RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558376.5

RABGGTA-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 1,883 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-204ENST00000558376 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTA-204ENST00000558376 VAMP3Q15836 100 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTA-204ENST00000558376 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
RABGGTA-204ENST00000558376 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTA-204ENST00000558376 ANGP03950 147 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
RABGGTA-204ENST00000558376 Q6ZVH6 145 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTA-204ENST00000558376 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
RABGGTA-204ENST00000558376 TMEM223A0PJW6 202 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTA-204ENST00000558376 SPINK8P0C7L1 97 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTA-204ENST00000558376 SMAGPQ0VAQ4 97 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTA-204ENST00000558376 CFAP161Q6P656 301 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTA-204ENST00000558376 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa7.4□□□□□ -1.23
RABGGTA-204ENST00000558376 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa7.4□□□□□ -1.23
RABGGTA-204ENST00000558376 K7EP13 123 aa7.4□□□□□ -1.23
RABGGTA-204ENST00000558376 TAX1BP3O14907 124 aa7.4□□□□□ -1.23
RABGGTA-204ENST00000558376 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.4□□□□□ -1.23
RABGGTA-204ENST00000558376 KLK12Q9UKR0 248 aa7.4□□□□□ -1.23
RABGGTA-204ENST00000558376 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RABGGTA-204ENST00000558376 E9PLD3 99 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTA-204ENST00000558376 TIRAPP58753 221 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTA-204ENST00000558376 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTA-204ENST00000558376 FAT3Q8TDW7 4589 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTA-204ENST00000558376 HMCN2Q8NDA2 5059 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTA-204ENST00000558376 XCL1P47992 114 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTA-204ENST00000558376 SEC11AP67812 179 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTA-204ENST00000558376 REG3AQ06141 175 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTA-204ENST00000558376 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
RABGGTA-204ENST00000558376 C2orf91Q6ZV80 131 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTA-204ENST00000558376 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTA-204ENST00000558376 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTA-204ENST00000558376 HERVK_113P63121 156 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTA-204ENST00000558376 ENHOQ6UWT2 76 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTA-204ENST00000558376 C5orf38Q86SI9 138 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTA-204ENST00000558376 C10orf126Q8N4M7 172 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTA-204ENST00000558376 Q8N814 137 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTA-204ENST00000558376 A6NDN8 102 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-204ENST00000558376 PSCAO43653 123 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-204ENST00000558376 UBR4Q5T4S7 5183 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-204ENST00000558376 J3QQQ9 107 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-204ENST00000558376 HERVK_113P61574 105 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-204ENST00000558376 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-204ENST00000558376 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTA-204ENST00000558376 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTA-204ENST00000558376 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTA-204ENST00000558376 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTA-204ENST00000558376 LEPROTO15243 131 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTA-204ENST00000558376 HSD52Q0P140 79 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTA-204ENST00000558376 SS18Q15532 418 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTA-204ENST00000558376 UBE2WQ96B02 151 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTA-204ENST00000558376 ZNF815PA8K554 130 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTA-204ENST00000558376 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
RABGGTA-204ENST00000558376 WFDC2Q14508 124 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTA-204ENST00000558376 LINC01556Q5JQF7 62 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTA-204ENST00000558376 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTA-204ENST00000558376 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
RABGGTA-204ENST00000558376 Q9HAA7 133 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTA-204ENST00000558376 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTA-204ENST00000558376 H3BRM9 83 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTA-204ENST00000558376 Q6ZSA8 131 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTA-204ENST00000558376 PRR34Q9NV39 138 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTA-204ENST00000558376 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa7.34□□□□□ -1.24
RABGGTA-204ENST00000558376 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
RABGGTA-204ENST00000558376 A0A087WZ39 114 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTA-204ENST00000558376 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTA-204ENST00000558376 GAGE12HA6NDE8 117 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTA-204ENST00000558376 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTA-204ENST00000558376 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTA-204ENST00000558376 C9orf118A6NHY6 69 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGGTA-204ENST00000558376 CD164L2Q6UWJ8 174 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGGTA-204ENST00000558376 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
RABGGTA-204ENST00000558376 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGGTA-204ENST00000558376 GAGE10A6NGK3 116 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTA-204ENST00000558376 CRPP02741 224 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTA-204ENST00000558376 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RABGGTA-204ENST00000558376 FOXI1Q12951 378 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTA-204ENST00000558376 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTA-204ENST00000558376 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTA-204ENST00000558376 PCP4P48539 62 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTA-204ENST00000558376 HIGD1BQ9P298 99 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTA-204ENST00000558376 LECT2O14960 151 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGGTA-204ENST00000558376 LINC01620Q4KN68 170 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGGTA-204ENST00000558376 A0A0J9YXY3 114 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGGTA-204ENST00000558376 A0A0U1RRA0 63 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGGTA-204ENST00000558376 COX7A2LO14548 114 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGGTA-204ENST00000558376 RNF151Q2KHN1 245 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGGTA-204ENST00000558376 COX7B2Q8TF08 81 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGGTA-204ENST00000558376 LINC00526Q96FQ7 95 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGGTA-204ENST00000558376 H3BUT2 72 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGGTA-204ENST00000558376 MALP21145 153 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGGTA-204ENST00000558376 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGGTA-204ENST00000558376 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGGTA-204ENST00000558376 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGGTA-204ENST00000558376 SCXQ7RTU7 201 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGGTA-204ENST00000558376 TM2D2Q9BX73 214 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGGTA-204ENST00000558376 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RABGGTA-204ENST00000558376 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGGTA-204ENST00000558376 K7ERU9 68 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGGTA-204ENST00000558376 SMIM13P0DJ93 91 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGGTA-204ENST00000558376 MIAQ16674 131 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGGTA-204ENST00000558376 C2orf82Q6UX34 121 aa7.27□□□□□ -1.25
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