RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429798.1

LIMD1-AS1-202, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LIMD1-AS1, Length 955 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 Q6ZVH6 145 aa6.62□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.62□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DPH3Q96FX2 82 aa6.62□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.61□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PTTG1IPP53801 180 aa6.61□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LINC01620Q4KN68 170 aa6.61□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 Q6ZRP5 223 aa6.61□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HIST1H4GQ99525 98 aa6.61□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.61□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PRO1933Q9H354 126 aa6.61□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 A0A1B0GVY2 172 aa6.6□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.6□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DAND5Q8N907 189 aa6.6□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.6□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.6□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SPANXCQ9NY87 97 aa6.6□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HIGD1BQ9P298 99 aa6.6□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.59□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 A0A096LNI7 61 aa6.59□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IFITM1P13164 125 aa6.59□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.59□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.59□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NPC2P61916 151 aa6.58□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LITAFQ99732 161 aa6.58□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TAL2Q16559 108 aa6.57□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.57□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.57□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.57□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.57□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DNAH2Q9P225 4427 aa6.57□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CHTF8P0CG12 524 aa6.56□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HSD52Q0P140 79 aa6.56□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.56□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.56□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.55□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP10-1P60331 282 aa6.55□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.55□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.54□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.54□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.54□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.54□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.53□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 M0QXV9 152 aa6.53□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 M0R143 59 aa6.53□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NDUFC2O95298 119 aa6.53□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CEND1Q8N111 149 aa6.53□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 A0A087WYN8 130 aa6.52□□□□□ -1.37
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NCR3O14931 201 aa6.52□□□□□ -1.37
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DDTP30046 118 aa6.52□□□□□ -1.37
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.52□□□□□ -1.37
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 Q6ZSA8 131 aa6.52□□□□□ -1.37
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.52□□□□□ -1.37
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RYR3Q15413 4870 aa6.51□□□□□ -1.37
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.51□□□□□ -1.37
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM168BA1KXE4 195 aa6.51□□□□□ -1.37
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 M0R378 163 aa6.51□□□□□ -1.37
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 VPREB1P12018 145 aa6.51□□□□□ -1.37
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CTAG1AP78358 180 aa6.51□□□□□ -1.37
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.51□□□□□ -1.37
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.51□□□□□ -1.37
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.51□□□□□ -1.37
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.5□□□□□ -1.37
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 A4D1N5 150 aa6.5□□□□□ -1.37
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PANO1I0J062 215 aa6.5□□□□□ -1.37
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 UBE2BP63146 152 aa6.5□□□□□ -1.37
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.5□□□□□ -1.37
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.5□□□□□ -1.37
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C7orf33Q8WU49 177 aa6.5□□□□□ -1.37
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RAB37Q96AX2 223 aa6.5□□□□□ -1.37
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C22orf24Q9Y442 160 aa6.5□□□□□ -1.37
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.5□□□□□ -1.37
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.49□□□□□ -1.37
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 A0A1W2PNN7 141 aa6.49□□□□□ -1.37
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SCXQ7RTU7 201 aa6.49□□□□□ -1.37
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.49□□□□□ -1.37
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 A6NDN8 102 aa6.48□□□□□ -1.37
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GAGE10A6NGK3 116 aa6.48□□□□□ -1.37
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.48□□□□□ -1.37
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.48□□□□□ -1.37
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FXYD2P54710 66 aa6.47□□□□□ -1.37
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMEM126AQ9H061 195 aa6.47□□□□□ -1.37
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 A0A0B4J2C4 111 aa6.46□□□□□ -1.38
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 BATFQ16520 125 aa6.46□□□□□ -1.38
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.46□□□□□ -1.38
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.45□□□□□ -1.38
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.45□□□□□ -1.38
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CDK2AP2O75956 126 aa6.45□□□□□ -1.38
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IGKV2D-28P01615 120 aa6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 290.9 ms