RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 CHD8Q9HCK8 2581 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRT-209ENST00000612229 LINC01554Q52M75 96 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRT-209ENST00000612229 Q8NBF4 154 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRT-209ENST00000612229 LINC00483Q53H64 154 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRT-209ENST00000612229 SMIM29Q86T20 159 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRT-209ENST00000612229 PRR15Q8IV56 129 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRT-209ENST00000612229 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRT-209ENST00000612229 A0A096LNJ9 63 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRT-209ENST00000612229 LINC01556Q5JQF7 62 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRT-209ENST00000612229 C1orf134Q5TEV5 83 aa4.96□□□□□ -1.61
PTPRT-209ENST00000612229 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa4.96□□□□□ -1.61
PTPRT-209ENST00000612229 C4orf26Q17RF5 130 aa4.96□□□□□ -1.61
PTPRT-209ENST00000612229 POLQO75417 2590 aa4.96□□□□□ -1.61
PTPRT-209ENST00000612229 H3BNG1 76 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRT-209ENST00000612229 EPM2AB3EWF7 344 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRT-209ENST00000612229 MTORP42345 2549 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRT-209ENST00000612229 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRT-209ENST00000612229 LINC01600Q96MT4 127 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRT-209ENST00000612229 Q6ZSV7 163 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRT-209ENST00000612229 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRT-209ENST00000612229 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRT-209ENST00000612229 PRR3P79522 188 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRT-209ENST00000612229 CR1P17927 2039 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRT-209ENST00000612229 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRT-209ENST00000612229 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRT-209ENST00000612229 PRO0461Q9UI25 63 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRT-209ENST00000612229 MIR22HGQ0VDD5 57 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRT-209ENST00000612229 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRT-209ENST00000612229 FHL2Q14192 279 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRT-209ENST00000612229 Q6ZRX8 168 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRT-209ENST00000612229 A8MWP4 228 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRT-209ENST00000612229 BPTFQ12830 3046 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRT-209ENST00000612229 USP24Q9UPU5 2620 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRT-209ENST00000612229 IGLV1-51P01701 117 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRT-209ENST00000612229 KLKP1Q107X0 134 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRT-209ENST00000612229 LCA10Q71F78 164 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRT-209ENST00000612229 SPATA3Q8NHX4 192 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRT-209ENST00000612229 C10orf99Q6UWK7 81 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRT-209ENST00000612229 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRT-209ENST00000612229 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRT-209ENST00000612229 M0R2N4 97 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRT-209ENST00000612229 Q6ZQT0 140 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRT-209ENST00000612229 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRT-209ENST00000612229 MDFIQ99750 246 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRT-209ENST00000612229 Q6ZRP5 223 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRT-209ENST00000612229 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRT-209ENST00000612229 LINC01006Q8NI28 216 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRT-209ENST00000612229 C16orf90A8MZG2 172 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRT-209ENST00000612229 A0A0A0MQY5 61 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRT-209ENST00000612229 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRT-209ENST00000612229 CEP295Q9C0D2 2601 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRT-209ENST00000612229 INAFM1C9JVW0 142 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRT-209ENST00000612229 ODF3L2Q3SX64 289 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRT-209ENST00000612229 C18orf65Q6ZTR6 163 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRT-209ENST00000612229 COA5Q86WW8 74 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRT-209ENST00000612229 SPACA4Q8TDM5 124 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRT-209ENST00000612229 C16orf95Q9H693 158 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRT-209ENST00000612229 WISP2O76076 250 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRT-209ENST00000612229 PRO3102Q9H379 93 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRT-209ENST00000612229 LYPD5Q6UWN5 251 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRT-209ENST00000612229 Q6ZSN1 163 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRT-209ENST00000612229 C22orf24Q9Y442 160 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRT-209ENST00000612229 A8MTW9 85 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRT-209ENST00000612229 C19orf84I3L1E1 186 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRT-209ENST00000612229 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRT-209ENST00000612229 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRT-209ENST00000612229 A8MUN3 132 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRT-209ENST00000612229 TYMSOSQ8TAI1 123 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRT-209ENST00000612229 DEFB116Q30KQ4 102 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRT-209ENST00000612229 APLNQ9ULZ1 77 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRT-209ENST00000612229 SMCR5Q8TEV8 140 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRT-209ENST00000612229 C8orf17Q9NRJ1 99 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRT-209ENST00000612229 Q9UF83 564 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRT-209ENST00000612229 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRT-209ENST00000612229 LINC00476Q8WZB0 136 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRT-209ENST00000612229 FAM19A4Q96LR4 140 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRT-209ENST00000612229 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.64
PTPRT-209ENST00000612229 TM2D3Q9BRN9 247 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRT-209ENST00000612229 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRT-209ENST00000612229 FAM218AQ96MZ4 157 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRT-209ENST00000612229 AVPP01185 164 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRT-209ENST00000612229 FHL3Q13643 280 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRT-209ENST00000612229 Q96NJ1 140 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRT-209ENST00000612229 Q6ZRU5 148 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRT-209ENST00000612229 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRT-209ENST00000612229 COX6B2Q6YFQ2 88 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRT-209ENST00000612229 Q1T7F1 81 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRT-209ENST00000612229 COL4A2P08572 1712 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRT-209ENST00000612229 FASNP49327 2511 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
PTPRT-209ENST00000612229 DMAC1Q96GE9 116 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRT-209ENST00000612229 CENPFP49454 3210 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRT-209ENST00000612229 IGLV6-57P01721 117 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRT-209ENST00000612229 LINC00315P59091 139 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRT-209ENST00000612229 LINC00167Q96N53 147 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRT-209ENST00000612229 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
PTPRT-209ENST00000612229 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRT-209ENST00000612229 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRT-209ENST00000612229 CHTF8P0CG12 524 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRT-209ENST00000612229 LINC00336Q6ZUF6 198 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRT-209ENST00000612229 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.3 ms