RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
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HOXA4-202ENST00000428284 SPANXCQ9NY87 97 aa13.06□□□□□ -0.32
HOXA4-202ENST00000428284 HERC2O95714 4834 aa13.05□□□□□ -0.32
HOXA4-202ENST00000428284 SCXQ7RTU7 201 aa13.05□□□□□ -0.32
HOXA4-202ENST00000428284 PRO1933Q9H354 126 aa13.05□□□□□ -0.32
HOXA4-202ENST00000428284 UQCR10Q9UDW1 63 aa13.05□□□□□ -0.32
HOXA4-202ENST00000428284 KIAA1109Q2LD37 5005 aa13.05□□□□□ -0.32
HOXA4-202ENST00000428284 A0A1W2PNN7 141 aa13.04□□□□□ -0.32
HOXA4-202ENST00000428284 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP13.04□□□□□ -0.32
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HOXA4-202ENST00000428284 LINC00308Q8TCZ7 52 aa13.03□□□□□ -0.32
HOXA4-202ENST00000428284 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
HOXA4-202ENST00000428284 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa13.03□□□□□ -0.32
HOXA4-202ENST00000428284 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa13.03□□□□□ -0.32
HOXA4-202ENST00000428284 C2orf91Q6ZV80 131 aa13.03□□□□□ -0.32
HOXA4-202ENST00000428284 Q6ZVH6 145 aa13.03□□□□□ -0.32
HOXA4-202ENST00000428284 PLAC8Q9NZF1 115 aa13.03□□□□□ -0.32
HOXA4-202ENST00000428284 HIGD1BQ9P298 99 aa13.02□□□□□ -0.33
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HOXA4-202ENST00000428284 COPS9Q8WXC6 57 aa13□□□□□ -0.33
HOXA4-202ENST00000428284 HIST1H4GQ99525 98 aa13□□□□□ -0.33
HOXA4-202ENST00000428284 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa13□□□□□ -0.33
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HOXA4-202ENST00000428284 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa12.99□□□□□ -0.33
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HOXA4-202ENST00000428284 CDK2AP2O75956 126 aa12.96□□□□□ -0.33
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HOXA4-202ENST00000428284 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa12.94□□□□□ -0.34
HOXA4-202ENST00000428284 EPM2AB3EWF7 344 aa12.94□□□□□ -0.34
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HOXA4-202ENST00000428284 PRR3P79522 188 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
HOXA4-202ENST00000428284 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
HOXA4-202ENST00000428284 RYR1P21817 5038 aa12.94□□□□□ -0.34
HOXA4-202ENST00000428284 NDUFC2O95298 119 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXA4-202ENST00000428284 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
HOXA4-202ENST00000428284 PPDPFQ9H3Y8 114 aa12.93□□□□□ -0.34
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HOXA4-202ENST00000428284 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
HOXA4-202ENST00000428284 C7orf33Q8WU49 177 aa12.9□□□□□ -0.34
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HOXA4-202ENST00000428284 HSPG2P98160 4391 aa12.83□□□□□ -0.36
HOXA4-202ENST00000428284 LINC00528Q8N1L1 170 aa12.83□□□□□ -0.36
HOXA4-202ENST00000428284 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa12.82□□□□□ -0.36
HOXA4-202ENST00000428284 DDTP30046 118 aa12.82□□□□□ -0.36
HOXA4-202ENST00000428284 CTAG1AP78358 180 aa12.82□□□□□ -0.36
HOXA4-202ENST00000428284 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa12.82□□□□□ -0.36
HOXA4-202ENST00000428284 LINC00337Q8N6G1 96 aa12.82□□□□□ -0.36
HOXA4-202ENST00000428284 OR13C6PQ8NH95 151 aa12.82□□□□□ -0.36
HOXA4-202ENST00000428284 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa12.81□□□□□ -0.36
HOXA4-202ENST00000428284 FXYD2P54710 66 aa12.81□□□□□ -0.36
HOXA4-202ENST00000428284 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa12.81□□□□□ -0.36
HOXA4-202ENST00000428284 A6NJY4 79 aa12.81□□□□□ -0.36
HOXA4-202ENST00000428284 A6NDN8 102 aa12.8□□□□□ -0.36
HOXA4-202ENST00000428284 IGLV6-57P01721 117 aa12.79□□□□□ -0.36
HOXA4-202ENST00000428284 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa12.78□□□□□ -0.36
HOXA4-202ENST00000428284 TMEM126AQ9H061 195 aa12.78□□□□□ -0.36
HOXA4-202ENST00000428284 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa12.78□□□□□ -0.36
HOXA4-202ENST00000428284 CFC1BP0CG36 223 aa12.76□□□□□ -0.37
HOXA4-202ENST00000428284 CFC1P0CG37 223 aa12.76□□□□□ -0.37
HOXA4-202ENST00000428284 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
HOXA4-202ENST00000428284 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
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HOXA4-202ENST00000428284 PCP4L1A6NKN8 68 aa12.75□□□□□ -0.37
HOXA4-202ENST00000428284 M0R143 59 aa12.75□□□□□ -0.37
HOXA4-202ENST00000428284 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa12.75□□□□□ -0.37
HOXA4-202ENST00000428284 KCNQ1DNQ9H478 68 aa12.75□□□□□ -0.37
HOXA4-202ENST00000428284 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa12.74□□□□□ -0.37
HOXA4-202ENST00000428284 FAM229AH3BQW9 127 aa12.74□□□□□ -0.37
HOXA4-202ENST00000428284 PRYO14603 147 aa12.74□□□□□ -0.37
HOXA4-202ENST00000428284 C1orf137Q5JT78 98 aa12.74□□□□□ -0.37
HOXA4-202ENST00000428284 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa12.74□□□□□ -0.37
HOXA4-202ENST00000428284 REG3GQ6UW15 175 aa12.74□□□□□ -0.37
HOXA4-202ENST00000428284 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
HOXA4-202ENST00000428284 A0A0B4J2C4 111 aa12.73□□□□□ -0.37
HOXA4-202ENST00000428284 Q8N1X5 172 aa12.73□□□□□ -0.37
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