RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513274.5

COPB2-211, Transcript of coatomer protein complex subunit beta 2, humanhuman

TSL 3

Gene COPB2, Length 729 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2-211ENST00000513274 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
COPB2-211ENST00000513274 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.65□□□□□ -1.34
COPB2-211ENST00000513274 TMEM126AQ9H061 195 aa6.64□□□□□ -1.35
COPB2-211ENST00000513274 CDIP1Q9H305 208 aa6.64□□□□□ -1.35
COPB2-211ENST00000513274 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.64□□□□□ -1.35
COPB2-211ENST00000513274 VPREB1P12018 145 aa6.63□□□□□ -1.35
COPB2-211ENST00000513274 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
COPB2-211ENST00000513274 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.63□□□□□ -1.35
COPB2-211ENST00000513274 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.63□□□□□ -1.35
COPB2-211ENST00000513274 Q8NDZ9 215 aa6.63□□□□□ -1.35
COPB2-211ENST00000513274 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.63□□□□□ -1.35
COPB2-211ENST00000513274 ERG28Q9UKR5 140 aa6.63□□□□□ -1.35
COPB2-211ENST00000513274 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
COPB2-211ENST00000513274 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.62□□□□□ -1.35
COPB2-211ENST00000513274 COLCA2A8K830 154 aa6.62□□□□□ -1.35
COPB2-211ENST00000513274 H0Y8G0 127 aa6.62□□□□□ -1.35
COPB2-211ENST00000513274 ATP6V1G1O75348 118 aa6.62□□□□□ -1.35
COPB2-211ENST00000513274 IGLC3P0DOY3 106 aa6.62□□□□□ -1.35
COPB2-211ENST00000513274 A0A096LNJ9 63 aa6.61□□□□□ -1.35
COPB2-211ENST00000513274 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.61□□□□□ -1.35
COPB2-211ENST00000513274 A0A0U1RRA0 63 aa6.61□□□□□ -1.35
COPB2-211ENST00000513274 M0R378 163 aa6.61□□□□□ -1.35
COPB2-211ENST00000513274 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
COPB2-211ENST00000513274 SFTA2Q6UW10 78 aa6.61□□□□□ -1.35
COPB2-211ENST00000513274 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.61□□□□□ -1.35
COPB2-211ENST00000513274 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.61□□□□□ -1.35
COPB2-211ENST00000513274 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.61□□□□□ -1.35
COPB2-211ENST00000513274 TRGC2P03986 189 aa6.6□□□□□ -1.35
COPB2-211ENST00000513274 C11orf86A6NJI1 115 aa6.59□□□□□ -1.35
COPB2-211ENST00000513274 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.59□□□□□ -1.35
COPB2-211ENST00000513274 LEPROTL1O95214 131 aa6.58□□□□□ -1.36
COPB2-211ENST00000513274 LINC00158P58513 81 aa6.58□□□□□ -1.36
COPB2-211ENST00000513274 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
COPB2-211ENST00000513274 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.58□□□□□ -1.36
COPB2-211ENST00000513274 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.57□□□□□ -1.36
COPB2-211ENST00000513274 COX17Q14061 63 aa6.57□□□□□ -1.36
COPB2-211ENST00000513274 TPRXLQ17RH7 258 aa6.57□□□□□ -1.36
COPB2-211ENST00000513274 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.57□□□□□ -1.36
COPB2-211ENST00000513274 LINC00310P59036 64 aa6.56□□□□□ -1.36
COPB2-211ENST00000513274 DAND5Q8N907 189 aa6.56□□□□□ -1.36
COPB2-211ENST00000513274 SERF1AO75920 110 aa6.55□□□□□ -1.36
COPB2-211ENST00000513274 FABP4P15090 132 aa6.55□□□□□ -1.36
COPB2-211ENST00000513274 HERVK_113P61574 105 aa6.55□□□□□ -1.36
COPB2-211ENST00000513274 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.55□□□□□ -1.36
COPB2-211ENST00000513274 SPRR4Q96PI1 79 aa6.55□□□□□ -1.36
COPB2-211ENST00000513274 LINC00587B1AMM8 73 aa6.54□□□□□ -1.36
COPB2-211ENST00000513274 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.54□□□□□ -1.36
COPB2-211ENST00000513274 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.54□□□□□ -1.36
