RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587957.1

EFTUD2-209, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 503 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-209ENST00000587957 CBLN2Q8IUK8 224 aa6.47□□□□□ -1.37
EFTUD2-209ENST00000587957 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.47□□□□□ -1.37
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
EFTUD2-209ENST00000587957 C11orf86A6NJI1 115 aa6.46□□□□□ -1.38
EFTUD2-209ENST00000587957 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
EFTUD2-209ENST00000587957 H0Y8G0 127 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-209ENST00000587957 NUPR1O60356 82 aa6.45□□□□□ -1.38
EFTUD2-209ENST00000587957 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.44□□□□□ -1.38
EFTUD2-209ENST00000587957 SCO1O75880 301 aa6.44□□□□□ -1.38
EFTUD2-209ENST00000587957 LINC00167Q96N53 147 aa6.44□□□□□ -1.38
EFTUD2-209ENST00000587957 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.44□□□□□ -1.38
EFTUD2-209ENST00000587957 ERG28Q9UKR5 140 aa6.44□□□□□ -1.38
EFTUD2-209ENST00000587957 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.43□□□□□ -1.38
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF861PO60384 105 aa6.43□□□□□ -1.38
EFTUD2-209ENST00000587957 HSBP1O75506 76 aa6.43□□□□□ -1.38
EFTUD2-209ENST00000587957 IGKV2D-28P01615 120 aa6.43□□□□□ -1.38
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.43□□□□□ -1.38
EFTUD2-209ENST00000587957 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.43□□□□□ -1.38
EFTUD2-209ENST00000587957 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
EFTUD2-209ENST00000587957 YPEL4Q96NS1 127 aa6.43□□□□□ -1.38
EFTUD2-209ENST00000587957 A0A0U1RRA0 63 aa6.42□□□□□ -1.38
EFTUD2-209ENST00000587957 BCE1O60756 84 aa6.42□□□□□ -1.38
EFTUD2-209ENST00000587957 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
EFTUD2-209ENST00000587957 UBE2AP49459 152 aa6.42□□□□□ -1.38
EFTUD2-209ENST00000587957 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-209ENST00000587957 TRGC2P03986 189 aa6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-209ENST00000587957 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-209ENST00000587957 LINC00158P58513 81 aa6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-209ENST00000587957 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.41□□□□□ -1.38
EFTUD2-209ENST00000587957 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-209ENST00000587957 ATP6V1G1O75348 118 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-209ENST00000587957 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-209ENST00000587957 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-209ENST00000587957 SFTA2Q6UW10 78 aa6.39□□□□□ -1.39
EFTUD2-209ENST00000587957 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-209ENST00000587957 TMEM223A0PJW6 202 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-209ENST00000587957 SERF1AO75920 110 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-209ENST00000587957 PRLHP81277 87 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-209ENST00000587957 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-209ENST00000587957 COX17Q14061 63 aa6.38□□□□□ -1.39
EFTUD2-209ENST00000587957 TMEM238C9JI98 176 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-209ENST00000587957 LEPROTL1O95214 131 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-209ENST00000587957 VPREB1P12018 145 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-209ENST00000587957 SMIM13P0DJ93 91 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-209ENST00000587957 FABP4P15090 132 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-209ENST00000587957 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-209ENST00000587957 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-209ENST00000587957 NCR3O14931 201 aa6.35□□□□□ -1.39
EFTUD2-209ENST00000587957 TSPAN13O95857 204 aa6.35□□□□□ -1.39
EFTUD2-209ENST00000587957 Q8NDZ9 215 aa6.35□□□□□ -1.39
EFTUD2-209ENST00000587957 TMEM126AQ9H061 195 aa6.35□□□□□ -1.39
EFTUD2-209ENST00000587957 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.35□□□□□ -1.39
EFTUD2-209ENST00000587957 A0A087X002 238 aa6.34□□□□□ -1.39
EFTUD2-209ENST00000587957 PRR4Q16378 134 aa6.34□□□□□ -1.39
EFTUD2-209ENST00000587957 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.34□□□□□ -1.39
EFTUD2-209ENST00000587957 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.34□□□□□ -1.39
EFTUD2-209ENST00000587957 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.34□□□□□ -1.39
EFTUD2-209ENST00000587957 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.34□□□□□ -1.39
EFTUD2-209ENST00000587957 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.34□□□□□ -1.39
EFTUD2-209ENST00000587957 CRYGAP11844 174 aa6.33□□□□□ -1.4
EFTUD2-209ENST00000587957 LRP2P98164 4655 aa6.33□□□□□ -1.4
EFTUD2-209ENST00000587957 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.33□□□□□ -1.4
EFTUD2-209ENST00000587957 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.32□□□□□ -1.4
EFTUD2-209ENST00000587957 M0R378 163 aa6.32□□□□□ -1.4
EFTUD2-209ENST00000587957 PLNP26678 52 aa6.32□□□□□ -1.4
EFTUD2-209ENST00000587957 HERVK_113P61574 105 aa6.32□□□□□ -1.4
EFTUD2-209ENST00000587957 HERV-K104P63124 156 aa6.32□□□□□ -1.4
EFTUD2-209ENST00000587957 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.32□□□□□ -1.4
EFTUD2-209ENST00000587957 C9orf118A6NHY6 69 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-209ENST00000587957 COLCA2A8K830 154 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-209ENST00000587957 DPM2O94777 84 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-209ENST00000587957 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-209ENST00000587957 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-209ENST00000587957 DAND5Q8N907 189 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-209ENST00000587957 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-209ENST00000587957 LEPROTO15243 131 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-209ENST00000587957 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-209ENST00000587957 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-209ENST00000587957 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-209ENST00000587957 LINC00587B1AMM8 73 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-209ENST00000587957 J3QQQ9 107 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-209ENST00000587957 IGKCP01834 107 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-209ENST00000587957 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.28□□□□□ -1.4
EFTUD2-209ENST00000587957 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.27□□□□□ -1.41
EFTUD2-209ENST00000587957 PRYO14603 147 aa6.27□□□□□ -1.41
EFTUD2-209ENST00000587957 NPC2P61916 151 aa6.27□□□□□ -1.41
EFTUD2-209ENST00000587957 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.27□□□□□ -1.41
EFTUD2-209ENST00000587957 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-209ENST00000587957 S100A12P80511 92 aa6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-209ENST00000587957 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-209ENST00000587957 HIST1H2BKO60814 126 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-209ENST00000587957 HIST1H2BJP06899 126 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-209ENST00000587957 HIST1H2BOP23527 126 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-209ENST00000587957 HIST1H2BBP33778 126 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-209ENST00000587957 NMUP48645 174 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-209ENST00000587957 HIST1H2BDP58876 126 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-209ENST00000587957 HIST1H2BCP62807 126 aa6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.4 ms