RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366290.2

YBX3-204, Transcript of Y-box binding protein 3, human

TSL 2

Gene YBX3, Length 512 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
YBX3-204	ENST00000366290	COX7A2L	O14548	114 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YBX3-204	ENST00000366290	LEPROTL1	O95214	131 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YBX3-204	ENST00000366290	IGLC3	P0DOY3	106 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YBX3-204	ENST00000366290	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YBX3-204	ENST00000366290	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YBX3-204	ENST00000366290	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YBX3-204	ENST00000366290	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YBX3-204	ENST00000366290	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YBX3-204	ENST00000366290	FABP4	P15090	132 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YBX3-204	ENST00000366290	SCX	Q7RTU7	201 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YBX3-204	ENST00000366290	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YBX3-204	ENST00000366290	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YBX3-204	ENST00000366290	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	C11orf86	A6NJI1	115 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290		E9PLD3	99 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	HERVK_113	P63121	156 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	HAMP	P81172	84 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	KIAA0087	Q14695	138 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	FAM168B	A1KXE4	195 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290		F8VRH5	84 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	SEC11A	P67812	179 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	SPAG11B	Q08648	103 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290		H0Y8G0	127 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	APOM	O95445	188 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	SPINK8	P0C7L1	97 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	C3orf79	P0CE67	100 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290		Q6ZRU5	148 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	LINC01545	Q5VT33	79 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	TMEM223	A0PJW6	202 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	PANO1	I0J062	215 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	S100A6	P06703	90 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	SYCN	Q0VAF6	134 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	C2orf82	Q6UX34	121 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290		Q8IZM0	81 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	CARD19	Q96LW7	228 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290		H3BRM9	83 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	DPM2	O94777	84 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	IGKC	P01834	107 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	KRTDAP	P60985	99 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	COX7B2	Q8TF08	81 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YBX3-204	ENST00000366290	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		4.84	□□□□□ -1.64
YBX3-204	ENST00000366290	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		4.84	□□□□□ -1.64
YBX3-204	ENST00000366290	NDUFA1	O15239	70 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YBX3-204	ENST00000366290	PLN	P26678	52 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YBX3-204	ENST00000366290	S100A2	P29034	98 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YBX3-204	ENST00000366290	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YBX3-204	ENST00000366290	PRR4	Q16378	134 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YBX3-204	ENST00000366290	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YBX3-204	ENST00000366290	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YBX3-204	ENST00000366290	CHTF8	P0CG12	524 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YBX3-204	ENST00000366290	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YBX3-204	ENST00000366290	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YBX3-204	ENST00000366290	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YBX3-204	ENST00000366290	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YBX3-204	ENST00000366290		A0A096LNI7	61 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YBX3-204	ENST00000366290	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YBX3-204	ENST00000366290	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YBX3-204	ENST00000366290	CXCL5	P42830	114 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YBX3-204	ENST00000366290	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YBX3-204	ENST00000366290	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YBX3-204	ENST00000366290	LEPROT	O15243	131 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YBX3-204	ENST00000366290	CKS1B	P61024	79 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YBX3-204	ENST00000366290	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YBX3-204	ENST00000366290	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YBX3-204	ENST00000366290	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YBX3-204	ENST00000366290	ATOH7	Q8N100	152 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YBX3-204	ENST00000366290	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YBX3-204	ENST00000366290	C20orf202	A1L168	122 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YBX3-204	ENST00000366290		J3QQQ9	107 aa		4.78	□□□□□ -1.64

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