RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516584.1

RNU6-1004P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1004, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1004P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP0.95□□□□□ -2.26
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP0.94□□□□□ -2.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NMSQ5H8A3 153 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZFHX3Q15911 3703 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 UNC79Q9P2D8 2635 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FBN2P35556 2912 aa0.93□□□□□ -2.26
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 IGLC3P0DOY3 106 aa0.93□□□□□ -2.26
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 SHPRHQ149N8 1683 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CACNA1CQ13936 2221 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NHSL1Q5SYE7 1610 aa0.93□□□□□ -2.26
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 UBR1Q8IWV7 1749 aa0.92□□□□□ -2.26
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 FRAS1Q86XX4 4008 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MAGI2Q86UL8 1455 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NOTCH1P46531 2555 aa0.87□□□□□ -2.27
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 CRIPTQ9P021 101 aa0.84□□□□□ -2.27
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 ERVK-7P63135 1459 aa0.83□□□□□ -2.28
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCDC141Q6ZP82 1450 aa0.83□□□□□ -2.28
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP0.82□□□□□ -2.28
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 PKD1L3Q7Z443 1732 aa0.78□□□□□ -2.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GPR98Q8WXG9 6306 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ANKRD36A6QL64 1941 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP0.76□□□□□ -2.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP0.76□□□□□ -2.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa0.76□□□□□ -2.29
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP0.75□□□□□ -2.29
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 WFDC9Q8NEX5 89 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FMN2Q9NZ56 1722 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DEFB105AQ8NG35 78 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 APLNQ9ULZ1 77 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ABCA12Q86UK0 2595 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KDM5DQ9BY66 1539 aa0.73□□□□□ -2.29
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