COPB2-211ENST00000513274 NCR3O14931 201 aa6.53□□□□□ -1.36
COPB2-211ENST00000513274 SMIM13P0DJ93 91 aa6.53□□□□□ -1.36
COPB2-211ENST00000513274 PLNP26678 52 aa6.53□□□□□ -1.36
COPB2-211ENST00000513274 TMEM223A0PJW6 202 aa6.52□□□□□ -1.37
COPB2-211ENST00000513274 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.52□□□□□ -1.37
COPB2-211ENST00000513274 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.52□□□□□ -1.37
COPB2-211ENST00000513274 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.51□□□□□ -1.37
COPB2-211ENST00000513274 DPM2O94777 84 aa6.51□□□□□ -1.37
COPB2-211ENST00000513274 HERV-K104P63124 156 aa6.51□□□□□ -1.37
COPB2-211ENST00000513274 S100A12P80511 92 aa6.51□□□□□ -1.37
COPB2-211ENST00000513274 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.51□□□□□ -1.37
COPB2-211ENST00000513274 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.51□□□□□ -1.37
COPB2-211ENST00000513274 Q8NBF4 154 aa6.51□□□□□ -1.37
COPB2-211ENST00000513274 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
COPB2-211ENST00000513274 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.5□□□□□ -1.37
COPB2-211ENST00000513274 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
COPB2-211ENST00000513274 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.49□□□□□ -1.37
COPB2-211ENST00000513274 PRYO14603 147 aa6.49□□□□□ -1.37
COPB2-211ENST00000513274 HIST1H2BKO60814 126 aa6.49□□□□□ -1.37
COPB2-211ENST00000513274 IGKCP01834 107 aa6.49□□□□□ -1.37
COPB2-211ENST00000513274 HIST1H2BJP06899 126 aa6.49□□□□□ -1.37
COPB2-211ENST00000513274 S100A1P23297 94 aa6.49□□□□□ -1.37
COPB2-211ENST00000513274 HIST1H2BOP23527 126 aa6.49□□□□□ -1.37
COPB2-211ENST00000513274 HIST1H2BBP33778 126 aa6.49□□□□□ -1.37
COPB2-211ENST00000513274 HIST1H2BDP58876 126 aa6.49□□□□□ -1.37
COPB2-211ENST00000513274 HIST1H2BCP62807 126 aa6.49□□□□□ -1.37
COPB2-211ENST00000513274 CTAG1AP78358 180 aa6.49□□□□□ -1.37
COPB2-211ENST00000513274 HIST2H2BEQ16778 126 aa6.49□□□□□ -1.37
COPB2-211ENST00000513274 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
COPB2-211ENST00000513274 HIST1H2BHQ93079 126 aa6.49□□□□□ -1.37
COPB2-211ENST00000513274 HIST1H2BNQ99877 126 aa6.49□□□□□ -1.37
COPB2-211ENST00000513274 HIST1H2BMQ99879 126 aa6.49□□□□□ -1.37
COPB2-211ENST00000513274 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.49□□□□□ -1.37
COPB2-211ENST00000513274 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.49□□□□□ -1.37
COPB2-211ENST00000513274 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.48□□□□□ -1.37
COPB2-211ENST00000513274 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.47□□□□□ -1.37
COPB2-211ENST00000513274 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.47□□□□□ -1.37
COPB2-211ENST00000513274 LEPROTO15243 131 aa6.47□□□□□ -1.37
COPB2-211ENST00000513274 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.47□□□□□ -1.37
COPB2-211ENST00000513274 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.46□□□□□ -1.38
COPB2-211ENST00000513274 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.46□□□□□ -1.38
COPB2-211ENST00000513274 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
COPB2-211ENST00000513274 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.46□□□□□ -1.38
COPB2-211ENST00000513274 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
COPB2-211ENST00000513274 J3QQQ9 107 aa6.45□□□□□ -1.38
COPB2-211ENST00000513274 ERC2-IT1O76042 136 aa6.45□□□□□ -1.38
COPB2-211ENST00000513274 SPRR1AP35321 89 aa6.45□□□□□ -1.38
COPB2-211ENST00000513274 NMUP48645 174 aa6.45□□□□□ -1.38
COPB2-211ENST00000513274 MOBPQ13875 183 aa6.45□□□□□ -1.38
COPB2-211ENST00000513274 SPINK1P00995 79 aa6.44□□□□□ -1.38
COPB2-211ENST00000513274 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
COPB2-211ENST00000513274 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 168.4 ms