RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439418.1

C9orf135-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C9orf135-AS1, Length 1,375 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa3.63□□□□□ -1.83
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C9orf135-AS1-201ENST00000439418 hADV29S1A0JD25 119 aa3.63□□□□□ -1.83
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C19orf71A6NCJ1 209 aa3.63□□□□□ -1.83
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C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
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C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CYTL1Q9NRR1 136 aa3.63□□□□□ -1.83
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NDUFB11Q9NX14 153 aa3.63□□□□□ -1.83
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C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa3.62□□□□□ -1.83
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C9orf135-AS1-201ENST00000439418 J3QRE1 110 aa3.62□□□□□ -1.83
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
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C9orf135-AS1-201ENST00000439418 UBE2WQ96B02 151 aa3.62□□□□□ -1.83
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LINC00479Q96M42 142 aa3.62□□□□□ -1.83
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RPS10P5Q9NQ39 176 aa3.62□□□□□ -1.83
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
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C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PMCHL1Q16048 86 aa3.6□□□□□ -1.83
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 Q1RN00 199 aa3.6□□□□□ -1.83
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C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa3.59□□□□□ -1.83
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C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SERP2Q8N6R1 65 aa3.59□□□□□ -1.83
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRGV9Q99603 122 aa3.59□□□□□ -1.83
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.59□□□□□ -1.83
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C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa3.58□□□□□ -1.84
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C16orf74Q96GX8 76 aa3.58□□□□□ -1.84
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC50A1Q9BRV3 221 aa3.58□□□□□ -1.84
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MUC21A0A140T8X8 626 aa3.57□□□□□ -1.84
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C9orf135-AS1-201ENST00000439418 H3BUT2 72 aa3.57□□□□□ -1.84
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C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FXYD2P54710 66 aa3.57□□□□□ -1.84
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C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C2orf91Q6ZV80 131 aa3.57□□□□□ -1.84
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SH2D6Q7Z4S9 175 aa3.57□□□□□ -1.84
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LYZL2Q7Z4W2 148 aa3.57□□□□□ -1.84
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LITAFQ99732 161 aa3.57□□□□□ -1.84
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PRO0461Q9UI25 63 aa3.57□□□□□ -1.84
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ICOSQ9Y6W8 199 aa3.57□□□□□ -1.84
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LRCOL1A6NCL2 159 aa3.56□□□□□ -1.84
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 Q6ZQT7 251 aa3.56□□□□□ -1.84
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 Q8N814 137 aa3.56□□□□□ -1.84
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SMIM7Q9BQ49 75 aa3.56□□□□□ -1.84
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa3.55□□□□□ -1.84
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa3.55□□□□□ -1.84
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NAP1L6A6NFF2 107 aa3.55□□□□□ -1.84
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
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