RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	CTAG1A	P78358	180 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	SFTA2	Q6UW10	78 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	HIST1H2BK	O60814	126 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	VPREB1	P12018	145 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	HIST1H2BO	P23527	126 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	HIST1H2BB	P33778	126 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	HIST1H2BD	P58876	126 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	HIST1H2BC	P62807	126 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM223	A0PJW6	202 aa		12.96	□□□□□ -0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	TRGC2	P03986	189 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PPP4C-205	ENST00000563200		Q8NDZ9	215 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	HSBP1	O75506	76 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	IGKV2D-28	P01615	120 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	LINC00310	P59036	64 aa		12.91	□□□□□ -0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		12.91	□□□□□ -0.34
PPP4C-205	ENST00000563200	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A087X002	238 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	SERF1A	O75920	110 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	UBE2A	P49459	152 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM126A	Q9H061	195 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM238	C9JI98	176 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	LINC00158	P58513	81 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PPP4C-205	ENST00000563200		M0R378	163 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	TSTD3	H0UI37	97 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	LEPROTL1	O95214	131 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A0U1RRA0	63 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	CRYGA	P11844	174 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	SMIM13	P0DJ93	91 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	PRLH	P81277	87 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	PYY3	Q5JQD4	70 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PPP4C-205	ENST00000563200		H0Y8G0	127 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	FABP4	P15090	132 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	HERV-K104	P63124	156 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	PLN	P26678	52 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	LINC00587	B1AMM8	73 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	LEPROT	O15243	131 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	TSPAN13	O95857	204 aa		12.73	□□□□□ -0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	DPM2	O94777	84 aa		12.72	□□□□□ -0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		12.72	□□□□□ -0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		12.71	□□□□□ -0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		12.71	□□□□□ -0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	PRR4	Q16378	134 aa		12.71	□□□□□ -0.37
PPP4C-205	ENST00000563200	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		12.71	□□□□□ -0.37
PPP4C-205	ENST00000563200		J3QQQ9	107 aa		12.7	□□□□□ -0.38
PPP4C-205	ENST00000563200	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		12.7	□□□□□ -0.38
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		12.7	□□□□□ -0.38
PPP4C-205	ENST00000563200	PRY	O14603	147 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PPP4C-205	ENST00000563200	NCR3	O14931	201 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PPP4C-205	ENST00000563200	IGKC	P01834	107 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PPP4C-205	ENST00000563200	SPRR1A	P35321	89 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PPP4C-205	ENST00000563200	DDT	P30046	118 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PPP4C-205	ENST00000563200	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
PPP4C-205	ENST00000563200	HERVK_113	P61574	105 aa		12.67	□□□□□ -0.38
PPP4C-205	ENST00000563200	DAND5	Q8N907	189 aa		12.67	□□□□□ -0.38
PPP4C-205	ENST00000563200	NMU	P48645	174 aa		12.66	□□□□□ -0.38
PPP4C-205	ENST00000563200	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		12.66	□□□□□ -0.38
PPP4C-205	ENST00000563200	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		12.65	□□□□□ -0.38
PPP4C-205	ENST00000563200	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		12.65	□□□□□ -0.38
PPP4C-205	ENST00000563200	MUC2	Q02817	5179 aa		12.65	□□□□□ -0.38
PPP4C-205	ENST00000563200	SPRR4	Q96PI1	79 aa		12.64	□□□□□ -0.39
PPP4C-205	ENST00000563200	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	12.62	□□□□□ -0.39
PPP4C-205	ENST00000563200	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		12.62	□□□□□ -0.39
PPP4C-205	ENST00000563200	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		12.61	□□□□□ -0.39
PPP4C-205	ENST00000563200		E9PLD3	99 aa		12.6	□□□□□ -0.39
PPP4C-205	ENST00000563200	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		12.6	□□□□□ -0.39
PPP4C-205	ENST00000563200	SCGB1D1	O95968	90 aa		12.6	□□□□□ -0.39
PPP4C-205	ENST00000563200	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		12.59	□□□□□ -0.39
PPP4C-205	ENST00000563200	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		12.58	□□□□□ -0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	12.58	□□□□□ -0.4
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A0J9YXY3	114 aa		12.57	□□□□□ -0.4
PPP4C-205	ENST00000563200	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		12.57	□□□□□ -0.4

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