RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469717.5

TPM3-215, Transcript of tropomyosin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TPM3, Length 4,041 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3-215ENST00000469717 SCXQ7RTU7 201 aa5.52□□□□□ -1.53
TPM3-215ENST00000469717 Q8NDZ9 215 aa5.52□□□□□ -1.53
TPM3-215ENST00000469717 OVOL2Q9BRP0 275 aa5.52□□□□□ -1.53
TPM3-215ENST00000469717 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
TPM3-215ENST00000469717 WFDC10AQ9H1F0 79 aa5.52□□□□□ -1.53
TPM3-215ENST00000469717 ODF3L2Q3SX64 289 aa5.51□□□□□ -1.53
TPM3-215ENST00000469717 LINC01006Q8NI28 216 aa5.51□□□□□ -1.53
TPM3-215ENST00000469717 HAMPP81172 84 aa5.51□□□□□ -1.53
TPM3-215ENST00000469717 Q8N814 137 aa5.51□□□□□ -1.53
TPM3-215ENST00000469717 C16orf95Q9H693 158 aa5.51□□□□□ -1.53
TPM3-215ENST00000469717 ESM1Q9NQ30 184 aa5.51□□□□□ -1.53
TPM3-215ENST00000469717 EPM2AB3EWF7 344 aa5.51□□□□□ -1.53
TPM3-215ENST00000469717 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
TPM3-215ENST00000469717 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa5.51□□□□□ -1.53
TPM3-215ENST00000469717 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa5.5□□□□□ -1.53
TPM3-215ENST00000469717 A0A096LPF7 62 aa5.49□□□□□ -1.53
TPM3-215ENST00000469717 F8WEM9 126 aa5.49□□□□□ -1.53
TPM3-215ENST00000469717 C6orf99Q4VX62 202 aa5.49□□□□□ -1.53
TPM3-215ENST00000469717 ZNF702PQ9H963 129 aa5.49□□□□□ -1.53
TPM3-215ENST00000469717 UBL5Q9BZL1 73 aa5.49□□□□□ -1.53
TPM3-215ENST00000469717 Q8N3U1 123 aa5.48□□□□□ -1.53
TPM3-215ENST00000469717 TENM4Q6N022 2769 aa5.48□□□□□ -1.53
TPM3-215ENST00000469717 A0A087WZ39 114 aa5.48□□□□□ -1.53
TPM3-215ENST00000469717 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa5.48□□□□□ -1.53
TPM3-215ENST00000469717 DEFB114Q30KQ6 69 aa5.48□□□□□ -1.53
TPM3-215ENST00000469717 OXLD1Q5BKU9 147 aa5.48□□□□□ -1.53
TPM3-215ENST00000469717 TM2D3Q9BRN9 247 aa5.48□□□□□ -1.53
TPM3-215ENST00000469717 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
TPM3-215ENST00000469717 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa5.47□□□□□ -1.53
TPM3-215ENST00000469717 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa5.47□□□□□ -1.53
TPM3-215ENST00000469717 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa5.47□□□□□ -1.53
TPM3-215ENST00000469717 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa5.46□□□□□ -1.53
TPM3-215ENST00000469717 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa5.46□□□□□ -1.54
TPM3-215ENST00000469717 PLAC8L1A1L4L8 177 aa5.46□□□□□ -1.54
TPM3-215ENST00000469717 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa5.46□□□□□ -1.54
TPM3-215ENST00000469717 Q6ZQT0 140 aa5.46□□□□□ -1.54
TPM3-215ENST00000469717 Q6ZVQ6 151 aa5.46□□□□□ -1.54
TPM3-215ENST00000469717 LINC00167Q96N53 147 aa5.46□□□□□ -1.54
TPM3-215ENST00000469717 FAM229BQ4G0N7 80 aa5.45□□□□□ -1.54
TPM3-215ENST00000469717 S100A7L2Q5SY68 101 aa5.45□□□□□ -1.54
TPM3-215ENST00000469717 Q8N9L7 120 aa5.45□□□□□ -1.54
TPM3-215ENST00000469717 VWFP04275 2813 aa5.45□□□□□ -1.54
