RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524534.5

PTPRK-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 2,441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP10-3P60369 221 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRK-217ENST00000524534 SPAG11BQ08648 103 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRK-217ENST00000524534 DSCR8Q96T75 97 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRK-217ENST00000524534 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRK-217ENST00000524534 OXTP01178 125 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRK-217ENST00000524534 CYSRT1A8MQ03 144 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRK-217ENST00000524534 M0R2N4 97 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRK-217ENST00000524534 BCE1O60756 84 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRK-217ENST00000524534 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRK-217ENST00000524534 DEFB4AO15263 64 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRK-217ENST00000524534 H3BQ85 93 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRK-217ENST00000524534 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
PTPRK-217ENST00000524534 DAD1P61803 113 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRK-217ENST00000524534 C9orf66Q5T8R8 295 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRK-217ENST00000524534 Q6ZQY7 126 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRK-217ENST00000524534 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
PTPRK-217ENST00000524534 C5orf47Q569G3 176 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRK-217ENST00000524534 PDE6GP18545 87 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRK-217ENST00000524534 DEFB135Q30KP9 77 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRK-217ENST00000524534 LELP1Q5T871 98 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRK-217ENST00000524534 Q6ZVQ6 151 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRK-217ENST00000524534 SPATA3Q8NHX4 192 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRK-217ENST00000524534 PRR34Q9NV39 138 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRK-217ENST00000524534 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
PTPRK-217ENST00000524534 C20orf197Q8N268 126 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRK-217ENST00000524534 TRAV7A0A075B6U4 112 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRK-217ENST00000524534 CELA1Q9UNI1 258 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRK-217ENST00000524534 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRK-217ENST00000524534 CXCL6P80162 114 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRK-217ENST00000524534 HAMPP81172 84 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRK-217ENST00000524534 DIRC1Q969H9 104 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRK-217ENST00000524534 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRK-217ENST00000524534 KLK12Q9UKR0 248 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRK-217ENST00000524534 MTORP42345 2549 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRK-217ENST00000524534 Q8NAQ8 132 aa7.71□□□□□ -1.17
PTPRK-217ENST00000524534 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.71□□□□□ -1.18
PTPRK-217ENST00000524534 APOC4P55056 127 aa7.71□□□□□ -1.18
PTPRK-217ENST00000524534 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
PTPRK-217ENST00000524534 ACANP16112 2415 aa7.71□□□□□ -1.18
PTPRK-217ENST00000524534 PDZD2O15018 2839 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRK-217ENST00000524534 TRAV10A0A0B4J240 114 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRK-217ENST00000524534 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
PTPRK-217ENST00000524534 MIFP14174 115 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRK-217ENST00000524534 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
PTPRK-217ENST00000524534 XAGE1AQ9HD64 81 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRK-217ENST00000524534 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRK-217ENST00000524534 H7BZZ5 65 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRK-217ENST00000524534 COX7BP24311 80 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRK-217ENST00000524534 Q5XG85 94 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRK-217ENST00000524534 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRK-217ENST00000524534 FAM236CP0DP71 79 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRK-217ENST00000524534 KLKP1Q107X0 134 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRK-217ENST00000524534 SPART-AS1P0CW21 52 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRK-217ENST00000524534 HTN3P15516 51 aa7.67□□□□□ -1.18
PTPRK-217ENST00000524534 EPM2AB3EWF7 344 aa7.67□□□□□ -1.18
PTPRK-217ENST00000524534 VPREB1P12018 145 aa7.67□□□□□ -1.18
PTPRK-217ENST00000524534 C4orf26Q17RF5 130 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRK-217ENST00000524534 M0R378 163 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRK-217ENST00000524534 SERP1Q9Y6X1 66 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRK-217ENST00000524534 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRK-217ENST00000524534 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRK-217ENST00000524534 SMR3AQ99954 134 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRK-217ENST00000524534 VWFP04275 2813 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRK-217ENST00000524534 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRK-217ENST00000524534 SCXQ7RTU7 201 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRK-217ENST00000524534 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRK-217ENST00000524534 RMI2Q96E14 147 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRK-217ENST00000524534 SNURFQ9Y675 71 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRK-217ENST00000524534 WIPF1O43516 503 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRK-217ENST00000524534 HRCT1Q6UXD1 115 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRK-217ENST00000524534 Q6ZRU5 148 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRK-217ENST00000524534 TM2D3Q9BRN9 247 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRK-217ENST00000524534 WFDC10BQ8IUB3 73 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRK-217ENST00000524534 HIVEP2P31629 2446 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRK-217ENST00000524534 TENM4Q6N022 2769 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRK-217ENST00000524534 F8WEM9 126 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRK-217ENST00000524534 C15orf56Q8N910 161 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRK-217ENST00000524534 NDUFC1O43677 76 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRK-217ENST00000524534 NREPQ16612 68 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRK-217ENST00000524534 ITPR2Q14571 2701 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRK-217ENST00000524534 H3BNG1 76 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRK-217ENST00000524534 BPY2O14599 106 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRK-217ENST00000524534 ERC2-IT1O76042 136 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRK-217ENST00000524534 Q6ZRP5 223 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRK-217ENST00000524534 IGKV4-1P06312 121 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRK-217ENST00000524534 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRK-217ENST00000524534 Q8N9L7 120 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRK-217ENST00000524534 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRK-217ENST00000524534 F8WDY8 70 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRK-217ENST00000524534 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRK-217ENST00000524534 TMEM254Q8TBM7 123 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRK-217ENST00000524534 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRK-217ENST00000524534 Q8N377 158 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRK-217ENST00000524534 OCR1Q9BZK8 76 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRK-217ENST00000524534 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRK-217ENST00000524534 ESRGQ1W209 222 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRK-217ENST00000524534 C1orf43Q9BWL3 253 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRK-217ENST00000524534 HIVEP1P15822 2718 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRK-217ENST00000524534 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.9 ms