RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611766.4

STAG3L2-202, Transcript of stromal antigen 3-like 2 (pseudogene), humanhuman

TSL 2

Gene STAG3L2, Length 1,047 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3L2-202ENST00000611766 PCP2Q8IVA1 136 aa6.53□□□□□ -1.36
STAG3L2-202ENST00000611766 ZNF815PA8K554 130 aa6.52□□□□□ -1.37
STAG3L2-202ENST00000611766 COX7A2LO14548 114 aa6.52□□□□□ -1.37
STAG3L2-202ENST00000611766 CXCL5P42830 114 aa6.52□□□□□ -1.37
STAG3L2-202ENST00000611766 HSD52Q0P140 79 aa6.52□□□□□ -1.37
STAG3L2-202ENST00000611766 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.37
STAG3L2-202ENST00000611766 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.52□□□□□ -1.37
STAG3L2-202ENST00000611766 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
STAG3L2-202ENST00000611766 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
STAG3L2-202ENST00000611766 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.51□□□□□ -1.37
STAG3L2-202ENST00000611766 NDUFA1O15239 70 aa6.51□□□□□ -1.37
STAG3L2-202ENST00000611766 PTTG1IPP53801 180 aa6.51□□□□□ -1.37
STAG3L2-202ENST00000611766 CTAG1AP78358 180 aa6.51□□□□□ -1.37
STAG3L2-202ENST00000611766 CFAP161Q6P656 301 aa6.51□□□□□ -1.37
STAG3L2-202ENST00000611766 Q8IZM0 81 aa6.51□□□□□ -1.37
STAG3L2-202ENST00000611766 C15orf56Q8N910 161 aa6.51□□□□□ -1.37
STAG3L2-202ENST00000611766 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.51□□□□□ -1.37
STAG3L2-202ENST00000611766 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.51□□□□□ -1.37
STAG3L2-202ENST00000611766 TMEM238C9JI98 176 aa6.5□□□□□ -1.37
STAG3L2-202ENST00000611766 IFITM1P13164 125 aa6.5□□□□□ -1.37
STAG3L2-202ENST00000611766 MALP21145 153 aa6.5□□□□□ -1.37
STAG3L2-202ENST00000611766 COX17Q14061 63 aa6.5□□□□□ -1.37
STAG3L2-202ENST00000611766 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.5□□□□□ -1.37
STAG3L2-202ENST00000611766 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.5□□□□□ -1.37
STAG3L2-202ENST00000611766 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.5□□□□□ -1.37
STAG3L2-202ENST00000611766 A0A096LNI7 61 aa6.49□□□□□ -1.37
STAG3L2-202ENST00000611766 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.49□□□□□ -1.37
STAG3L2-202ENST00000611766 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.49□□□□□ -1.37
STAG3L2-202ENST00000611766 A6NJY4 79 aa6.49□□□□□ -1.37
STAG3L2-202ENST00000611766 PRSS2P07478 247 aa6.49□□□□□ -1.37
STAG3L2-202ENST00000611766 SPINK8P0C7L1 97 aa6.49□□□□□ -1.37
STAG3L2-202ENST00000611766 XCL1P47992 114 aa6.49□□□□□ -1.37
STAG3L2-202ENST00000611766 Q6ZRP5 223 aa6.49□□□□□ -1.37
STAG3L2-202ENST00000611766 COX7B2Q8TF08 81 aa6.49□□□□□ -1.37
STAG3L2-202ENST00000611766 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.48□□□□□ -1.37
STAG3L2-202ENST00000611766 A6NDN8 102 aa6.48□□□□□ -1.37
STAG3L2-202ENST00000611766 FOXI1Q12951 378 aa6.48□□□□□ -1.37
STAG3L2-202ENST00000611766 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.47□□□□□ -1.37
STAG3L2-202ENST00000611766 C5orf38Q86SI9 138 aa6.47□□□□□ -1.37
STAG3L2-202ENST00000611766 CEND1Q8N111 149 aa6.47□□□□□ -1.37
STAG3L2-202ENST00000611766 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
STAG3L2-202ENST00000611766 HIST1H4GQ99525 98 aa6.47□□□□□ -1.37
STAG3L2-202ENST00000611766 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.47□□□□□ -1.37
STAG3L2-202ENST00000611766 SPANXCQ9NY87 97 aa6.47□□□□□ -1.37
STAG3L2-202ENST00000611766 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.47□□□□□ -1.37
STAG3L2-202ENST00000611766 CKS1BP61024 79 aa6.46□□□□□ -1.38
STAG3L2-202ENST00000611766 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
STAG3L2-202ENST00000611766 MUC2Q02817 5179 aa6.46□□□□□ -1.38
STAG3L2-202ENST00000611766 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.46□□□□□ -1.38
STAG3L2-202ENST00000611766 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.46□□□□□ -1.38
STAG3L2-202ENST00000611766 C2orf48Q96LS8 159 aa6.46□□□□□ -1.38
