RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526481.6

CTSB-211, Transcript of cathepsin B, humanhuman

TSL 5

Gene CTSB, Length 660 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CTSB-211ENST00000526481 PTTG1IPP53801 180 aa9.25□□□□□ -0.93
CTSB-211ENST00000526481 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa9.25□□□□□ -0.93
CTSB-211ENST00000526481 SCGB1D4Q6XE38 83 aa9.25□□□□□ -0.93
CTSB-211ENST00000526481 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa9.25□□□□□ -0.93
CTSB-211ENST00000526481 PRO1933Q9H354 126 aa9.25□□□□□ -0.93
CTSB-211ENST00000526481 XAGE1AQ9HD64 81 aa9.25□□□□□ -0.93
CTSB-211ENST00000526481 FAM30AQ9NZY2 134 aa9.25□□□□□ -0.93
CTSB-211ENST00000526481 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
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CTSB-211ENST00000526481 LINC00518Q8N0U6 118 aa9.24□□□□□ -0.93
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CTSB-211ENST00000526481 CTAG1AP78358 180 aa9.05□□□□□ -0.96
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CTSB-211ENST00000526481 LINC00337Q8N6G1 96 aa9.04□□□□□ -0.96
CTSB-211ENST00000526481 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa9.03□□□□□ -0.96
CTSB-211ENST00000526481 RPL37AP8A6NKH3 93 aa9.03□□□□□ -0.96
CTSB-211ENST00000526481 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
CTSB-211ENST00000526481 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa9.02□□□□□ -0.97
CTSB-211ENST00000526481 UBE2BP63146 152 aa9.02□□□□□ -0.97
CTSB-211ENST00000526481 FAT1Q14517 4588 aa9.02□□□□□ -0.97
CTSB-211ENST00000526481 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
CTSB-211ENST00000526481 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa9□□□□□ -0.97
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