RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454996.5

TTC28-AS1-220, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28-AS1, Length 837 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-220ENST00000454996 F8VRH5 84 aa4.53□□□□□ -1.68
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TSPAN13O95857 204 aa4.53□□□□□ -1.68
TTC28-AS1-220ENST00000454996 LINC00167Q96N53 147 aa4.53□□□□□ -1.68
TTC28-AS1-220ENST00000454996 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa4.52□□□□□ -1.69
TTC28-AS1-220ENST00000454996 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa4.52□□□□□ -1.69
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa4.52□□□□□ -1.69
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa4.52□□□□□ -1.69
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KRTDAPP60985 99 aa4.52□□□□□ -1.69
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa4.52□□□□□ -1.69
TTC28-AS1-220ENST00000454996 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
TTC28-AS1-220ENST00000454996 LINC01545Q5VT33 79 aa4.52□□□□□ -1.69
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
TTC28-AS1-220ENST00000454996 COX7B2Q8TF08 81 aa4.52□□□□□ -1.69
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MUC2Q02817 5179 aa4.52□□□□□ -1.69
TTC28-AS1-220ENST00000454996 IGLC3P0DOY3 106 aa4.51□□□□□ -1.69
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PMVKQ15126 192 aa4.51□□□□□ -1.69
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PRR4Q16378 134 aa4.51□□□□□ -1.69
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PET117Q6UWS5 81 aa4.51□□□□□ -1.69
TTC28-AS1-220ENST00000454996 Q8NDZ9 215 aa4.51□□□□□ -1.69
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa4.51□□□□□ -1.69
TTC28-AS1-220ENST00000454996 C11orf86A6NJI1 115 aa4.5□□□□□ -1.69
TTC28-AS1-220ENST00000454996 BCE1O60756 84 aa4.5□□□□□ -1.69
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SEC11AP67812 179 aa4.5□□□□□ -1.69
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa4.5□□□□□ -1.69
TTC28-AS1-220ENST00000454996 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PYY3Q5JQD4 70 aa4.5□□□□□ -1.69
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PMCHL2Q9BQD1 86 aa4.5□□□□□ -1.69
TTC28-AS1-220ENST00000454996 C20orf202A1L168 122 aa4.49□□□□□ -1.69
TTC28-AS1-220ENST00000454996 H0Y8G0 127 aa4.49□□□□□ -1.69
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PLNP26678 52 aa4.49□□□□□ -1.69
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PFN2P35080 140 aa4.49□□□□□ -1.69
TTC28-AS1-220ENST00000454996 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa4.49□□□□□ -1.69
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TP73-AS1Q9UF72 201 aa4.49□□□□□ -1.69
TTC28-AS1-220ENST00000454996 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa4.48□□□□□ -1.69
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TMEM238C9JI98 176 aa4.48□□□□□ -1.69
TTC28-AS1-220ENST00000454996 DPM2O94777 84 aa4.48□□□□□ -1.69
TTC28-AS1-220ENST00000454996 IGKV2D-28P01615 120 aa4.48□□□□□ -1.69
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SMIM6P0DI80 62 aa4.48□□□□□ -1.69
TTC28-AS1-220ENST00000454996 AKR1D1P51857 326 aa4.48□□□□□ -1.69
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
TTC28-AS1-220ENST00000454996 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa4.47□□□□□ -1.69
TTC28-AS1-220ENST00000454996 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa4.47□□□□□ -1.69
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CXCL5P42830 114 aa4.47□□□□□ -1.69
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RPL28P46779 137 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RETNLBQ9BQ08 111 aa4.47□□□□□ -1.69
TTC28-AS1-220ENST00000454996 IGKCP01834 107 aa4.46□□□□□ -1.7