STAG3L2-202ENST00000611766 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
STAG3L2-202ENST00000611766 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.45□□□□□ -1.38
STAG3L2-202ENST00000611766 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.45□□□□□ -1.38
STAG3L2-202ENST00000611766 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.45□□□□□ -1.38
STAG3L2-202ENST00000611766 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.45□□□□□ -1.38
STAG3L2-202ENST00000611766 LPAP08519 4548 aa6.44□□□□□ -1.38
STAG3L2-202ENST00000611766 KIAA0087Q14695 138 aa6.44□□□□□ -1.38
STAG3L2-202ENST00000611766 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.44□□□□□ -1.38
STAG3L2-202ENST00000611766 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.43□□□□□ -1.38
STAG3L2-202ENST00000611766 A0A0U1RQV1 116 aa6.43□□□□□ -1.38
STAG3L2-202ENST00000611766 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.43□□□□□ -1.38
STAG3L2-202ENST00000611766 SMIM13P0DJ93 91 aa6.43□□□□□ -1.38
STAG3L2-202ENST00000611766 RNF151Q2KHN1 245 aa6.43□□□□□ -1.38
STAG3L2-202ENST00000611766 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.43□□□□□ -1.38
STAG3L2-202ENST00000611766 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.42□□□□□ -1.38
STAG3L2-202ENST00000611766 A0A1B0GWB2 263 aa6.42□□□□□ -1.38
STAG3L2-202ENST00000611766 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
STAG3L2-202ENST00000611766 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.42□□□□□ -1.38
STAG3L2-202ENST00000611766 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.42□□□□□ -1.38
STAG3L2-202ENST00000611766 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.42□□□□□ -1.38
STAG3L2-202ENST00000611766 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.42□□□□□ -1.38
STAG3L2-202ENST00000611766 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.42□□□□□ -1.38
STAG3L2-202ENST00000611766 LITAFQ99732 161 aa6.41□□□□□ -1.38
STAG3L2-202ENST00000611766 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.4□□□□□ -1.38
STAG3L2-202ENST00000611766 SPAG11BQ08648 103 aa6.4□□□□□ -1.38
STAG3L2-202ENST00000611766 CARD19Q96LW7 228 aa6.4□□□□□ -1.38
STAG3L2-202ENST00000611766 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.4□□□□□ -1.38
STAG3L2-202ENST00000611766 ERG28Q9UKR5 140 aa6.4□□□□□ -1.38
STAG3L2-202ENST00000611766 A0A1W2PNN7 141 aa6.39□□□□□ -1.39
STAG3L2-202ENST00000611766 GAGE2BQ13066 116 aa6.39□□□□□ -1.39
STAG3L2-202ENST00000611766 PRR4Q16378 134 aa6.39□□□□□ -1.39
STAG3L2-202ENST00000611766 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.39□□□□□ -1.39
STAG3L2-202ENST00000611766 A0A0B4J2C4 111 aa6.38□□□□□ -1.39
STAG3L2-202ENST00000611766 LINC00158P58513 81 aa6.38□□□□□ -1.39
STAG3L2-202ENST00000611766 SYCNQ0VAF6 134 aa6.38□□□□□ -1.39
STAG3L2-202ENST00000611766 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.38□□□□□ -1.39
STAG3L2-202ENST00000611766 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.38□□□□□ -1.39
STAG3L2-202ENST00000611766 NDUFC2O95298 119 aa6.37□□□□□ -1.39
STAG3L2-202ENST00000611766 BATFQ16520 125 aa6.37□□□□□ -1.39
STAG3L2-202ENST00000611766 C1orf137Q5JT78 98 aa6.37□□□□□ -1.39
STAG3L2-202ENST00000611766 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.37□□□□□ -1.39
STAG3L2-202ENST00000611766 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.36□□□□□ -1.39
STAG3L2-202ENST00000611766 FXYD2P54710 66 aa6.36□□□□□ -1.39
STAG3L2-202ENST00000611766 DIRC1Q969H9 104 aa6.36□□□□□ -1.39
STAG3L2-202ENST00000611766 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.36□□□□□ -1.39
STAG3L2-202ENST00000611766 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.36□□□□□ -1.39
STAG3L2-202ENST00000611766 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.35□□□□□ -1.39
STAG3L2-202ENST00000611766 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.35□□□□□ -1.39
STAG3L2-202ENST00000611766 A4D1N5 150 aa6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms