RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565712.1

C15orf40-211, Transcript of chromosome 15 open reading frame 40, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene C15orf40, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40-211ENST00000565712 HIST1H2BKO60814 126 aa8.91□□□□□ -0.98
C15orf40-211ENST00000565712 HIST1H2BJP06899 126 aa8.91□□□□□ -0.98
C15orf40-211ENST00000565712 HIST1H2BOP23527 126 aa8.91□□□□□ -0.98
C15orf40-211ENST00000565712 HIST1H2BBP33778 126 aa8.91□□□□□ -0.98
C15orf40-211ENST00000565712 LINC00158P58513 81 aa8.91□□□□□ -0.98
C15orf40-211ENST00000565712 HIST1H2BDP58876 126 aa8.91□□□□□ -0.98
C15orf40-211ENST00000565712 HIST1H2BCP62807 126 aa8.91□□□□□ -0.98
C15orf40-211ENST00000565712 RPL24P83731 157 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
C15orf40-211ENST00000565712 HIST2H2BEQ16778 126 aa8.91□□□□□ -0.98
C15orf40-211ENST00000565712 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
C15orf40-211ENST00000565712 HIST1H2BHQ93079 126 aa8.91□□□□□ -0.98
C15orf40-211ENST00000565712 HIST1H2BNQ99877 126 aa8.91□□□□□ -0.98
C15orf40-211ENST00000565712 HIST1H2BMQ99879 126 aa8.91□□□□□ -0.98
C15orf40-211ENST00000565712 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa8.91□□□□□ -0.98
C15orf40-211ENST00000565712 ZNF861PO60384 105 aa8.9□□□□□ -0.98
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C15orf40-211ENST00000565712 HERV-K104P63124 156 aa8.9□□□□□ -0.98
C15orf40-211ENST00000565712 LINC00587B1AMM8 73 aa8.89□□□□□ -0.99
C15orf40-211ENST00000565712 BCE1O60756 84 aa8.89□□□□□ -0.99
C15orf40-211ENST00000565712 ATP6V1G1O75348 118 aa8.89□□□□□ -0.99
C15orf40-211ENST00000565712 VPREB1P12018 145 aa8.89□□□□□ -0.99
C15orf40-211ENST00000565712 PET117Q6UWS5 81 aa8.89□□□□□ -0.99
C15orf40-211ENST00000565712 NDUFA12Q9UI09 145 aa8.89□□□□□ -0.99
C15orf40-211ENST00000565712 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa8.88□□□□□ -0.99
C15orf40-211ENST00000565712 LEPROTO15243 131 aa8.88□□□□□ -0.99
C15orf40-211ENST00000565712 IGKCP01834 107 aa8.88□□□□□ -0.99
C15orf40-211ENST00000565712 HERVK_113P61574 105 aa8.88□□□□□ -0.99
C15orf40-211ENST00000565712 MEIG1Q5JSS6 88 aa8.88□□□□□ -0.99
C15orf40-211ENST00000565712 PLEKHB2Q96CS7 222 aa8.88□□□□□ -0.99
C15orf40-211ENST00000565712 A0A0U1RRA0 63 aa8.87□□□□□ -0.99
C15orf40-211ENST00000565712 RPL28P46779 137 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
C15orf40-211ENST00000565712 TNXBP22105 4242 aa8.86□□□□□ -0.99
C15orf40-211ENST00000565712 SMIM13P0DJ93 91 aa8.86□□□□□ -0.99
C15orf40-211ENST00000565712 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
C15orf40-211ENST00000565712 PMCHL2Q9BQD1 86 aa8.86□□□□□ -0.99
C15orf40-211ENST00000565712 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa8.85□□□□□ -0.99
C15orf40-211ENST00000565712 IGKV2D-28P01615 120 aa8.85□□□□□ -0.99
C15orf40-211ENST00000565712 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa8.84□□□□□ -0.99
C15orf40-211ENST00000565712 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa8.84□□□□□ -0.99
C15orf40-211ENST00000565712 J3QQQ9 107 aa8.84□□□□□ -0.99
C15orf40-211ENST00000565712 TSPEAR-AS2P59090 65 aa8.84□□□□□ -0.99
C15orf40-211ENST00000565712 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa8.83□□□□□ -1
C15orf40-211ENST00000565712 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
C15orf40-211ENST00000565712 NMUP48645 174 aa8.83□□□□□ -1
C15orf40-211ENST00000565712 UBE2AP49459 152 aa8.83□□□□□ -1
C15orf40-211ENST00000565712 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa8.83□□□□□ -1
C15orf40-211ENST00000565712 PRR26Q8N8Z3 221 aa8.83□□□□□ -1
C15orf40-211ENST00000565712 Q8NDZ9 215 aa8.83□□□□□ -1
