RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614459.4

MDM4-215, Transcript of MDM4, p53 regulator, human

TSL 5 BASIC

Gene MDM4, Length 9,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM4-215	ENST00000614459	CDSN	Q15517	529 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM4-215	ENST00000614459	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM4-215	ENST00000614459	SMR3A	Q99954	134 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM4-215	ENST00000614459	FSHB	P01225	129 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM4-215	ENST00000614459	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM4-215	ENST00000614459	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MDM4-215	ENST00000614459	PRR9	Q5T870	116 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MDM4-215	ENST00000614459	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MDM4-215	ENST00000614459	LY6G6C	O95867	125 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MDM4-215	ENST00000614459	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MDM4-215	ENST00000614459	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MDM4-215	ENST00000614459	LINC00483	Q53H64	154 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM4-215	ENST00000614459		Q6ZRP5	223 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM4-215	ENST00000614459	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM4-215	ENST00000614459	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM4-215	ENST00000614459	NUPR2	A6NF83	97 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM4-215	ENST00000614459	LMO4	P61968	165 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM4-215	ENST00000614459	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM4-215	ENST00000614459		A0A087X002	238 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM4-215	ENST00000614459	SPINK1	P00995	79 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM4-215	ENST00000614459	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM4-215	ENST00000614459		M0R2N4	97 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM4-215	ENST00000614459	TTC28	Q96AY4	2481 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM4-215	ENST00000614459	IGLV6-57	P01721	117 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM4-215	ENST00000614459		H3BNG1	76 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM4-215	ENST00000614459		Q6ZPA2	131 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM4-215	ENST00000614459	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM4-215	ENST00000614459	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MDM4-215	ENST00000614459	LINC00167	Q96N53	147 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM4-215	ENST00000614459		X6R8D5	127 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM4-215	ENST00000614459	COX6A2	Q02221	97 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM4-215	ENST00000614459	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM4-215	ENST00000614459	IGKV2-30	P06310	120 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM4-215	ENST00000614459		A0A096LNI7	61 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM4-215	ENST00000614459	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM4-215	ENST00000614459	DEFB1	P60022	68 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM4-215	ENST00000614459	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM4-215	ENST00000614459	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM4-215	ENST00000614459	LRRK2	Q5S007	2527 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM4-215	ENST00000614459	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MDM4-215	ENST00000614459	IGLV7-43	P04211	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM4-215	ENST00000614459	KIAA0087	Q14695	138 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM4-215	ENST00000614459	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM4-215	ENST00000614459	LINC00313	P59037	77 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM4-215	ENST00000614459	KRTAP10-9	P60411	292 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM4-215	ENST00000614459	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		4.96	□□□□□ -1.61
MDM4-215	ENST00000614459	MRPL34	Q9BQ48	92 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MDM4-215	ENST00000614459	FAM104A	Q969W3	186 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM4-215	ENST00000614459	GAS8-AS1	O95177	125 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MDM4-215	ENST00000614459	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MDM4-215	ENST00000614459	LITAF	Q99732	161 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MDM4-215	ENST00000614459	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MDM4-215	ENST00000614459	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MDM4-215	ENST00000614459	LINC01006	Q8NI28	216 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MDM4-215	ENST00000614459	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MDM4-215	ENST00000614459	FHL3	Q13643	280 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MDM4-215	ENST00000614459	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MDM4-215	ENST00000614459	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MDM4-215	ENST00000614459	C22orf24	Q9Y442	160 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MDM4-215	ENST00000614459	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MDM4-215	ENST00000614459	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MDM4-215	ENST00000614459	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM4-215	ENST00000614459	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM4-215	ENST00000614459	PROK1	P58294	105 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM4-215	ENST00000614459		Q5XG85	94 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM4-215	ENST00000614459	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM4-215	ENST00000614459	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM4-215	ENST00000614459	TNP2	Q05952	138 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM4-215	ENST00000614459	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM4-215	ENST00000614459		A0A1B0GVX0	72 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM4-215	ENST00000614459	C8orf17	Q9NRJ1	99 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM4-215	ENST00000614459	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM4-215	ENST00000614459	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MDM4-215	ENST00000614459		K7EQZ3	153 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM4-215	ENST00000614459	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM4-215	ENST00000614459	C16orf90	A8MZG2	172 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM4-215	ENST00000614459	OCR1	Q9BZK8	76 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM4-215	ENST00000614459	IGLV1-51	P01701	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM4-215	ENST00000614459	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM4-215	ENST00000614459	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MDM4-215	ENST00000614459	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM4-215	ENST00000614459	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM4-215	ENST00000614459	C15orf56	Q8N910	161 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM4-215	ENST00000614459	KLK9	Q2XQG4	91 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM4-215	ENST00000614459	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM4-215	ENST00000614459	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM4-215	ENST00000614459	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM4-215	ENST00000614459	LINC00315	P59091	139 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM4-215	ENST00000614459	ACAN	P16112	2415 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM4-215	ENST00000614459	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM4-215	ENST00000614459	C16orf95	Q9H693	158 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM4-215	ENST00000614459	COL4A2	P08572	1712 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM4-215	ENST00000614459	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MDM4-215	ENST00000614459	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM4-215	ENST00000614459	NOTCH2	Q04721	2471 aa		4.84	□□□□□ -1.64
MDM4-215	ENST00000614459	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		4.84	□□□□□ -1.64
MDM4-215	ENST00000614459	APLN	Q9ULZ1	77 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM4-215	ENST00000614459	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MDM4-215	ENST00000614459	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM4-215	ENST00000614459	DEFB116	Q30KQ4	102 aa		4.82	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.6 ms