RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561212.5

ZEB1-222, Transcript of zinc finger E-box binding homeobox 1, human

TSL 5

Gene ZEB1, Length 1,500 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZEB1-222	ENST00000561212	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZEB1-222	ENST00000561212	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZEB1-222	ENST00000561212	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZEB1-222	ENST00000561212	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZEB1-222	ENST00000561212		H3BT86	120 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZEB1-222	ENST00000561212	IGKV2D-28	P01615	120 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZEB1-222	ENST00000561212	PFN2	P35080	140 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZEB1-222	ENST00000561212	ENHO	Q6UWT2	76 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZEB1-222	ENST00000561212	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZEB1-222	ENST00000561212	MUC7	Q8TAX7	377 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZEB1-222	ENST00000561212	KLK12	Q9UKR0	248 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ZEB1-222	ENST00000561212	TENM2	Q9NT68	2774 aa		5	□□□□□ -1.61
ZEB1-222	ENST00000561212	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ZEB1-222	ENST00000561212	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
ZEB1-222	ENST00000561212	C2orf82	Q6UX34	121 aa		5	□□□□□ -1.61
ZEB1-222	ENST00000561212	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		5	□□□□□ -1.61
ZEB1-222	ENST00000561212	CLEC2B	Q92478	149 aa		5	□□□□□ -1.61
ZEB1-222	ENST00000561212	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ZEB1-222	ENST00000561212	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ZEB1-222	ENST00000561212		H3BS24	57 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ZEB1-222	ENST00000561212	SPAG11B	Q08648	103 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ZEB1-222	ENST00000561212	ESRG	Q1W209	222 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ZEB1-222	ENST00000561212	CARD19	Q96LW7	228 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ZEB1-222	ENST00000561212	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ZEB1-222	ENST00000561212	NDUFC2	O95298	119 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZEB1-222	ENST00000561212	TRAC	P01848	142 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZEB1-222	ENST00000561212	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZEB1-222	ENST00000561212	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZEB1-222	ENST00000561212	UBE2W	Q96B02	151 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZEB1-222	ENST00000561212	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ZEB1-222	ENST00000561212	LYST	Q99698	3801 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZEB1-222	ENST00000561212	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZEB1-222	ENST00000561212	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZEB1-222	ENST00000561212	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ZEB1-222	ENST00000561212	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ZEB1-222	ENST00000561212	TG	P01266	2768 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ZEB1-222	ENST00000561212		H0YGX0	51 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ZEB1-222	ENST00000561212	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ZEB1-222	ENST00000561212	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ZEB1-222	ENST00000561212	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ZEB1-222	ENST00000561212	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ZEB1-222	ENST00000561212	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-222	ENST00000561212		F8WDY8	70 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-222	ENST00000561212	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-222	ENST00000561212	C6orf223	Q8N319	242 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-222	ENST00000561212	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-222	ENST00000561212	UPK3B	Q9BT76	320 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-222	ENST00000561212	CDIP1	Q9H305	208 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-222	ENST00000561212	APLN	Q9ULZ1	77 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-222	ENST00000561212	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ZEB1-222	ENST00000561212	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-222	ENST00000561212	PCP4	P48539	62 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-222	ENST00000561212	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-222	ENST00000561212	C2orf48	Q96LS8	159 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-222	ENST00000561212	SIGMAR1	Q99720	223 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-222	ENST00000561212	TMEM126A	Q9H061	195 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-222	ENST00000561212	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ZEB1-222	ENST00000561212	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZEB1-222	ENST00000561212	C15orf56	Q8N910	161 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZEB1-222	ENST00000561212	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZEB1-222	ENST00000561212	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZEB1-222	ENST00000561212	FAM240A	A0A1B0GVK7	77 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZEB1-222	ENST00000561212		A0A1B0GX51	115 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZEB1-222	ENST00000561212	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZEB1-222	ENST00000561212	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZEB1-222	ENST00000561212	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ZEB1-222	ENST00000561212		A0A087WYN8	130 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZEB1-222	ENST00000561212	DNAL4	O96015	105 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZEB1-222	ENST00000561212	SCGB1A1	P11684	91 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZEB1-222	ENST00000561212	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ZEB1-222	ENST00000561212		Q8NDZ9	215 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZEB1-222	ENST00000561212	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZEB1-222	ENST00000561212	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZEB1-222	ENST00000561212	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZEB1-222	ENST00000561212	IGLV6-57	P01721	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZEB1-222	ENST00000561212	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZEB1-222	ENST00000561212	LINC00167	Q96N53	147 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZEB1-222	ENST00000561212	C22orf24	Q9Y442	160 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZEB1-222	ENST00000561212	NCR3	O14931	201 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZEB1-222	ENST00000561212	LECT2	O14960	151 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZEB1-222	ENST00000561212	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZEB1-222	ENST00000561212		Q9HAA7	133 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZEB1-222	ENST00000561212	NUPR2	A6NF83	97 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZEB1-222	ENST00000561212	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZEB1-222	ENST00000561212	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZEB1-222	ENST00000561212	XG	P55808	180 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZEB1-222	ENST00000561212		Q6ZRU5	148 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZEB1-222	ENST00000561212	RMI2	Q96E14	147 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZEB1-222	ENST00000561212	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZEB1-222	ENST00000561212	ACYP1	P07311	99 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB1-222	ENST00000561212	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ZEB1-222	ENST00000561212	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB1-222	ENST00000561212	SNCG	O76070	127 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB1-222	ENST00000561212	MT-ATP8	P03928	68 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB1-222	ENST00000561212	VPREB1	P12018	145 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB1-222	ENST00000561212	SYCN	Q0VAF6	134 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB1-222	ENST00000561212	C6orf99	Q4VX62	202 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB1-222	ENST00000561212		Q8N814	137 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB1-222	ENST00000561212	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB1-222	ENST00000561212	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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