RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607519.1

GMDS-AS1-216, humanhuman

TSL 4

Gene GMDS-AS1, Length 579 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.59□□□□□ -1.35
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZNF815PA8K554 130 aa6.58□□□□□ -1.36
GMDS-AS1-216ENST00000607519 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
GMDS-AS1-216ENST00000607519 AKR1D1P51857 326 aa6.58□□□□□ -1.36
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PYY3Q5JQD4 70 aa6.58□□□□□ -1.36
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.58□□□□□ -1.36
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HERC2O95714 4834 aa6.58□□□□□ -1.36
GMDS-AS1-216ENST00000607519 EPM2AB3EWF7 344 aa6.57□□□□□ -1.36
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HERV-K104P63124 156 aa6.57□□□□□ -1.36
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.57□□□□□ -1.36
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NPC2P61916 151 aa6.56□□□□□ -1.36
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LITAFQ99732 161 aa6.56□□□□□ -1.36
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.56□□□□□ -1.36
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.56□□□□□ -1.36
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.55□□□□□ -1.36
GMDS-AS1-216ENST00000607519 COX17Q14061 63 aa6.55□□□□□ -1.36
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SFTA2Q6UW10 78 aa6.55□□□□□ -1.36
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.55□□□□□ -1.36
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.55□□□□□ -1.36
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa6.54□□□□□ -1.36
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GAGE10A6NGK3 116 aa6.54□□□□□ -1.36
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SPATA45Q537H7 98 aa6.54□□□□□ -1.36
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
GMDS-AS1-216ENST00000607519 C14orf144Q96I85 54 aa6.54□□□□□ -1.36
GMDS-AS1-216ENST00000607519 C22orf24Q9Y442 160 aa6.54□□□□□ -1.36
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
GMDS-AS1-216ENST00000607519 M0QXV9 152 aa6.52□□□□□ -1.37
GMDS-AS1-216ENST00000607519 VPREB1P12018 145 aa6.52□□□□□ -1.37
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
GMDS-AS1-216ENST00000607519 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.52□□□□□ -1.37
GMDS-AS1-216ENST00000607519 Q8N1X5 172 aa6.52□□□□□ -1.37
GMDS-AS1-216ENST00000607519 VAMP8Q9BV40 100 aa6.52□□□□□ -1.37
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.51□□□□□ -1.37
GMDS-AS1-216ENST00000607519 COX8AP10176 69 aa6.51□□□□□ -1.37
GMDS-AS1-216ENST00000607519 Q5VSD8 79 aa6.51□□□□□ -1.37
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.51□□□□□ -1.37
GMDS-AS1-216ENST00000607519 C7orf33Q8WU49 177 aa6.51□□□□□ -1.37
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LINC00167Q96N53 147 aa6.51□□□□□ -1.37
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.51□□□□□ -1.37
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.51□□□□□ -1.37
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LINC00587B1AMM8 73 aa6.5□□□□□ -1.37
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NCR3O14931 201 aa6.5□□□□□ -1.37
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TIMM17BO60830 172 aa6.5□□□□□ -1.37
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.5□□□□□ -1.37
GMDS-AS1-216ENST00000607519 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.49□□□□□ -1.37
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.49□□□□□ -1.37
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.48□□□□□ -1.37
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FAM229AH3BQW9 127 aa6.48□□□□□ -1.37
GMDS-AS1-216ENST00000607519 UBE2BP63146 152 aa6.48□□□□□ -1.37
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.48□□□□□ -1.37
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.48□□□□□ -1.37
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.48□□□□□ -1.37
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.46□□□□□ -1.37
GMDS-AS1-216ENST00000607519 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.46□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-216ENST00000607519 IGKV2D-28P01615 120 aa6.46□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-216ENST00000607519 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.46□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.46□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SPANXCQ9NY87 97 aa6.46□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TMEM238C9JI98 176 aa6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-216ENST00000607519 M0R378 163 aa6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DLEU1O43261 78 aa6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-216ENST00000607519 C1orf137Q5JT78 98 aa6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PRO1933Q9H354 126 aa6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-216ENST00000607519 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.44□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.44□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.44□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.44□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-216ENST00000607519 S100A12P80511 92 aa6.42□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.42□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HIST1H4GQ99525 98 aa6.42□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NDUFC2O95298 119 aa6.41□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-216ENST00000607519 IGLV7-43P04211 117 aa6.41□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-216ENST00000607519 INAFM2P0DMQ5 153 aa6.41□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-216ENST00000607519 IFITM1P13164 125 aa6.41□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-216ENST00000607519 A4D1N5 150 aa6.4□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SMIM6P0DI80 62 aa6.4□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DDTP30046 118 aa6.4□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-216ENST00000607519 Q6ZVH6 145 aa6.4□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-216ENST00000607519 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.4□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-216ENST00000607519 C12orf57Q99622 126 aa6.4□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HIGD1BQ9P298 99 aa6.4□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.39□□□□□ -1.39
GMDS-AS1-216ENST00000607519 IGLV6-57P01721 117 aa6.39□□□□□ -1.39
GMDS-AS1-216ENST00000607519 REG3GQ6UW15 175 aa6.39□□□□□ -1.39
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TMEM126AQ9H061 195 aa6.39□□□□□ -1.39
GMDS-AS1-216ENST00000607519 BCE1O60756 84 aa6.38□□□□□ -1.39
GMDS-AS1-216ENST00000607519 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.38□□□□□ -1.39
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.38□□□□□ -1.39
GMDS-AS1-216ENST00000607519 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 96.8 ms