 223 aa6.18□□□□□ -1.42
DDX39B-209ENST00000428450 VPREB1P12018 145 aa6.17□□□□□ -1.42
DDX39B-209ENST00000428450 A6NJY4 79 aa6.16□□□□□ -1.42
DDX39B-209ENST00000428450 H0Y8G0 127 aa6.16□□□□□ -1.42
DDX39B-209ENST00000428450 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
DDX39B-209ENST00000428450 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
DDX39B-209ENST00000428450 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.15□□□□□ -1.42
DDX39B-209ENST00000428450 HERVK_113P63121 156 aa6.15□□□□□ -1.42
DDX39B-209ENST00000428450 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.15□□□□□ -1.42
DDX39B-209ENST00000428450 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
DDX39B-209ENST00000428450 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa6.14□□□□□ -1.43
DDX39B-209ENST00000428450 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.14□□□□□ -1.43
DDX39B-209ENST00000428450 ETDBQ3ZM63 59 aa6.14□□□□□ -1.43
DDX39B-209ENST00000428450 Q6Q795 121 aa6.14□□□□□ -1.43
DDX39B-209ENST00000428450 Q8NDZ9 215 aa6.14□□□□□ -1.43
DDX39B-209ENST00000428450 COX7B2Q8TF08 81 aa6.14□□□□□ -1.43
DDX39B-209ENST00000428450 PPDPFLQ8WWR9 84 aa6.14□□□□□ -1.43
DDX39B-209ENST00000428450 CFC1P0CG37 223 aa6.13□□□□□ -1.43
DDX39B-209ENST00000428450 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.13□□□□□ -1.43
DDX39B-209ENST00000428450 LINC00483Q53H64 154 aa6.13□□□□□ -1.43
DDX39B-209ENST00000428450 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.13□□□□□ -1.43
DDX39B-209ENST00000428450 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.13□□□□□ -1.43
DDX39B-209ENST00000428450 TEN1Q86WV5 123 aa6.13□□□□□ -1.43
DDX39B-209ENST00000428450 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
DDX39B-209ENST00000428450 ERG28Q9UKR5 140 aa6.13□□□□□ -1.43
DDX39B-209ENST00000428450 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.12□□□□□ -1.43
DDX39B-209ENST00000428450 IGIPA6NJ69 53 aa6.12□□□□□ -1.43
DDX39B-209ENST00000428450 MOBPQ13875 183 aa6.12□□□□□ -1.43
DDX39B-209ENST00000428450 C9orf92A6NGG3 77 aa6.11□□□□□ -1.43
DDX39B-209ENST00000428450 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
DDX39B-209ENST00000428450 TOMM6Q96B49 74 aa6.11□□□□□ -1.43
DDX39B-209ENST00000428450 HIST1H4GQ99525 98 aa6.11□□□□□ -1.43
DDX39B-209ENST00000428450 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.11□□□□□ -1.43
DDX39B-209ENST00000428450 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.1□□□□□ -1.43
DDX39B-209ENST00000428450 K7ERJ3 54 aa6.1□□□□□ -1.43
DDX39B-209ENST00000428450 SPINK8P0C7L1 97 aa6.1□□□□□ -1.43
DDX39B-209ENST00000428450 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.1□□□□□ -1.43
DDX39B-209ENST00000428450 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.1□□□□□ -1.43
DDX39B-209ENST00000428450 PFN2P35080 140 aa6.09□□□□□ -1.43
DDX39B-209ENST00000428450 LCE2BO14633 110 aa6.08□□□□□ -1.44
DDX39B-209ENST00000428450 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.08□□□□□ -1.44
DDX39B-209ENST00000428450 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.07□□□□□ -1.44
DDX39B-209ENST00000428450 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.07□□□□□ -1.44
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