RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
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RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM141Q96I45 108 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-205ENST00000450873 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-205ENST00000450873 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-205ENST00000450873 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa7□□□□□ -1.29
RABGEF1-205ENST00000450873 HERVK_113P63121 156 aa7□□□□□ -1.29
RABGEF1-205ENST00000450873 TIMM17AQ99595 171 aa7□□□□□ -1.29
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RABGEF1-205ENST00000450873 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
RABGEF1-205ENST00000450873 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGEF1-205ENST00000450873 C14orf177Q52M58 125 aa6.99□□□□□ -1.29
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RABGEF1-205ENST00000450873 A0A0B4J2C4 111 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGEF1-205ENST00000450873 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGEF1-205ENST00000450873 C11orf86A6NJI1 115 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGEF1-205ENST00000450873 XCL1P47992 114 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGEF1-205ENST00000450873 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.98□□□□□ -1.29
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RABGEF1-205ENST00000450873 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.98□□□□□ -1.29
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RABGEF1-205ENST00000450873 USP17L23D6RBM5 183 aa6.97□□□□□ -1.29
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RABGEF1-205ENST00000450873 COX7CP15954 63 aa6.94□□□□□ -1.3
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RABGEF1-205ENST00000450873 J3QQQ9 107 aa6.94□□□□□ -1.3
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RABGEF1-205ENST00000450873 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-205ENST00000450873 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-205ENST00000450873 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-205ENST00000450873 MALP21145 153 aa6.93□□□□□ -1.3
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RABGEF1-205ENST00000450873 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.92□□□□□ -1.3
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RABGEF1-205ENST00000450873 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.89□□□□□ -1.31
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RABGEF1-205ENST00000450873 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.87□□□□□ -1.31
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RABGEF1-205ENST00000450873 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.87□□□□□ -1.31
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RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
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RABGEF1-205ENST00000450873 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-205ENST00000450873 SYCNQ0VAF6 134 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-205ENST00000450873 EPM2AB3EWF7 344 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-205ENST00000450873 LST1O00453 97 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-205ENST00000450873 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-205ENST00000450873 PRSS2P07478 247 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-205ENST00000450873 LITAFQ99732 161 aa6.84□□□□□ -1.31
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