RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

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Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 DEFB130AP0DP74 79 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG18-242ENST00000602319 LYRM9A8MSI8 78 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG18-242ENST00000602319 PRYO14603 147 aa6.6□□□□□ -1.35
HCG18-242ENST00000602319 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.59□□□□□ -1.35
HCG18-242ENST00000602319 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.59□□□□□ -1.35
HCG18-242ENST00000602319 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
HCG18-242ENST00000602319 MUC6Q6W4X9 2439 aa6.58□□□□□ -1.36
HCG18-242ENST00000602319 F8WDY8 70 aa6.58□□□□□ -1.36
HCG18-242ENST00000602319 VPREB1P12018 145 aa6.58□□□□□ -1.36
HCG18-242ENST00000602319 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
HCG18-242ENST00000602319 SCXQ7RTU7 201 aa6.58□□□□□ -1.36
HCG18-242ENST00000602319 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
HCG18-242ENST00000602319 CSPG4Q6UVK1 2322 aa6.57□□□□□ -1.36
HCG18-242ENST00000602319 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.57□□□□□ -1.36
HCG18-242ENST00000602319 CUBNO60494 3623 aa6.57□□□□□ -1.36
HCG18-242ENST00000602319 DEFB113Q30KQ7 82 aa6.57□□□□□ -1.36
HCG18-242ENST00000602319 IGF2RP11717 2491 aa6.56□□□□□ -1.36
HCG18-242ENST00000602319 A0A1B0GW54 56 aa6.56□□□□□ -1.36
HCG18-242ENST00000602319 A0A096LPF7 62 aa6.55□□□□□ -1.36
HCG18-242ENST00000602319 ESRGQ1W209 222 aa6.55□□□□□ -1.36
HCG18-242ENST00000602319 LELP1Q5T871 98 aa6.55□□□□□ -1.36
HCG18-242ENST00000602319 ZANQ9Y493 2812 aa6.55□□□□□ -1.36
HCG18-242ENST00000602319 WFDC11Q8NEX6 87 aa6.55□□□□□ -1.36
HCG18-242ENST00000602319 NBASA2RRP1 2371 aa6.55□□□□□ -1.36
HCG18-242ENST00000602319 M0R378 163 aa6.54□□□□□ -1.36
HCG18-242ENST00000602319 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
HCG18-242ENST00000602319 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.54□□□□□ -1.36
HCG18-242ENST00000602319 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.53□□□□□ -1.36
HCG18-242ENST00000602319 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.53□□□□□ -1.36
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.53□□□□□ -1.36
HCG18-242ENST00000602319 CHD6Q8TD26 2715 aa6.53□□□□□ -1.36
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP10-9P60411 292 aa6.53□□□□□ -1.36
HCG18-242ENST00000602319 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa6.52□□□□□ -1.37
HCG18-242ENST00000602319 hDV103S1A0JD37 113 aa6.52□□□□□ -1.37
HCG18-242ENST00000602319 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa6.51□□□□□ -1.37
HCG18-242ENST00000602319 Q1T7F1 81 aa6.51□□□□□ -1.37
HCG18-242ENST00000602319 Q8N9L7 120 aa6.51□□□□□ -1.37
HCG18-242ENST00000602319 NOTCH3Q9UM47 2321 aa6.51□□□□□ -1.37
HCG18-242ENST00000602319 TNP2Q05952 138 aa6.5□□□□□ -1.37
HCG18-242ENST00000602319 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.5□□□□□ -1.37
HCG18-242ENST00000602319 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.5□□□□□ -1.37
HCG18-242ENST00000602319 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HCG18-242ENST00000602319 PRR15Q8IV56 129 aa6.5□□□□□ -1.37
HCG18-242ENST00000602319 BRK1Q8WUW1 75 aa6.5□□□□□ -1.37
HCG18-242ENST00000602319 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
HCG18-242ENST00000602319 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.49□□□□□ -1.37
HCG18-242ENST00000602319 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.49□□□□□ -1.37
HCG18-242ENST00000602319 C1orf195Q5TG92 126 aa6.48□□□□□ -1.37
HCG18-242ENST00000602319 Q8NAQ8 132 aa6.48□□□□□ -1.37