TTC28-AS1-220ENST00000454996 VPREB1P12018 145 aa4.46□□□□□ -1.7
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PRLHP81277 87 aa4.46□□□□□ -1.7
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ATOH7Q8N100 152 aa4.46□□□□□ -1.7
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa4.46□□□□□ -1.7
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TMEM223A0PJW6 202 aa4.45□□□□□ -1.7
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CRYGAP11844 174 aa4.45□□□□□ -1.7
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ANKRD39Q53RE8 183 aa4.45□□□□□ -1.7
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TYMSOSQ8TAI1 123 aa4.45□□□□□ -1.7
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ERG28Q9UKR5 140 aa4.45□□□□□ -1.7
TTC28-AS1-220ENST00000454996 A0A0U1RRA0 63 aa4.44□□□□□ -1.7
TTC28-AS1-220ENST00000454996 H3BRM9 83 aa4.44□□□□□ -1.7
TTC28-AS1-220ENST00000454996 M0R378 163 aa4.44□□□□□ -1.7
TTC28-AS1-220ENST00000454996 UBE2AP49459 152 aa4.44□□□□□ -1.7
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TSPEAR-AS2P59090 65 aa4.44□□□□□ -1.7
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TMEM170BQ5T4T1 132 aa4.44□□□□□ -1.7
TTC28-AS1-220ENST00000454996 NKAPP1Q8N9T2 125 aa4.44□□□□□ -1.7
TTC28-AS1-220ENST00000454996 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa4.43□□□□□ -1.7
TTC28-AS1-220ENST00000454996 E9PLD3 99 aa4.43□□□□□ -1.7
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SCGB1D1O95968 90 aa4.43□□□□□ -1.7
TTC28-AS1-220ENST00000454996 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa4.43□□□□□ -1.7
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TMEM126AQ9H061 195 aa4.43□□□□□ -1.7
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
TTC28-AS1-220ENST00000454996 HERVK_113P61574 105 aa4.42□□□□□ -1.7
TTC28-AS1-220ENST00000454996 C3orf22Q8N5N4 141 aa4.42□□□□□ -1.7
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PLEKHB2Q96CS7 222 aa4.42□□□□□ -1.7
TTC28-AS1-220ENST00000454996 VAMP8Q9BV40 100 aa4.42□□□□□ -1.7
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PAM16Q9Y3D7 125 aa4.42□□□□□ -1.7
TTC28-AS1-220ENST00000454996 LINC00158P58513 81 aa4.41□□□□□ -1.7
TTC28-AS1-220ENST00000454996 LEPROTO15243 131 aa4.4□□□□□ -1.71
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SMIM13P0DJ93 91 aa4.4□□□□□ -1.71
TTC28-AS1-220ENST00000454996 COX17Q14061 63 aa4.4□□□□□ -1.71
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SPATA45Q537H7 98 aa4.4□□□□□ -1.71
TTC28-AS1-220ENST00000454996 LCE2CQ5TA81 110 aa4.4□□□□□ -1.71
TTC28-AS1-220ENST00000454996 LINC00518Q8N0U6 118 aa4.4□□□□□ -1.71
TTC28-AS1-220ENST00000454996 LINC00304Q8N9R0 145 aa4.4□□□□□ -1.71
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SVIPQ8NHG7 77 aa4.4□□□□□ -1.71
TTC28-AS1-220ENST00000454996 C12orf57Q99622 126 aa4.4□□□□□ -1.71
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TTTY13Q9BZ97 58 aa4.4□□□□□ -1.71
TTC28-AS1-220ENST00000454996 HSBP1L1C9JCN9 74 aa4.39□□□□□ -1.71
TTC28-AS1-220ENST00000454996 J3QQQ9 107 aa4.39□□□□□ -1.71
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RPL24P83731 157 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
TTC28-AS1-220ENST00000454996 FAM229BQ4G0N7 80 aa4.39□□□□□ -1.71
TTC28-AS1-220ENST00000454996 NCR3O14931 201 aa4.38□□□□□ -1.71
TTC28-AS1-220ENST00000454996 COX8AP10176 69 aa4.38□□□□□ -1.71
TTC28-AS1-220ENST00000454996 NMUP48645 174 aa4.38□□□□□ -1.71
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PCP2Q8IVA1 136 aa4.38□□□□□ -1.71
TTC28-AS1-220ENST00000454996 DAND5Q8N907 189 aa4.38□□□□□ -1.71
TTC28-AS1-220ENST00000454996 HIGD2AQ9BW72 106 aa4.38□□□□□ -1.71
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ZNF815PA8K554 130 aa4.37□□□□□ -1.71
TTC28-AS1-220ENST00000454996 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.9 ms