TPM3-215ENST00000469717 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
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TPM3-215ENST00000469717 TRAV7A0A075B6U4 112 aa5.45□□□□□ -1.54
TPM3-215ENST00000469717 Q6ZRU5 148 aa5.45□□□□□ -1.54
TPM3-215ENST00000469717 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa5.45□□□□□ -1.54
TPM3-215ENST00000469717 MPLKIPQ8TAP9 179 aa5.45□□□□□ -1.54
TPM3-215ENST00000469717 KLKP1Q107X0 134 aa5.43□□□□□ -1.54
TPM3-215ENST00000469717 Q6ZQY7 126 aa5.43□□□□□ -1.54
TPM3-215ENST00000469717 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa5.43□□□□□ -1.54
TPM3-215ENST00000469717 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
TPM3-215ENST00000469717 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
TPM3-215ENST00000469717 C6orf223Q8N319 242 aa5.43□□□□□ -1.54
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TPM3-215ENST00000469717 C4orf3Q8WVX3 66 aa5.41□□□□□ -1.54
TPM3-215ENST00000469717 KIAA0087Q14695 138 aa5.4□□□□□ -1.54
TPM3-215ENST00000469717 C11orf45Q8TAV5 145 aa5.4□□□□□ -1.54
TPM3-215ENST00000469717 Q8IZM0 81 aa5.4□□□□□ -1.55
TPM3-215ENST00000469717 GYPEP15421 78 aa5.39□□□□□ -1.55
TPM3-215ENST00000469717 DAD1P61803 113 aa5.39□□□□□ -1.55
TPM3-215ENST00000469717 C9orf66Q5T8R8 295 aa5.39□□□□□ -1.55
TPM3-215ENST00000469717 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa5.39□□□□□ -1.55
TPM3-215ENST00000469717 LRCOL1A6NCL2 159 aa5.39□□□□□ -1.55
TPM3-215ENST00000469717 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa5.39□□□□□ -1.55
TPM3-215ENST00000469717 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa5.39□□□□□ -1.55
TPM3-215ENST00000469717 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
TPM3-215ENST00000469717 MIFP14174 115 aa5.39□□□□□ -1.55
TPM3-215ENST00000469717 MUC7Q8TAX7 377 aa5.39□□□□□ -1.55
TPM3-215ENST00000469717 XAGE1AQ9HD64 81 aa5.38□□□□□ -1.55
TPM3-215ENST00000469717 BPY2O14599 106 aa5.38□□□□□ -1.55
TPM3-215ENST00000469717 NREPQ16612 68 aa5.38□□□□□ -1.55
TPM3-215ENST00000469717 APOC4P55056 127 aa5.38□□□□□ -1.55
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TPM3-215ENST00000469717 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa5.37□□□□□ -1.55
TPM3-215ENST00000469717 TMEM254Q8TBM7 123 aa5.37□□□□□ -1.55
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TPM3-215ENST00000469717 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa5.36□□□□□ -1.55
TPM3-215ENST00000469717 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
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TPM3-215ENST00000469717 CD164L2Q6UWJ8 174 aa5.35□□□□□ -1.55
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TPM3-215ENST00000469717 NDUFC1O43677 76 aa5.34□□□□□ -1.55
TPM3-215ENST00000469717 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
TPM3-215ENST00000469717 CXCL6P80162 114 aa5.34□□□□□ -1.55
TPM3-215ENST00000469717 CELA1Q9UNI1 258 aa5.34□□□□□ -1.55
TPM3-215ENST00000469717 C3orf84H3BNL1 204 aa5.34□□□□□ -1.55
TPM3-215ENST00000469717 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa5.34□□□□□ -1.55
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