HCG18-242ENST00000602319 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.48□□□□□ -1.37
HCG18-242ENST00000602319 Q8N377 158 aa6.48□□□□□ -1.37
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP1-1Q07627 177 aa6.48□□□□□ -1.37
HCG18-242ENST00000602319 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.47□□□□□ -1.37
HCG18-242ENST00000602319 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.47□□□□□ -1.37
HCG18-242ENST00000602319 SMIM29Q86T20 159 aa6.47□□□□□ -1.37
HCG18-242ENST00000602319 C15orf56Q8N910 161 aa6.47□□□□□ -1.37
HCG18-242ENST00000602319 KLK12Q9UKR0 248 aa6.47□□□□□ -1.37
HCG18-242ENST00000602319 DAD1P61803 113 aa6.46□□□□□ -1.38
HCG18-242ENST00000602319 SPRR4Q96PI1 79 aa6.46□□□□□ -1.38
HCG18-242ENST00000602319 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.46□□□□□ -1.38
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP10-3P60369 221 aa6.45□□□□□ -1.38
HCG18-242ENST00000602319 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
HCG18-242ENST00000602319 Q6ZRP5 223 aa6.45□□□□□ -1.38
HCG18-242ENST00000602319 A0A1W2PNM2 257 aa6.45□□□□□ -1.38
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
HCG18-242ENST00000602319 Q6ZRU5 148 aa6.45□□□□□ -1.38
HCG18-242ENST00000602319 CREBBPQ92793 2442 aa6.45□□□□□ -1.38
HCG18-242ENST00000602319 TEX15Q9BXT5 2789 aa6.45□□□□□ -1.38
HCG18-242ENST00000602319 CFAP46Q8IYW2 2715 aa6.45□□□□□ -1.38
HCG18-242ENST00000602319 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.44□□□□□ -1.38
HCG18-242ENST00000602319 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.43□□□□□ -1.38
HCG18-242ENST00000602319 WNK1Q9H4A3 2382 aa6.43□□□□□ -1.38
HCG18-242ENST00000602319 C3orf84H3BNL1 204 aa6.43□□□□□ -1.38
HCG18-242ENST00000602319 DSCR10P59022 87 aa6.43□□□□□ -1.38
HCG18-242ENST00000602319 V9GYY9 64 aa6.43□□□□□ -1.38
HCG18-242ENST00000602319 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.43□□□□□ -1.38
HCG18-242ENST00000602319 SPRR1AP35321 89 aa6.43□□□□□ -1.38
HCG18-242ENST00000602319 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.43□□□□□ -1.38
HCG18-242ENST00000602319 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.42□□□□□ -1.38
HCG18-242ENST00000602319 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP6.42□□□□□ -1.38
HCG18-242ENST00000602319 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
HCG18-242ENST00000602319 Q8NBF4 154 aa6.42□□□□□ -1.38
HCG18-242ENST00000602319 H3BNG1 76 aa6.42□□□□□ -1.38
HCG18-242ENST00000602319 APOC4P55056 127 aa6.42□□□□□ -1.38
HCG18-242ENST00000602319 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.41□□□□□ -1.38
HCG18-242ENST00000602319 DEFB135Q30KP9 77 aa6.41□□□□□ -1.38
HCG18-242ENST00000602319 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.41□□□□□ -1.38
HCG18-242ENST00000602319 FLNCQ14315 2725 aa6.41□□□□□ -1.38
HCG18-242ENST00000602319 DEFB4AO15263 64 aa6.4□□□□□ -1.38
HCG18-242ENST00000602319 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.4□□□□□ -1.38
HCG18-242ENST00000602319 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.4□□□□□ -1.38
HCG18-242ENST00000602319 Q6ZRX8 168 aa6.4□□□□□ -1.38
HCG18-242ENST00000602319 Q9BRP9 147 aa6.4□□□□□ -1.38
HCG18-242ENST00000602319 C2CD3Q4AC94 2353 aa6.4□□□□□ -1.39
HCG18-242ENST00000602319 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
HCG18-242ENST00000602319 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
HCG18-242ENST00000602319 C7orf33Q8WU49 177 aa6.39□□□□□ -1.39
HCG18-242ENST00000602319 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.38□□□□□ -1.39
HCG18-242ENST00000602319 SEC61GP60059 68 aa6.38□□□□□ -1.39
HCG18-242ENST00000602319 C1orf137Q5JT78 98 aa6.37□□□□□ -1.39
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