RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 ACYP1P07311 99 aa4.99□□□□□ -1.61
CS-212ENST00000548567 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CS-212ENST00000548567 HERVK_113P63121 156 aa4.99□□□□□ -1.61
CS-212ENST00000548567 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CS-212ENST00000548567 C5orf38Q86SI9 138 aa4.99□□□□□ -1.61
CS-212ENST00000548567 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa4.99□□□□□ -1.61
CS-212ENST00000548567 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CS-212ENST00000548567 COX6A2Q02221 97 aa4.99□□□□□ -1.61
CS-212ENST00000548567 LELP1Q5T871 98 aa4.99□□□□□ -1.61
CS-212ENST00000548567 AMELXQ99217 191 aa4.99□□□□□ -1.61
CS-212ENST00000548567 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa4.98□□□□□ -1.61
CS-212ENST00000548567 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa4.98□□□□□ -1.61
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CS-212ENST00000548567 PMVKQ15126 192 aa4.98□□□□□ -1.61
CS-212ENST00000548567 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
CS-212ENST00000548567 DNAH17Q9UFH2 4485 aa4.98□□□□□ -1.61
CS-212ENST00000548567 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa4.98□□□□□ -1.61
CS-212ENST00000548567 TSPEAR-AS2P59090 65 aa4.98□□□□□ -1.61
CS-212ENST00000548567 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa4.97□□□□□ -1.61
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CS-212ENST00000548567 SCXQ7RTU7 201 aa4.97□□□□□ -1.61
CS-212ENST00000548567 TMEM141Q96I45 108 aa4.97□□□□□ -1.61
CS-212ENST00000548567 LENEPQ9Y5L5 61 aa4.97□□□□□ -1.61
CS-212ENST00000548567 SDHAF1A6NFY7 115 aa4.97□□□□□ -1.61
CS-212ENST00000548567 H7C423 109 aa4.97□□□□□ -1.61
CS-212ENST00000548567 REG3AQ06141 175 aa4.97□□□□□ -1.61
CS-212ENST00000548567 DPH3P1Q9H4G8 78 aa4.97□□□□□ -1.61
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CS-212ENST00000548567 TRIAP1O43715 76 aa4.96□□□□□ -1.61
CS-212ENST00000548567 INAFM2P0DMQ5 153 aa4.96□□□□□ -1.61
CS-212ENST00000548567 CRYGAP11844 174 aa4.96□□□□□ -1.61
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CS-212ENST00000548567 TOMM7Q9P0U1 55 aa4.96□□□□□ -1.62
CS-212ENST00000548567 H7C2G1 150 aa4.95□□□□□ -1.62
CS-212ENST00000548567 COX6CP09669 75 aa4.95□□□□□ -1.62
CS-212ENST00000548567 GAGE2AQ6NT46 116 aa4.95□□□□□ -1.62
CS-212ENST00000548567 MUSTN1Q8IVN3 82 aa4.95□□□□□ -1.62
CS-212ENST00000548567 TIMM17AQ99595 171 aa4.95□□□□□ -1.62
CS-212ENST00000548567 TMEM223A0PJW6 202 aa4.95□□□□□ -1.62
CS-212ENST00000548567 IGIPA6NJ69 53 aa4.95□□□□□ -1.62
CS-212ENST00000548567 Q8N814 137 aa4.95□□□□□ -1.62
CS-212ENST00000548567 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa4.95□□□□□ -1.62
CS-212ENST00000548567 LINC00467Q9BRT7 94 aa4.95□□□□□ -1.62
CS-212ENST00000548567 TSHBP01222 138 aa4.95□□□□□ -1.62
CS-212ENST00000548567 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CS-212ENST00000548567 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa4.94□□□□□ -1.62
CS-212ENST00000548567 FAM229AH3BQW9 127 aa4.94□□□□□ -1.62
CS-212ENST00000548567 M0QY20 66 aa4.94□□□□□ -1.62
CS-212ENST00000548567 LST1O00453 97 aa4.94□□□□□ -1.62
CS-212ENST00000548567 LINC01556Q5JQF7 62 aa4.94□□□□□ -1.62
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CS-212ENST00000548567 TMEM243Q9BU79 118 aa4.94□□□□□ -1.62
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CS-212ENST00000548567 ATOX1O00244 68 aa4.93□□□□□ -1.62
CS-212ENST00000548567 TMEM258P61165 79 aa4.93□□□□□ -1.62
CS-212ENST00000548567 A0A0U1RRA0 63 aa4.93□□□□□ -1.62
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CS-212ENST00000548567 LRP2P98164 4655 aa4.93□□□□□ -1.62
CS-212ENST00000548567 C20orf203Q8NBC4 194 aa4.93□□□□□ -1.62
CS-212ENST00000548567 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa4.92□□□□□ -1.62
CS-212ENST00000548567 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
CS-212ENST00000548567 UPK3BQ9BT76 320 aa4.92□□□□□ -1.62
CS-212ENST00000548567 TRACP01848 142 aa4.92□□□□□ -1.62
CS-212ENST00000548567 Q8N1X5 172 aa4.92□□□□□ -1.62
CS-212ENST00000548567 A0A0J9YXY3 114 aa4.91□□□□□ -1.62
CS-212ENST00000548567 MALP21145 153 aa4.91□□□□□ -1.62
CS-212ENST00000548567 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
CS-212ENST00000548567 SLPIP03973 132 aa4.91□□□□□ -1.62
CS-212ENST00000548567 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
CS-212ENST00000548567 SMCR5Q8TEV8 140 aa4.91□□□□□ -1.62
CS-212ENST00000548567 DNAH8Q96JB1 4490 aa4.91□□□□□ -1.62
CS-212ENST00000548567 H3BNG1 76 aa4.9□□□□□ -1.62
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CS-212ENST00000548567 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.62
CS-212ENST00000548567 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.62
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CS-212ENST00000548567 CLEC2BQ92478 149 aa4.9□□□□□ -1.63
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CS-212ENST00000548567 MIAQ16674 131 aa4.89□□□□□ -1.63
CS-212ENST00000548567 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
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CS-212ENST00000548567 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa4.88□□□□□ -1.63
CS-212ENST00000548567 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa4.88□□□□□ -1.63
CS-212ENST00000548567 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa4.88□□□□□ -1.63
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CS-212ENST00000548567 TIMM17BO60830 172 aa4.88□□□□□ -1.63
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