RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	SS18	Q15532	418 aa		3.9	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730	ATXN8	Q156A1	80 aa		3.9	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730	C10orf25	Q5T742	122 aa		3.9	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730	LELP1	Q5T871	98 aa		3.9	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		3.9	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		3.9	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		3.9	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730	ENHO	Q6UWT2	76 aa		3.9	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		3.9	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		3.9	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		3.9	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		3.89	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730	REG3A	Q06141	175 aa		3.89	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		3.89	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730		Q8IZM0	81 aa		3.89	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730	C6orf223	Q8N319	242 aa		3.89	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		3.89	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730	COX7A2L	O14548	114 aa		3.88	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		3.88	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		3.88	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		3.88	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730	PRR34	Q9NV39	138 aa		3.88	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730	KLK12	Q9UKR0	248 aa		3.88	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730	APLN	Q9ULZ1	77 aa		3.88	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		3.87	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		3.87	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730	LY6G6C	O95867	125 aa		3.87	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730	MT-ATP8	P03928	68 aa		3.87	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730	XG	P55808	180 aa		3.87	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730	ESRG	Q1W209	222 aa		3.87	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		3.87	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730	SIGMAR1	Q99720	223 aa		3.87	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730		A0A087WYN8	130 aa		3.86	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730		H3BT86	120 aa		3.86	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730		Q8N1X5	172 aa		3.86	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		3.85	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730		H3BNG1	76 aa		3.85	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730	CRP	P02741	224 aa		3.85	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730		Q9HAA7	133 aa		3.85	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		3.84	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730	LCE6A	A0A183	80 aa		3.84	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730		J3QR89	54 aa		3.84	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730	TRAC	P01848	142 aa		3.84	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730	COX6C	P09669	75 aa		3.84	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		3.84	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730	SPAG11B	Q08648	103 aa		3.84	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730	COPS9	Q8WXC6	57 aa		3.84	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730	UBE2W	Q96B02	151 aa		3.84	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		3.84	□□□□□ -1.79
C4BPB-208	ENST00000492730	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
C4BPB-208	ENST00000492730	NCR3	O14931	201 aa		3.83	□□□□□ -1.8
C4BPB-208	ENST00000492730	MAL	P21145	153 aa		3.83	□□□□□ -1.8
C4BPB-208	ENST00000492730	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
C4BPB-208	ENST00000492730	CKS1B	P61024	79 aa		3.83	□□□□□ -1.8
C4BPB-208	ENST00000492730	CFAP161	Q6P656	301 aa		3.83	□□□□□ -1.8
C4BPB-208	ENST00000492730	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		3.83	□□□□□ -1.8
C4BPB-208	ENST00000492730	C15orf56	Q8N910	161 aa		3.83	□□□□□ -1.8
C4BPB-208	ENST00000492730	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		3.83	□□□□□ -1.8
C4BPB-208	ENST00000492730	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		3.83	□□□□□ -1.8
C4BPB-208	ENST00000492730	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		3.83	□□□□□ -1.8
C4BPB-208	ENST00000492730		M0R2N4	97 aa		3.82	□□□□□ -1.8
C4BPB-208	ENST00000492730	CXCL5	P42830	114 aa		3.82	□□□□□ -1.8
C4BPB-208	ENST00000492730	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		3.82	□□□□□ -1.8
C4BPB-208	ENST00000492730	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		3.82	□□□□□ -1.8
C4BPB-208	ENST00000492730	LINC00167	Q96N53	147 aa		3.82	□□□□□ -1.8
C4BPB-208	ENST00000492730	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
C4BPB-208	ENST00000492730	LECT2	O14960	151 aa		3.81	□□□□□ -1.8
C4BPB-208	ENST00000492730	NDUFC2	O95298	119 aa		3.81	□□□□□ -1.8
C4BPB-208	ENST00000492730	COX17	Q14061	63 aa		3.81	□□□□□ -1.8
C4BPB-208	ENST00000492730		Q6ZRU5	148 aa		3.81	□□□□□ -1.8
C4BPB-208	ENST00000492730	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		3.81	□□□□□ -1.8
C4BPB-208	ENST00000492730	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		3.81	□□□□□ -1.8
C4BPB-208	ENST00000492730	SCGB1A1	P11684	91 aa		3.8	□□□□□ -1.8
C4BPB-208	ENST00000492730	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		3.8	□□□□□ -1.8
C4BPB-208	ENST00000492730	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		3.8	□□□□□ -1.8
C4BPB-208	ENST00000492730	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		3.8	□□□□□ -1.8
C4BPB-208	ENST00000492730	TENM2	Q9NT68	2774 aa		3.8	□□□□□ -1.8
C4BPB-208	ENST00000492730		H0YGX0	51 aa		3.79	□□□□□ -1.8
C4BPB-208	ENST00000492730	IGLV6-57	P01721	117 aa		3.79	□□□□□ -1.8
C4BPB-208	ENST00000492730	VPREB1	P12018	145 aa		3.79	□□□□□ -1.8
C4BPB-208	ENST00000492730	TTC32	Q5I0X7	151 aa		3.79	□□□□□ -1.8
C4BPB-208	ENST00000492730	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		3.79	□□□□□ -1.8
C4BPB-208	ENST00000492730	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		3.78	□□□□□ -1.8
C4BPB-208	ENST00000492730	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		3.78	□□□□□ -1.8
C4BPB-208	ENST00000492730	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		3.78	□□□□□ -1.8
C4BPB-208	ENST00000492730	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
C4BPB-208	ENST00000492730	C6orf99	Q4VX62	202 aa		3.78	□□□□□ -1.8
C4BPB-208	ENST00000492730	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		3.78	□□□□□ -1.8
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM240A	A0A1B0GVK7	77 aa		3.77	□□□□□ -1.81
C4BPB-208	ENST00000492730	LINC00575	Q6W349	94 aa		3.77	□□□□□ -1.81
C4BPB-208	ENST00000492730	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		3.77	□□□□□ -1.81
C4BPB-208	ENST00000492730		Q8N814	137 aa		3.77	□□□□□ -1.81

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