RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295874.14

PTPRG-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRG, Length 4,650 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-201ENST00000295874 CRIPTQ9P021 101 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRG-201ENST00000295874 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRG-201ENST00000295874 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRG-201ENST00000295874 PRR3P79522 188 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRG-201ENST00000295874 FAM218AQ96MZ4 157 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRG-201ENST00000295874 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRG-201ENST00000295874 SMCR5Q8TEV8 140 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRG-201ENST00000295874 SPATA3Q8NHX4 192 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRG-201ENST00000295874 COX6B2Q6YFQ2 88 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRG-201ENST00000295874 SPACA4Q8TDM5 124 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRG-201ENST00000295874 SMIM29Q86T20 159 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRG-201ENST00000295874 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRG-201ENST00000295874 FAM104AQ969W3 186 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRG-201ENST00000295874 CENPEQ02224 2701 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRG-201ENST00000295874 LINC01600Q96MT4 127 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRG-201ENST00000295874 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRG-201ENST00000295874 TRAV22A0A0B4J277 110 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRG-201ENST00000295874 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRG-201ENST00000295874 UQCR11O14957 56 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRG-201ENST00000295874 Q6ZRP5 223 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRG-201ENST00000295874 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRG-201ENST00000295874 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRG-201ENST00000295874 C19orf73Q9NVV2 129 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRG-201ENST00000295874 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRG-201ENST00000295874 NOTCH1P46531 2555 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRG-201ENST00000295874 DMDP11532 3685 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRG-201ENST00000295874 TYMSOSQ8TAI1 123 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRG-201ENST00000295874 C22orf24Q9Y442 160 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRG-201ENST00000295874 LUZP6Q538Z0 58 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRG-201ENST00000295874 H3BNG1 76 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRG-201ENST00000295874 KIAA0087Q14695 138 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRG-201ENST00000295874 Q6ZRU5 148 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRG-201ENST00000295874 LOC400499M0QZD8 3231 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRG-201ENST00000295874 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRG-201ENST00000295874 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRG-201ENST00000295874 RTL8CO15255 209 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRG-201ENST00000295874 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRG-201ENST00000295874 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRG-201ENST00000295874 LINC00313P59037 77 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRG-201ENST00000295874 MOBPQ13875 183 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRG-201ENST00000295874 C4orf26Q17RF5 130 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRG-201ENST00000295874 LINC00612Q8N6U2 182 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRG-201ENST00000295874 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRG-201ENST00000295874 Q8NBF4 154 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRG-201ENST00000295874 LRBAP50851 2863 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRG-201ENST00000295874 KALRNO60229 2985 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRG-201ENST00000295874 LINC01554Q52M75 96 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRG-201ENST00000295874 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRG-201ENST00000295874 DMXL1Q9Y485 3027 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRG-201ENST00000295874 TACC2O95359 2948 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRG-201ENST00000295874 BAHCC1Q9P281 2608 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRG-201ENST00000295874 Q8NAQ8 132 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRG-201ENST00000295874 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRG-201ENST00000295874 CD164Q04900 197 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRG-201ENST00000295874 CR1P17927 2039 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRG-201ENST00000295874 ATMQ13315 3056 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRG-201ENST00000295874 APLNQ9ULZ1 77 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRG-201ENST00000295874 LINC00336Q6ZUF6 198 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRG-201ENST00000295874 ITPR3Q14573 2671 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRG-201ENST00000295874 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRG-201ENST00000295874 LINC00167Q96N53 147 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRG-201ENST00000295874 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.08
PTPRG-201ENST00000295874 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.08
PTPRG-201ENST00000295874 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.08
PTPRG-201ENST00000295874 KRTAP1-1Q07627 177 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRG-201ENST00000295874 IGSF10Q6WRI0 2623 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRG-201ENST00000295874 A8MUN3 132 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRG-201ENST00000295874 EPM2AB3EWF7 344 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRG-201ENST00000295874 MIR22HGQ0VDD5 57 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRG-201ENST00000295874 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
PTPRG-201ENST00000295874 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRG-201ENST00000295874 Q6ZQT0 140 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRG-201ENST00000295874 LINC00476Q8WZB0 136 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRG-201ENST00000295874 IGLV6-57P01721 117 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRG-201ENST00000295874 LCA10Q71F78 164 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRG-201ENST00000295874 DCHS1Q96JQ0 3298 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRG-201ENST00000295874 ZZEF1O43149 2961 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRG-201ENST00000295874 ERC2-IT1O76042 136 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRG-201ENST00000295874 KRTAP10-3P60369 221 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRG-201ENST00000295874 PRR34Q9NV39 138 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRG-201ENST00000295874 FLNCQ14315 2725 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRG-201ENST00000295874 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRG-201ENST00000295874 COA5Q86WW8 74 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRG-201ENST00000295874 Q96NJ1 140 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRG-201ENST00000295874 LINC00588Q9Y4M8 146 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRG-201ENST00000295874 TM2D3Q9BRN9 247 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRG-201ENST00000295874 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
PTPRG-201ENST00000295874 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
PTPRG-201ENST00000295874 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRG-201ENST00000295874 Q6ZRX8 168 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRG-201ENST00000295874 CFAP46Q8IYW2 2715 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRG-201ENST00000295874 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRG-201ENST00000295874 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRG-201ENST00000295874 A8MWP4 228 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRG-201ENST00000295874 ZFHX4Q86UP3 3567 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRG-201ENST00000295874 CHD6Q8TD26 2715 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRG-201ENST00000295874 K7EIL1 84 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRG-201ENST00000295874 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRG-201ENST00000295874 TEX15Q9BXT5 2789 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRG-201ENST00000295874 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa8.15□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.1 ms