RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415548.1

CCT3-208, Transcript of chaperonin containing TCP1 subunit 3, human

TSL 3

Gene CCT3, Length 513 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCT3-208	ENST00000415548	S100A1	P23297	94 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCT3-208	ENST00000415548	DDT	P30046	118 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCT3-208	ENST00000415548	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCT3-208	ENST00000415548	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCT3-208	ENST00000415548	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CCT3-208	ENST00000415548	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCT3-208	ENST00000415548	ZNF815P	A8K554	130 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCT3-208	ENST00000415548	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCT3-208	ENST00000415548	NDUFC2	O95298	119 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCT3-208	ENST00000415548	TSPAN13	O95857	204 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCT3-208	ENST00000415548	LITAF	Q99732	161 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCT3-208	ENST00000415548	C20orf202	A1L168	122 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCT3-208	ENST00000415548	S100A12	P80511	92 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCT3-208	ENST00000415548	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCT3-208	ENST00000415548	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCT3-208	ENST00000415548	ATOH7	Q8N100	152 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCT3-208	ENST00000415548	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCT3-208	ENST00000415548	SPRR4	Q96PI1	79 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCT3-208	ENST00000415548		B5MCH6	92 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCT3-208	ENST00000415548	TIMM17B	O60830	172 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCT3-208	ENST00000415548	IGLV6-57	P01721	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCT3-208	ENST00000415548	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCT3-208	ENST00000415548	PRR4	Q16378	134 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCT3-208	ENST00000415548	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCT3-208	ENST00000415548	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCT3-208	ENST00000415548	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCT3-208	ENST00000415548	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCT3-208	ENST00000415548	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCT3-208	ENST00000415548	ERC2-IT1	O76042	136 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCT3-208	ENST00000415548	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCT3-208	ENST00000415548		Q9BRP9	147 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCT3-208	ENST00000415548	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCT3-208	ENST00000415548	SPANXC	Q9NY87	97 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCT3-208	ENST00000415548	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CCT3-208	ENST00000415548	S100A2	P29034	98 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCT3-208	ENST00000415548	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCT3-208	ENST00000415548		Q6ZRX8	168 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCT3-208	ENST00000415548	PCP2	Q8IVA1	136 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCT3-208	ENST00000415548	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCT3-208	ENST00000415548	AKR1D1	P51857	326 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCT3-208	ENST00000415548	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCT3-208	ENST00000415548	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCT3-208	ENST00000415548	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCT3-208	ENST00000415548	S100A6	P06703	90 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCT3-208	ENST00000415548	LINC00483	Q53H64	154 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCT3-208	ENST00000415548	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCT3-208	ENST00000415548	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CCT3-208	ENST00000415548	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CCT3-208	ENST00000415548	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCT3-208	ENST00000415548	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CCT3-208	ENST00000415548	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCT3-208	ENST00000415548	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCT3-208	ENST00000415548	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCT3-208	ENST00000415548		Q8NBF4	154 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCT3-208	ENST00000415548	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCT3-208	ENST00000415548	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CCT3-208	ENST00000415548	IFITM1	P13164	125 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CCT3-208	ENST00000415548	MOBP	Q13875	183 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CCT3-208	ENST00000415548	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CCT3-208	ENST00000415548		Q6ZVH6	145 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CCT3-208	ENST00000415548	COPS9	Q8WXC6	57 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CCT3-208	ENST00000415548	MUC17	Q685J3	4493 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCT3-208	ENST00000415548	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCT3-208	ENST00000415548	C6orf99	Q4VX62	202 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCT3-208	ENST00000415548		A6NDN8	102 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCT3-208	ENST00000415548	C5orf52	A6NGY3	159 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCT3-208	ENST00000415548	SCGB1D1	O95968	90 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCT3-208	ENST00000415548	COX7B	P24311	80 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCT3-208	ENST00000415548	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CCT3-208	ENST00000415548	CTAG1A	P78358	180 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCT3-208	ENST00000415548	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCT3-208	ENST00000415548	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CCT3-208	ENST00000415548	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CCT3-208	ENST00000415548	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CCT3-208	ENST00000415548	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCT3-208	ENST00000415548	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCT3-208	ENST00000415548	SPINK1	P00995	79 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCT3-208	ENST00000415548	SPRR1B	P22528	89 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CCT3-208	ENST00000415548	MUC2	Q02817	5179 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCT3-208	ENST00000415548		A0A1B0GWB2	263 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCT3-208	ENST00000415548		A4D1N5	150 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCT3-208	ENST00000415548	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCT3-208	ENST00000415548	COX8A	P10176	69 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CCT3-208	ENST00000415548	TAL2	Q16559	108 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CCT3-208	ENST00000415548	TPRXL	Q17RH7	258 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CCT3-208	ENST00000415548	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CCT3-208	ENST00000415548	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CCT3-208	ENST00000415548	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CCT3-208	ENST00000415548	CDIP1	Q9H305	208 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CCT3-208	ENST00000415548	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CCT3-208	ENST00000415548	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CCT3-208	ENST00000415548	DLEU1	O43261	78 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CCT3-208	ENST00000415548	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CCT3-208	ENST00000415548	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CCT3-208	ENST00000415548		Q1RN00	199 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CCT3-208	ENST00000415548		Q8N377	158 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CCT3-208	ENST00000415548	C14orf144	Q96I85	54 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CCT3-208	ENST00000415548	HIST1H4G	Q99525	98 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CCT3-208	ENST00000415548	C12orf57	Q99622	126 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CCT3-208	ENST00000415548	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		4.73	□□□□□ -1.65

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