RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459159.1

SNORD54-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 54, humanhuman

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Gene SNORD54, Length 67 nt, Biotype snoRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD54-201ENST00000459159 NREPQ16612 68 aa-3.21□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 SYPL2Q5VXT5 272 aa-3.21□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP-3.21□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP-3.21□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 AP4S1Q9Y587 144 aa-3.21□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 A0A096LPI6 279 aa-3.22□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 KRBOX1C9JBD0 128 aa-3.22□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 GNG7O60262 68 aa-3.22□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 SFT2D2O95562 160 aa-3.22□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 GAP43P17677 238 aa-3.22□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 YWHAQP27348 245 aa-3.22□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 HBBP68871 147 aa-3.22□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 BST2Q10589 180 aaKnown RBP-3.22□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP-3.22□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 RHEBQ15382 184 aa-3.22□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 FAM74A3Q4VXF1 159 aa-3.22□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 HDDC2Q7Z4H3 204 aa-3.22□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 LINC00301Q8NCQ3 95 aa-3.22□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP-3.22□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 DRC3Q9H069 523 aa-3.22□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 GSKIPQ9P0R6 139 aa-3.22□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 SSR3Q9UNL2 185 aa-3.22□□□□□ -2.92
SNORD54-201ENST00000459159 A6NIZ1 184 aa-3.23□□□□□ -2.93
SNORD54-201ENST00000459159 DISC1C4P0D8 188 aa-3.23□□□□□ -2.93
SNORD54-201ENST00000459159 GOSR2O14653 212 aa-3.23□□□□□ -2.93
SNORD54-201ENST00000459159 GSTA4O15217 222 aa-3.23□□□□□ -2.93
SNORD54-201ENST00000459159 GYPCP04921 128 aa-3.23□□□□□ -2.93
SNORD54-201ENST00000459159 FABP3P05413 133 aa-3.23□□□□□ -2.93
SNORD54-201ENST00000459159 CSN2P05814 226 aa-3.23□□□□□ -2.93
SNORD54-201ENST00000459159 RALAP11233 206 aa-3.23□□□□□ -2.93
SNORD54-201ENST00000459159 RPL39P62891 51 aaKnown RBP-3.23□□□□□ -2.93
SNORD54-201ENST00000459159 UCMAQ8WVF2 138 aa-3.23□□□□□ -2.93
SNORD54-201ENST00000459159 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP-3.23□□□□□ -2.93
SNORD54-201ENST00000459159 TIPINQ9BVW5 301 aa-3.23□□□□□ -2.93
SNORD54-201ENST00000459159 COA1Q9GZY4 146 aa-3.23□□□□□ -2.93
SNORD54-201ENST00000459159 NAPBQ9H115 298 aa-3.23□□□□□ -2.93
SNORD54-201ENST00000459159 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa-3.24□□□□□ -2.93
SNORD54-201ENST00000459159 B4DEV8 164 aa-3.24□□□□□ -2.93
SNORD54-201ENST00000459159 H3BVH4 76 aa-3.24□□□□□ -2.93
SNORD54-201ENST00000459159 VIPP01282 170 aa-3.24□□□□□ -2.93
SNORD54-201ENST00000459159 SFNP31947 248 aa-3.24□□□□□ -2.93
SNORD54-201ENST00000459159 PLAC9Q5JTB6 97 aa-3.24□□□□□ -2.93
SNORD54-201ENST00000459159 LCN1P1Q5VSP4 162 aa-3.24□□□□□ -2.93
SNORD54-201ENST00000459159 UQCC3Q6UW78 93 aa-3.24□□□□□ -2.93
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SNORD54-201ENST00000459159 SCGB3A2Q96PL1 93 aa-3.24□□□□□ -2.93
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SNORD54-201ENST00000459159 C12orf57Q99622 126 aa-3.25□□□□□ -2.93
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SNORD54-201ENST00000459159 GRPEL1Q9HAV7 217 aa-3.25□□□□□ -2.93
SNORD54-201ENST00000459159 SNTNA6NMZ2 147 aa-3.26□□□□□ -2.93
SNORD54-201ENST00000459159 EFCAB9A8MZ26 197 aa-3.26□□□□□ -2.93
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SNORD54-201ENST00000459159 TXNDC9O14530 226 aa-3.26□□□□□ -2.93
SNORD54-201ENST00000459159 CIB2O75838 187 aa-3.26□□□□□ -2.93
SNORD54-201ENST00000459159 HBDP02042 147 aa-3.26□□□□□ -2.93
SNORD54-201ENST00000459159 SERPINB5P36952 375 aa-3.26□□□□□ -2.93
SNORD54-201ENST00000459159 TSPEAR-AS2P59090 65 aa-3.26□□□□□ -2.93
SNORD54-201ENST00000459159 SSTP61278 116 aa-3.26□□□□□ -2.93
SNORD54-201ENST00000459159 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP-3.26□□□□□ -2.93
SNORD54-201ENST00000459159 NME8Q8N427 588 aa-3.26□□□□□ -2.93
SNORD54-201ENST00000459159 CCDC148Q8NFR7 591 aa-3.26□□□□□ -2.93
SNORD54-201ENST00000459159 DYDC1Q8WWB3 177 aa-3.26□□□□□ -2.93
SNORD54-201ENST00000459159 CIB1Q99828 191 aa-3.26□□□□□ -2.93
SNORD54-201ENST00000459159 NACAP1Q9BZK3 213 aa-3.26□□□□□ -2.93
SNORD54-201ENST00000459159 POMPQ9Y244 141 aa-3.26□□□□□ -2.93
SNORD54-201ENST00000459159 TMEM210A6NLX4 147 aa-3.27□□□□□ -2.93
SNORD54-201ENST00000459159 TMCO5BA8MYB1 307 aa-3.27□□□□□ -2.93
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SNORD54-201ENST00000459159 SMIM10L1P0DMW3 83 aa-3.27□□□□□ -2.93
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SNORD54-201ENST00000459159 RBP2P50120 134 aa-3.27□□□□□ -2.93
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SNORD54-201ENST00000459159 CCDC83Q8IWF9 413 aa-3.27□□□□□ -2.93
SNORD54-201ENST00000459159 JAGN1Q8N5M9 183 aa-3.27□□□□□ -2.93
SNORD54-201ENST00000459159 SMIM10Q96HG1 83 aa-3.27□□□□□ -2.93
SNORD54-201ENST00000459159 SCLT1Q96NL6 688 aa-3.27□□□□□ -2.93
SNORD54-201ENST00000459159 A0A1W2PPL8 197 aa-3.28□□□□□ -2.93
SNORD54-201ENST00000459159 K7EMI3 77 aa-3.28□□□□□ -2.93
SNORD54-201ENST00000459159 BIRC5O15392 142 aa-3.28□□□□□ -2.93
SNORD54-201ENST00000459159 ANXA5P08758 320 aa-3.28□□□□□ -2.93
SNORD54-201ENST00000459159 S100A4P26447 101 aaKnown RBP-3.28□□□□□ -2.93
SNORD54-201ENST00000459159 MEIG1Q5JSS6 88 aa-3.28□□□□□ -2.93
SNORD54-201ENST00000459159 MNS1Q8NEH6 495 aa-3.28□□□□□ -2.93
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