RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444502.5

TOP3B-210, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 4,163 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-210ENST00000444502 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa7.47□□□□□ -1.21
TOP3B-210ENST00000444502 CELA1Q9UNI1 258 aa7.47□□□□□ -1.21
TOP3B-210ENST00000444502 FHL2Q14192 279 aa7.47□□□□□ -1.21
TOP3B-210ENST00000444502 CELSR2Q9HCU4 2923 aa7.47□□□□□ -1.21
TOP3B-210ENST00000444502 KRTAP1-1Q07627 177 aa7.46□□□□□ -1.21
TOP3B-210ENST00000444502 LELP1Q5T871 98 aa7.46□□□□□ -1.22
TOP3B-210ENST00000444502 LINC00846Q9NV44 126 aa7.46□□□□□ -1.22
TOP3B-210ENST00000444502 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.45□□□□□ -1.22
TOP3B-210ENST00000444502 F8WDY8 70 aa7.45□□□□□ -1.22
TOP3B-210ENST00000444502 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.45□□□□□ -1.22
TOP3B-210ENST00000444502 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP7.45□□□□□ -1.222e-6■■■■□ 19.3
TOP3B-210ENST00000444502 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.45□□□□□ -1.22
TOP3B-210ENST00000444502 OXTP01178 125 aa7.45□□□□□ -1.22
TOP3B-210ENST00000444502 NF1P21359 2839 aa7.45□□□□□ -1.22
TOP3B-210ENST00000444502 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa7.45□□□□□ -1.22
TOP3B-210ENST00000444502 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa7.45□□□□□ -1.22
TOP3B-210ENST00000444502 C2orf48Q96LS8 159 aa7.45□□□□□ -1.22
TOP3B-210ENST00000444502 UPK3BQ9BT76 320 aa7.44□□□□□ -1.22
TOP3B-210ENST00000444502 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.43□□□□□ -1.22
TOP3B-210ENST00000444502 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.43□□□□□ -1.22
TOP3B-210ENST00000444502 SERP1Q9Y6X1 66 aa7.43□□□□□ -1.22
TOP3B-210ENST00000444502 Q5XG85 94 aa7.42□□□□□ -1.22
TOP3B-210ENST00000444502 WFDC10BQ8IUB3 73 aa7.42□□□□□ -1.22
TOP3B-210ENST00000444502 KRTAP10-3P60369 221 aa7.42□□□□□ -1.22
TOP3B-210ENST00000444502 FBN2P35556 2912 aa7.42□□□□□ -1.22
TOP3B-210ENST00000444502 LRCOL1A6NCL2 159 aa7.41□□□□□ -1.22
TOP3B-210ENST00000444502 LINC01561Q8N1V8 128 aa7.41□□□□□ -1.22
TOP3B-210ENST00000444502 OVOL2Q9BRP0 275 aa7.41□□□□□ -1.22
TOP3B-210ENST00000444502 CR1P17927 2039 aa7.41□□□□□ -1.22
TOP3B-210ENST00000444502 Q6JHZ5 121 aa7.41□□□□□ -1.22
TOP3B-210ENST00000444502 CD164L2Q6UWJ8 174 aa7.41□□□□□ -1.22
TOP3B-210ENST00000444502 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.41□□□□□ -1.22
TOP3B-210ENST00000444502 SYCNQ0VAF6 134 aa7.41□□□□□ -1.22
TOP3B-210ENST00000444502 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa7.4□□□□□ -1.22
TOP3B-210ENST00000444502 SCXQ7RTU7 201 aa7.4□□□□□ -1.22
TOP3B-210ENST00000444502 HIGD2AQ9BW72 106 aa7.4□□□□□ -1.22
TOP3B-210ENST00000444502 ORMDL1Q9P0S3 153 aa7.4□□□□□ -1.23
TOP3B-210ENST00000444502 A0A096LNI7 61 aa7.39□□□□□ -1.23
TOP3B-210ENST00000444502 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
TOP3B-210ENST00000444502 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.39□□□□□ -1.23
TOP3B-210ENST00000444502 UBE2AP49459 152 aa7.38□□□□□ -1.23
TOP3B-210ENST00000444502 X6R8D5 127 aa7.38□□□□□ -1.23
TOP3B-210ENST00000444502 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa7.38□□□□□ -1.23
TOP3B-210ENST00000444502 H0YGX0 51 aa7.38□□□□□ -1.23
TOP3B-210ENST00000444502 RPL28P46779 137 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
TOP3B-210ENST00000444502 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.37□□□□□ -1.23
TOP3B-210ENST00000444502 IGKV2D-28P01615 120 aa7.37□□□□□ -1.23
TOP3B-210ENST00000444502 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.37□□□□□ -1.23
