RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555562.1

FOXN3-AS1-201, FOXN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN3-AS1, Length 1,077 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HIST3H2BBQ8N257 126 aa11.8□□□□□ -0.52
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGLV7-43P04211 117 aa11.79□□□□□ -0.52
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 COX17Q14061 63 aa11.79□□□□□ -0.52
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TP73-AS1Q9UF72 201 aa11.79□□□□□ -0.52
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PFN2P35080 140 aa11.78□□□□□ -0.52
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ERG28Q9UKR5 140 aa11.78□□□□□ -0.52
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C22orf24Q9Y442 160 aa11.78□□□□□ -0.52
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NKAPP1Q8N9T2 125 aa11.77□□□□□ -0.53
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LEPROTO15243 131 aa11.76□□□□□ -0.53
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TSPEAR-AS2P59090 65 aa11.76□□□□□ -0.53
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRR26Q8N8Z3 221 aa11.76□□□□□ -0.53
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HIST1H2BLQ99880 126 aa11.75□□□□□ -0.53
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 H0Y9J4 135 aa11.74□□□□□ -0.53
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRTDAPP60985 99 aa11.74□□□□□ -0.53
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HERVK_113P61574 105 aa11.73□□□□□ -0.53
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa11.73□□□□□ -0.53
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PLEKHB2Q96CS7 222 aa11.73□□□□□ -0.53
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 E9PLD3 99 aa11.72□□□□□ -0.53
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 J3QQQ9 107 aa11.72□□□□□ -0.53
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 S100A6P06703 90 aa11.72□□□□□ -0.53
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RPL24P83731 157 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NDUFA12Q9UI09 145 aa11.72□□□□□ -0.53
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C5orf52A6NGY3 159 aa11.71□□□□□ -0.53
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LINC00587B1AMM8 73 aa11.71□□□□□ -0.53
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LINC00158P58513 81 aa11.71□□□□□ -0.53
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HERV-K104P63124 156 aa11.71□□□□□ -0.53
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa11.7□□□□□ -0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa11.7□□□□□ -0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa11.7□□□□□ -0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa11.69□□□□□ -0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 S100A2P29034 98 aa11.69□□□□□ -0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NMUP48645 174 aa11.68□□□□□ -0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MEIG1Q5JSS6 88 aa11.68□□□□□ -0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LINC00167Q96N53 147 aa11.68□□□□□ -0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C20orf202A1L168 122 aa11.66□□□□□ -0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GAGE10A6NGK3 116 aa11.66□□□□□ -0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa11.66□□□□□ -0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RPL37AP8A6NKH3 93 aa11.65□□□□□ -0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SMIM13P0DJ93 91 aa11.65□□□□□ -0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa11.64□□□□□ -0.55
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BCE1O60756 84 aa11.64□□□□□ -0.55
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RPL28P46779 137 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF861PO60384 105 aa11.63□□□□□ -0.55
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AKR1D1P51857 326 aa11.63□□□□□ -0.55
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 Q8NDZ9 215 aa11.63□□□□□ -0.55
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A0A0U1RRA0 63 aa11.62□□□□□ -0.55
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 VPREB1P12018 145 aa11.62□□□□□ -0.55
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa11.61□□□□□ -0.55
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MUC2Q02817 5179 aa11.6□□□□□ -0.55
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa11.6□□□□□ -0.55
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A0A0J9YXY3 114 aa11.6□□□□□ -0.55
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UBE2AP49459 152 aa11.6□□□□□ -0.55
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ANKRD39Q53RE8 183 aa11.6□□□□□ -0.55
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ARL17AQ8IVW1 177 aa11.6□□□□□ -0.55
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ATOH7Q8N100 152 aa11.6□□□□□ -0.55
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa11.59□□□□□ -0.55
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGKV2D-28P01615 120 aa11.59□□□□□ -0.55
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRR4Q16378 134 aa11.58□□□□□ -0.56
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TTTY13Q9BZ97 58 aa11.57□□□□□ -0.56
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 M0R378 163 aa11.56□□□□□ -0.56
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BOD1L2Q8IYS8 172 aa11.56□□□□□ -0.56
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LITAFQ99732 161 aa11.56□□□□□ -0.56
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa11.55□□□□□ -0.56
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MIEN1Q9BRT3 115 aa11.55□□□□□ -0.56
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF815PA8K554 130 aa11.54□□□□□ -0.56
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 S100A12P80511 92 aa11.54□□□□□ -0.56
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DAND5Q8N907 189 aa11.54□□□□□ -0.56
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TIMM17BO60830 172 aa11.53□□□□□ -0.56
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM126AQ9H061 195 aa11.52□□□□□ -0.57
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa11.51□□□□□ -0.57
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa11.51□□□□□ -0.57
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PCP2Q8IVA1 136 aa11.5□□□□□ -0.57
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NCR3O14931 201 aa11.49□□□□□ -0.57
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM238C9JI98 176 aa11.48□□□□□ -0.57
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SCGB1D1O95968 90 aa11.48□□□□□ -0.57
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRYO14603 147 aa11.47□□□□□ -0.57
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NDUFC2O95298 119 aa11.47□□□□□ -0.57
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TSPAN13O95857 204 aa11.46□□□□□ -0.57
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRLHP81277 87 aa11.45□□□□□ -0.58
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa11.45□□□□□ -0.58
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa11.44□□□□□ -0.58
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HSBP1L1C9JCN9 74 aa11.44□□□□□ -0.58
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CRYGAP11844 174 aa11.44□□□□□ -0.58
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LINC00308Q8TCZ7 52 aa11.44□□□□□ -0.58
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SPANXDQ9BXN6 97 aa11.44□□□□□ -0.58
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SPANXCQ9NY87 97 aa11.44□□□□□ -0.58
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A0A0U1RQV1 116 aa11.43□□□□□ -0.58
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A0A087X002 238 aa11.42□□□□□ -0.58
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa11.42□□□□□ -0.58
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SCGB1D4Q6XE38 83 aa11.42□□□□□ -0.58
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PPDPFQ9H3Y8 114 aa11.42□□□□□ -0.58
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NPC2P61916 151 aa11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms