RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 C3orf84H3BNL1 204 aa14.67□□□□□ -0.06
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PTPRJ-208ENST00000615445 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRJ-208ENST00000615445 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRJ-208ENST00000615445 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa14.66□□□□□ -0.06
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PTPRJ-208ENST00000615445 C20orf197Q8N268 126 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRJ-208ENST00000615445 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
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PTPRJ-208ENST00000615445 USP17L23D6RBM5 183 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRJ-208ENST00000615445 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa14.57□□□□□ -0.08
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PTPRJ-208ENST00000615445 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa14.31□□□□□ -0.12
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF292O60281 2723 aa14.3□□□□□ -0.12
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC179H3BU77 68 aa14.3□□□□□ -0.12
PTPRJ-208ENST00000615445 Q6Q795 121 aa14.29□□□□□ -0.12
PTPRJ-208ENST00000615445 A0A096LNT2 108 aa14.29□□□□□ -0.12
PTPRJ-208ENST00000615445 SBSPONQ8IVN8 264 aa14.29□□□□□ -0.12
PTPRJ-208ENST00000615445 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.12
PTPRJ-208ENST00000615445 PRYO14603 147 aa14.27□□□□□ -0.13
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