TOP3B-210ENST00000444502 A0A087WYN8 130 aa7.37□□□□□ -1.23
TOP3B-210ENST00000444502 A8MTW9 85 aa7.36□□□□□ -1.23
TOP3B-210ENST00000444502 A0A087WZ39 114 aa7.36□□□□□ -1.23
TOP3B-210ENST00000444502 CYSRT1A8MQ03 144 aa7.36□□□□□ -1.23
TOP3B-210ENST00000444502 SPATA3Q8NHX4 192 aa7.36□□□□□ -1.23
TOP3B-210ENST00000444502 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.36□□□□□ -1.23
TOP3B-210ENST00000444502 LYPD5Q6UWN5 251 aa7.36□□□□□ -1.23
TOP3B-210ENST00000444502 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
TOP3B-210ENST00000444502 DIRC1Q969H9 104 aa7.35□□□□□ -1.23
TOP3B-210ENST00000444502 MXRA5Q9NR99 2828 aa7.35□□□□□ -1.23
TOP3B-210ENST00000444502 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
TOP3B-210ENST00000444502 C14orf177Q52M58 125 aa7.34□□□□□ -1.23
TOP3B-210ENST00000444502 Q8N3U1 123 aa7.34□□□□□ -1.23
TOP3B-210ENST00000444502 SMIM11BQ8TCY0 68 aa7.34□□□□□ -1.23
TOP3B-210ENST00000444502 CDK2AP2O75956 126 aa7.34□□□□□ -1.23
TOP3B-210ENST00000444502 NUPR2A6NF83 97 aa7.34□□□□□ -1.24
TOP3B-210ENST00000444502 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.24
TOP3B-210ENST00000444502 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.33□□□□□ -1.24
TOP3B-210ENST00000444502 LITAFQ99732 161 aa7.33□□□□□ -1.24
TOP3B-210ENST00000444502 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
TOP3B-210ENST00000444502 C6orf223Q8N319 242 aa7.33□□□□□ -1.24
TOP3B-210ENST00000444502 MDFIQ99750 246 aa7.32□□□□□ -1.24
TOP3B-210ENST00000444502 RPL37AP8A6NKH3 93 aa7.32□□□□□ -1.24
TOP3B-210ENST00000444502 KRTAP10-11P60412 298 aa7.32□□□□□ -1.24
TOP3B-210ENST00000444502 PMAIP1Q13794 54 aa7.32□□□□□ -1.24
TOP3B-210ENST00000444502 C6orf99Q4VX62 202 aa7.32□□□□□ -1.24
TOP3B-210ENST00000444502 CUBNO60494 3623 aa7.32□□□□□ -1.24
TOP3B-210ENST00000444502 SPTSSBQ8NFR3 76 aa7.32□□□□□ -1.24
TOP3B-210ENST00000444502 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa7.31□□□□□ -1.24
TOP3B-210ENST00000444502 ESRGQ1W209 222 aa7.31□□□□□ -1.24
TOP3B-210ENST00000444502 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TOP3B-210ENST00000444502 C19orf73Q9NVV2 129 aa7.31□□□□□ -1.24
TOP3B-210ENST00000444502 Q8NAQ8 132 aa7.31□□□□□ -1.24
TOP3B-210ENST00000444502 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.3□□□□□ -1.24
TOP3B-210ENST00000444502 TENM4Q6N022 2769 aa7.3□□□□□ -1.24
TOP3B-210ENST00000444502 CCKP06307 115 aa7.3□□□□□ -1.24
TOP3B-210ENST00000444502 PRR4Q16378 134 aa7.3□□□□□ -1.24
TOP3B-210ENST00000444502 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.3□□□□□ -1.24
TOP3B-210ENST00000444502 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa7.3□□□□□ -1.24
TOP3B-210ENST00000444502 TRAV7A0A075B6U4 112 aa7.29□□□□□ -1.24
TOP3B-210ENST00000444502 PSPHP1O15172 72 aa7.29□□□□□ -1.24
TOP3B-210ENST00000444502 Q8IZM0 81 aa7.29□□□□□ -1.24
TOP3B-210ENST00000444502 COX7BP24311 80 aa7.29□□□□□ -1.24
TOP3B-210ENST00000444502 PLAC8L1A1L4L8 177 aa7.28□□□□□ -1.24
TOP3B-210ENST00000444502 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa7.28□□□□□ -1.24
TOP3B-210ENST00000444502 K7EIL1 84 aa7.28□□□□□ -1.24
TOP3B-210ENST00000444502 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.241e-7■□□□□ 9.3
TOP3B-210ENST00000444502 A0A1B0GUV1 79 aa7.27□□□□□ -1.25
TOP3B-210ENST00000444502 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa7.27□□□□□ -1.25
TOP3B-210ENST00000444502 H7BZZ5 65 aa7.26□□□□□ -1.25
TOP3B-210ENST00000444502 BSNQ9UPA5 3926 aa7.25□□□□□ -1.25
TOP3B-210ENST00000444502 FAM104AQ969W3 186 aa7.25□□□□□ -1.25
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