C15orf40-211ENST00000565712 M0R378 163 aa8.81□□□□□ -1
C15orf40-211ENST00000565712 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
C15orf40-211ENST00000565712 BOD1L2Q8IYS8 172 aa8.81□□□□□ -1
C15orf40-211ENST00000565712 HMCN2Q8NDA2 5059 aa8.81□□□□□ -1
C15orf40-211ENST00000565712 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
C15orf40-211ENST00000565712 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa8.8□□□□□ -1
C15orf40-211ENST00000565712 TMEM126AQ9H061 195 aa8.8□□□□□ -1
C15orf40-211ENST00000565712 TMEM238C9JI98 176 aa8.79□□□□□ -1
C15orf40-211ENST00000565712 E9PLD3 99 aa8.79□□□□□ -1
C15orf40-211ENST00000565712 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
C15orf40-211ENST00000565712 LINC01545Q5VT33 79 aa8.79□□□□□ -1
C15orf40-211ENST00000565712 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa8.78□□□□□ -1
C15orf40-211ENST00000565712 S100A1P23297 94 aa8.78□□□□□ -1
C15orf40-211ENST00000565712 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa8.78□□□□□ -1
C15orf40-211ENST00000565712 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa8.76□□□□□ -1.01
C15orf40-211ENST00000565712 H3BS24 57 aa8.76□□□□□ -1.01
C15orf40-211ENST00000565712 NCR3O14931 201 aa8.76□□□□□ -1.01
C15orf40-211ENST00000565712 C3orf79P0CE67 100 aa8.76□□□□□ -1.01
C15orf40-211ENST00000565712 PRLHP81277 87 aa8.76□□□□□ -1.01
C15orf40-211ENST00000565712 ARL17AQ8IVW1 177 aa8.76□□□□□ -1.01
C15orf40-211ENST00000565712 DAND5Q8N907 189 aa8.76□□□□□ -1.01
C15orf40-211ENST00000565712 MIEN1Q9BRT3 115 aa8.75□□□□□ -1.01
C15orf40-211ENST00000565712 A0A0J9YXY3 114 aa8.74□□□□□ -1.01
C15orf40-211ENST00000565712 PRYO14603 147 aa8.74□□□□□ -1.01
C15orf40-211ENST00000565712 KRTDAPP60985 99 aa8.74□□□□□ -1.01
C15orf40-211ENST00000565712 CRYGAP11844 174 aa8.73□□□□□ -1.01
C15orf40-211ENST00000565712 S100A12P80511 92 aa8.73□□□□□ -1.01
C15orf40-211ENST00000565712 C20orf202A1L168 122 aa8.72□□□□□ -1.01
C15orf40-211ENST00000565712 KCNQ1DNQ9H478 68 aa8.72□□□□□ -1.01
C15orf40-211ENST00000565712 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa8.71□□□□□ -1.02
C15orf40-211ENST00000565712 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa8.71□□□□□ -1.02
C15orf40-211ENST00000565712 A0A087X002 238 aa8.7□□□□□ -1.02
C15orf40-211ENST00000565712 NDUFC2O95298 119 aa8.7□□□□□ -1.02
C15orf40-211ENST00000565712 FAM229BQ4G0N7 80 aa8.7□□□□□ -1.02
C15orf40-211ENST00000565712 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa8.7□□□□□ -1.02
C15orf40-211ENST00000565712 LINC00337Q8N6G1 96 aa8.7□□□□□ -1.02
C15orf40-211ENST00000565712 HIGD2AQ9BW72 106 aa8.7□□□□□ -1.02
C15orf40-211ENST00000565712 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
C15orf40-211ENST00000565712 DDTP30046 118 aa8.69□□□□□ -1.02
C15orf40-211ENST00000565712 SPRR1AP35321 89 aa8.69□□□□□ -1.02
C15orf40-211ENST00000565712 AKR1D1P51857 326 aa8.69□□□□□ -1.02
C15orf40-211ENST00000565712 TYMSOSQ8TAI1 123 aa8.69□□□□□ -1.02
C15orf40-211ENST00000565712 ANAPC11Q9NYG5 84 aa8.69□□□□□ -1.02
C15orf40-211ENST00000565712 ZNF815PA8K554 130 aa8.68□□□□□ -1.02
C15orf40-211ENST00000565712 TIMM17BO60830 172 aa8.68□□□□□ -1.02
C15orf40-211ENST00000565712 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa8.67□□□□□ -1.02
C15orf40-211ENST00000565712 A4D1N5 150 aa8.67□□□□□ -1.02
C15orf40-211ENST00000565712 NPC2P61916 151 aa8.67□□□□□ -1.02
C15orf40-211ENST00000565712 S100A7L2Q5SY68 101 aa8.67□□□□□ -1.02
C15orf40-211ENST00000565712 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa8.67□□□□□ -1.02
C15orf40-211ENST00000565712 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
C15orf40-211ENST00000565712 LITAFQ99732 161 aa8.66□□□□□ -1.02
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