RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-208ENST00000560725 GNG5P63218 68 aa3.2□□□□□ -1.9
TMOD3-208ENST00000560725 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
TMOD3-208ENST00000560725 Q0VG73 95 aa3.2□□□□□ -1.9
TMOD3-208ENST00000560725 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa3.2□□□□□ -1.9
TMOD3-208ENST00000560725 ZFP30Q9Y2G7 519 aa3.2□□□□□ -1.9
TMOD3-208ENST00000560725 A0A087WX48 190 aa3.19□□□□□ -1.9
TMOD3-208ENST00000560725 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa3.19□□□□□ -1.9
TMOD3-208ENST00000560725 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa3.19□□□□□ -1.9
TMOD3-208ENST00000560725 M0R036 132 aa3.19□□□□□ -1.9
TMOD3-208ENST00000560725 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
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TMOD3-208ENST00000560725 LINC00694P0DN24 101 aa3.19□□□□□ -1.9
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TMOD3-208ENST00000560725 CCL20P78556 96 aa3.19□□□□□ -1.9
TMOD3-208ENST00000560725 HAMPP81172 84 aa3.19□□□□□ -1.9
TMOD3-208ENST00000560725 NIT1Q86X76 327 aa3.19□□□□□ -1.9
TMOD3-208ENST00000560725 GATD1Q8NB37 220 aa3.19□□□□□ -1.9
TMOD3-208ENST00000560725 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
TMOD3-208ENST00000560725 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa3.19□□□□□ -1.9
TMOD3-208ENST00000560725 NAT8Q9UHE5 227 aa3.19□□□□□ -1.9
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TMOD3-208ENST00000560725 K7ERS5 55 aa3.18□□□□□ -1.9
TMOD3-208ENST00000560725 HIST1H2BKO60814 126 aa3.18□□□□□ -1.9
TMOD3-208ENST00000560725 HIST1H2BJP06899 126 aa3.18□□□□□ -1.9
TMOD3-208ENST00000560725 ARMS2P0C7Q2 107 aa3.18□□□□□ -1.9
TMOD3-208ENST00000560725 HIST1H2BOP23527 126 aa3.18□□□□□ -1.9
TMOD3-208ENST00000560725 HIST1H2BBP33778 126 aa3.18□□□□□ -1.9
TMOD3-208ENST00000560725 HIST1H2BDP58876 126 aa3.18□□□□□ -1.9
TMOD3-208ENST00000560725 HIST1H2BCP62807 126 aa3.18□□□□□ -1.9
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TMOD3-208ENST00000560725 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
TMOD3-208ENST00000560725 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
TMOD3-208ENST00000560725 HIST1H2BHQ93079 126 aa3.18□□□□□ -1.9
TMOD3-208ENST00000560725 SFRP2Q96HF1 295 aa3.18□□□□□ -1.9
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TMOD3-208ENST00000560725 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa3.18□□□□□ -1.9
TMOD3-208ENST00000560725 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa3.17□□□□□ -1.9
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TMOD3-208ENST00000560725 AKR1D1P51857 326 aa3.17□□□□□ -1.9
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TMOD3-208ENST00000560725 TMEM97Q5BJF2 176 aa3.17□□□□□ -1.9
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TMOD3-208ENST00000560725 UBE2WQ96B02 151 aa3.17□□□□□ -1.9
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TMOD3-208ENST00000560725 H3BVH4 76 aa3.16□□□□□ -1.9
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TMOD3-208ENST00000560725 MIAQ16674 131 aa3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-208ENST00000560725 FAM74A4Q5TZK3 123 aa3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-208ENST00000560725 Q86TA4 180 aa3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-208ENST00000560725 C1orf64Q8NEQ6 169 aa3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-208ENST00000560725 SMIM12Q96EX1 92 aa3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-208ENST00000560725 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa3.16□□□□□ -1.9
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TMOD3-208ENST00000560725 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa3.15□□□□□ -1.91
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TMOD3-208ENST00000560725 M0R381 172 aa3.15□□□□□ -1.91
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TMOD3-208ENST00000560725 ENHOQ6UWT2 76 aa3.15□□□□□ -1.91
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TMOD3-208ENST00000560725 ANGP03950 147 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-208ENST00000560725 GZMBP10144 247 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-208ENST00000560725 AKR1C3P42330 323 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-208ENST00000560725 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-208ENST00000560725 Q6ZRU5 148 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-208ENST00000560725 BOD1L2Q8IYS8 172 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-208ENST00000560725 DNAJC30Q96LL9 226 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-208ENST00000560725 HIST1H2BLQ99880 126 aa3.14□□□□□ -1.91
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