RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 MT1HL1P0DM35 61 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-222ENST00000550996 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
CS-222ENST00000550996 SMCO4Q9NRQ5 59 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-222ENST00000550996 TOMM7Q9P0U1 55 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-222ENST00000550996 SEC11AP67812 179 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-222ENST00000550996 GAGE2EQ4V326 116 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-222ENST00000550996 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
CS-222ENST00000550996 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-222ENST00000550996 GAGE2DQ9UEU5 116 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-222ENST00000550996 LINC01549A6NIU2 74 aa12.91□□□□□ -0.34
CS-222ENST00000550996 Q8IZM0 81 aa12.91□□□□□ -0.34
CS-222ENST00000550996 LINC00469Q8N7U9 141 aa12.91□□□□□ -0.34
CS-222ENST00000550996 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa12.9□□□□□ -0.34
CS-222ENST00000550996 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa12.9□□□□□ -0.34
CS-222ENST00000550996 SMIM1B2RUZ4 78 aa12.9□□□□□ -0.34
CS-222ENST00000550996 PRSS2P07478 247 aa12.89□□□□□ -0.35
CS-222ENST00000550996 PMVKQ15126 192 aa12.89□□□□□ -0.35
CS-222ENST00000550996 PMCHL1Q16048 86 aa12.89□□□□□ -0.35
CS-222ENST00000550996 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
CS-222ENST00000550996 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa12.88□□□□□ -0.35
CS-222ENST00000550996 LINC00614P0C842 121 aa12.88□□□□□ -0.35
CS-222ENST00000550996 C6orf226Q5I0X4 101 aa12.88□□□□□ -0.35
CS-222ENST00000550996 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
CS-222ENST00000550996 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa12.88□□□□□ -0.35
CS-222ENST00000550996 CKS1BP61024 79 aa12.87□□□□□ -0.35
CS-222ENST00000550996 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP12.87□□□□□ -0.35
CS-222ENST00000550996 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
CS-222ENST00000550996 CBLN2Q8IUK8 224 aa12.87□□□□□ -0.35
CS-222ENST00000550996 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa12.87□□□□□ -0.35
CS-222ENST00000550996 PDZD11Q5EBL8 140 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-222ENST00000550996 HBDP02042 147 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-222ENST00000550996 SPINK8P0C7L1 97 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-222ENST00000550996 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-222ENST00000550996 F8VRH5 84 aa12.83□□□□□ -0.36
CS-222ENST00000550996 IGLC3P0DOY3 106 aa12.82□□□□□ -0.36
CS-222ENST00000550996 SPINK6Q6UWN8 80 aa12.82□□□□□ -0.36
CS-222ENST00000550996 COX7B2Q8TF08 81 aa12.82□□□□□ -0.36
CS-222ENST00000550996 M0QXV9 152 aa12.8□□□□□ -0.36
CS-222ENST00000550996 NDUFA6P56556 154 aa12.8□□□□□ -0.36
CS-222ENST00000550996 CXCL5P42830 114 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-222ENST00000550996 RAB5BP61020 215 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-222ENST00000550996 C1orf137Q5JT78 98 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-222ENST00000550996 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-222ENST00000550996 XAGE1AQ9HD64 81 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-222ENST00000550996 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
CS-222ENST00000550996 LINC01600Q96MT4 127 aa12.78□□□□□ -0.36
CS-222ENST00000550996 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa12.77□□□□□ -0.37
CS-222ENST00000550996 ATP5LO75964 103 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-222ENST00000550996 H3BRM9 83 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-222ENST00000550996 C11orf86A6NJI1 115 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-222ENST00000550996 BAGE3Q86Y29 109 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-222ENST00000550996 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
CS-222ENST00000550996 IGLV7-43P04211 117 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-222ENST00000550996 ODF1Q14990 250 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-222ENST00000550996 TRGC2P03986 189 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-222ENST00000550996 REG3GQ6UW15 175 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-222ENST00000550996 C22orf24Q9Y442 160 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-222ENST00000550996 LINC00310P59036 64 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-222ENST00000550996 KRTAP10-8P60410 259 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-222ENST00000550996 UBE2BP63146 152 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-222ENST00000550996 FAM19A2Q8N3H0 131 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-222ENST00000550996 IFI27L1Q96BM0 104 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-222ENST00000550996 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
CS-222ENST00000550996 COLCA2A8K830 154 aa12.67□□□□□ -0.38
CS-222ENST00000550996 TMEM170BQ5T4T1 132 aa12.67□□□□□ -0.38
CS-222ENST00000550996 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa12.66□□□□□ -0.38
CS-222ENST00000550996 TP73-AS1Q9UF72 201 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-222ENST00000550996 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-222ENST00000550996 HSBP1O75506 76 aa12.64□□□□□ -0.39
CS-222ENST00000550996 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
CS-222ENST00000550996 UBR4Q5T4S7 5183 aa12.63□□□□□ -0.39
CS-222ENST00000550996 H0Y9J4 135 aa12.63□□□□□ -0.39
CS-222ENST00000550996 SERF1AO75920 110 aa12.63□□□□□ -0.39
CS-222ENST00000550996 PFN2P35080 140 aa12.63□□□□□ -0.39
CS-222ENST00000550996 DIRC1Q969H9 104 aa12.63□□□□□ -0.39
CS-222ENST00000550996 TMEM223A0PJW6 202 aa12.62□□□□□ -0.39
CS-222ENST00000550996 NUPR1O60356 82 aa12.62□□□□□ -0.39
CS-222ENST00000550996 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
CS-222ENST00000550996 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
CS-222ENST00000550996 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa12.61□□□□□ -0.39
CS-222ENST00000550996 ERG28Q9UKR5 140 aa12.61□□□□□ -0.39
CS-222ENST00000550996 LINC00167Q96N53 147 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-222ENST00000550996 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-222ENST00000550996 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-222ENST00000550996 GAGE10A6NGK3 116 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-222ENST00000550996 RPL37AP8A6NKH3 93 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-222ENST00000550996 SCO1O75880 301 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-222ENST00000550996 LRP2P98164 4655 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-222ENST00000550996 Q8NDZ9 215 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-222ENST00000550996 PRR26Q8N8Z3 221 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-222ENST00000550996 H0Y8G0 127 aa12.55□□□□□ -0.4
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CS-222ENST00000550996 LEPROTL1O95214 131 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-222ENST00000550996 VPREB1P12018 145 aa12.55□□□□□ -0.4
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CS-222ENST00000550996 BCE1O60756 84 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-222ENST00000550996 SFTA2Q6UW10 78 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-222ENST00000550996 NKAPP1Q8N9T2 125 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-222ENST00000550996 FABP4P15090 132 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-222ENST00000550996 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa12.49□□□□□ -0.41
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