RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415548.1

CCT3-208, Transcript of chaperonin containing TCP1 subunit 3, human

TSL 3

Gene CCT3, Length 513 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCT3-208	ENST00000415548	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CCT3-208	ENST00000415548	GAGE10	A6NGK3	116 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CCT3-208	ENST00000415548	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CCT3-208	ENST00000415548		H0Y9J4	135 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CCT3-208	ENST00000415548	FABP4	P15090	132 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CCT3-208	ENST00000415548	LINC00167	Q96N53	147 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CCT3-208	ENST00000415548	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CCT3-208	ENST00000415548	COX17	Q14061	63 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CCT3-208	ENST00000415548	SFTA2	Q6UW10	78 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CCT3-208	ENST00000415548	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CCT3-208	ENST00000415548	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CCT3-208	ENST00000415548		A0A0U1RRA0	63 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CCT3-208	ENST00000415548	ZNF861P	O60384	105 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CCT3-208	ENST00000415548	BCE1	O60756	84 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CCT3-208	ENST00000415548	LINC00158	P58513	81 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CCT3-208	ENST00000415548	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CCT3-208	ENST00000415548	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CCT3-208	ENST00000415548	HIST1H2BK	O60814	126 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCT3-208	ENST00000415548	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCT3-208	ENST00000415548	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCT3-208	ENST00000415548	SMIM13	P0DJ93	91 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCT3-208	ENST00000415548	VPREB1	P12018	145 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCT3-208	ENST00000415548	HIST1H2BO	P23527	126 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCT3-208	ENST00000415548	HIST1H2BB	P33778	126 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCT3-208	ENST00000415548	HIST1H2BD	P58876	126 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCT3-208	ENST00000415548	HIST1H2BC	P62807	126 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCT3-208	ENST00000415548	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCT3-208	ENST00000415548	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CCT3-208	ENST00000415548	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCT3-208	ENST00000415548		Q8NDZ9	215 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCT3-208	ENST00000415548	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCT3-208	ENST00000415548	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCT3-208	ENST00000415548	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCT3-208	ENST00000415548	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCT3-208	ENST00000415548	LRP2	P98164	4655 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCT3-208	ENST00000415548	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCT3-208	ENST00000415548	DPM2	O94777	84 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCT3-208	ENST00000415548	IGKV2D-28	P01615	120 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCT3-208	ENST00000415548	PLN	P26678	52 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCT3-208	ENST00000415548	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCT3-208	ENST00000415548	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CCT3-208	ENST00000415548	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCT3-208	ENST00000415548	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCT3-208	ENST00000415548	LEPROT	O15243	131 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CCT3-208	ENST00000415548	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CCT3-208	ENST00000415548	HERV-K104	P63124	156 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CCT3-208	ENST00000415548	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CCT3-208	ENST00000415548	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CCT3-208	ENST00000415548	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CCT3-208	ENST00000415548	TMEM238	C9JI98	176 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CCT3-208	ENST00000415548	ATP6V1G1	O75348	118 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CCT3-208	ENST00000415548	IGKC	P01834	107 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CCT3-208	ENST00000415548	HERVK_113	P61574	105 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CCT3-208	ENST00000415548	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CCT3-208	ENST00000415548	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CCT3-208	ENST00000415548		J3QQQ9	107 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CCT3-208	ENST00000415548	UBE2A	P49459	152 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CCT3-208	ENST00000415548	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CCT3-208	ENST00000415548	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CCT3-208	ENST00000415548	TMEM126A	Q9H061	195 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CCT3-208	ENST00000415548	LINC00587	B1AMM8	73 aa		5	□□□□□ -1.61
CCT3-208	ENST00000415548	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		5	□□□□□ -1.61
CCT3-208	ENST00000415548		M0R378	163 aa		5	□□□□□ -1.61
CCT3-208	ENST00000415548	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
CCT3-208	ENST00000415548	PRLH	P81277	87 aa		5	□□□□□ -1.61
CCT3-208	ENST00000415548	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		5	□□□□□ -1.61
CCT3-208	ENST00000415548	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCT3-208	ENST00000415548	NCR3	O14931	201 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCT3-208	ENST00000415548	DAND5	Q8N907	189 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCT3-208	ENST00000415548	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CCT3-208	ENST00000415548	NMU	P48645	174 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCT3-208	ENST00000415548	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CCT3-208	ENST00000415548	LINC01545	Q5VT33	79 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCT3-208	ENST00000415548	PET117	Q6UWS5	81 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCT3-208	ENST00000415548	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCT3-208	ENST00000415548	LPA	P08519	4548 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCT3-208	ENST00000415548		A0A087X002	238 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCT3-208	ENST00000415548		E9PLD3	99 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCT3-208	ENST00000415548	C3orf79	P0CE67	100 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCT3-208	ENST00000415548	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCT3-208	ENST00000415548	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCT3-208	ENST00000415548		A0A0J9YXY3	114 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCT3-208	ENST00000415548	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCT3-208	ENST00000415548	CRYGA	P11844	174 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCT3-208	ENST00000415548	KRTDAP	P60985	99 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCT3-208	ENST00000415548	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCT3-208	ENST00000415548	PRY	O14603	147 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCT3-208	ENST00000415548	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CCT3-208	ENST00000415548	NPC2	P61916	151 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCT3-208	ENST00000415548	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCT3-208	ENST00000415548	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCT3-208	ENST00000415548	SPRR1A	P35321	89 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCT3-208	ENST00000415548	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCT3-208	ENST00000415548	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCT3-208	ENST00000415548	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCT3-208	ENST00000415548	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCT3-208	ENST00000415548	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCT3-208	ENST00000415548	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCT3-208	ENST00000415548	RNF213	Q63HN8	5207 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCT3-208	ENST00000415548	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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