RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524534.5

PTPRK-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 2,441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-217ENST00000524534 A0A1B0GX51 115 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRK-217ENST00000524534 CCKP06307 115 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRK-217ENST00000524534 XCL1P47992 114 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRK-217ENST00000524534 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
PTPRK-217ENST00000524534 LINC00612Q8N6U2 182 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRK-217ENST00000524534 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRK-217ENST00000524534 CENPEQ02224 2701 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRK-217ENST00000524534 CUBNO60494 3623 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRK-217ENST00000524534 PRB1P04280 392 aa7.95□□□□□ -1.14
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PTPRK-217ENST00000524534 LINC01006Q8NI28 216 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRK-217ENST00000524534 CACNA1AO00555 2505 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRK-217ENST00000524534 A0A087WVE0 104 aa7.94□□□□□ -1.14
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PTPRK-217ENST00000524534 GYPEP15421 78 aa7.94□□□□□ -1.14
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PTPRK-217ENST00000524534 JMJD1CQ15652 2540 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRK-217ENST00000524534 hADV29S1A0JD25 119 aa7.93□□□□□ -1.14
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PTPRK-217ENST00000524534 C16orf95Q9H693 158 aa7.93□□□□□ -1.14
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PTPRK-217ENST00000524534 NDUFC2O95298 119 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRK-217ENST00000524534 SERP2Q8N6R1 65 aa7.93□□□□□ -1.14
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PTPRK-217ENST00000524534 ABCA12Q86UK0 2595 aa7.92□□□□□ -1.14
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PTPRK-217ENST00000524534 KIAA0087Q14695 138 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRK-217ENST00000524534 USP17L23D6RBM5 183 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRK-217ENST00000524534 UPK3BQ9BT76 320 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRK-217ENST00000524534 CYSTM1Q9H1C7 97 aa7.92□□□□□ -1.14
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PTPRK-217ENST00000524534 CLPSL2Q6UWE3 100 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRK-217ENST00000524534 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP7.91□□□□□ -1.14
PTPRK-217ENST00000524534 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRK-217ENST00000524534 J3KT08 172 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRK-217ENST00000524534 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRK-217ENST00000524534 WFDC11Q8NEX6 87 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRK-217ENST00000524534 ZNF462Q96JM2 2506 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRK-217ENST00000524534 NF1P21359 2839 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRK-217ENST00000524534 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.15
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PTPRK-217ENST00000524534 CD164L2Q6UWJ8 174 aa7.89□□□□□ -1.15
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PTPRK-217ENST00000524534 LINC00575Q6W349 94 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRK-217ENST00000524534 ZNF843Q8N446 348 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRK-217ENST00000524534 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRK-217ENST00000524534 SMIM9A6NGZ8 99 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRK-217ENST00000524534 APCP25054 2843 aa7.85□□□□□ -1.15
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PTPRK-217ENST00000524534 WFDC9Q8NEX5 89 aa7.84□□□□□ -1.15
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PTPRK-217ENST00000524534 ENHOQ6UWT2 76 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRK-217ENST00000524534 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRK-217ENST00000524534 Q8N3U1 123 aa7.83□□□□□ -1.16
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PTPRK-217ENST00000524534 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
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PTPRK-217ENST00000524534 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRK-217ENST00000524534 MUC7Q8TAX7 377 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRK-217ENST00000524534 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRK-217ENST00000524534 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.81□□□□□ -1.16
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PTPRK-217ENST00000524534 C10orf25Q5T742 122 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRK-217ENST00000524534 C6orf223Q8N319 242 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRK-217ENST00000524534 A0A0J9YWU9 116 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRK-217ENST00000524534 IGLV6-57P01721 117 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRK-217ENST00000524534 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRK-217ENST00000524534 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRK-217ENST00000524534 LINC00482Q8N8I6 264 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRK-217ENST00000524534 USP24Q9UPU5 2620 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRK-217ENST00000524534 FN1P02751 2386 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRK-217ENST00000524534 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
PTPRK-217ENST00000524534 CCDC168Q8NDH2 2452 aa7.79□□□□□ -1.16
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