RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491541.1

SREBF2-208, Transcript of sterol regulatory element binding transcription factor 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SREBF2, Length 4,043 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2-208ENST00000491541 HILS1P60008 231 aa7.27□□□□□ -1.25
SREBF2-208ENST00000491541 COX6A2Q02221 97 aa7.27□□□□□ -1.25
SREBF2-208ENST00000491541 C19orf84I3L1E1 186 aa7.26□□□□□ -1.25
SREBF2-208ENST00000491541 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.26□□□□□ -1.25
SREBF2-208ENST00000491541 A0A087WYN8 130 aa7.25□□□□□ -1.25
SREBF2-208ENST00000491541 CCKP06307 115 aa7.25□□□□□ -1.25
SREBF2-208ENST00000491541 WFDC11Q8NEX6 87 aa7.25□□□□□ -1.25
SREBF2-208ENST00000491541 CDSNQ15517 529 aa7.24□□□□□ -1.25
SREBF2-208ENST00000491541 ENHOQ6UWT2 76 aa7.24□□□□□ -1.25
SREBF2-208ENST00000491541 PLA2G2AP14555 144 aa7.24□□□□□ -1.25
SREBF2-208ENST00000491541 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa7.24□□□□□ -1.25
SREBF2-208ENST00000491541 F8P00451 2351 aa7.24□□□□□ -1.25
SREBF2-208ENST00000491541 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SREBF2-208ENST00000491541 A0A0U1RQV1 116 aa7.23□□□□□ -1.25
SREBF2-208ENST00000491541 HAMPP81172 84 aa7.23□□□□□ -1.25
SREBF2-208ENST00000491541 MGAM2Q2M2H8 2515 aa7.23□□□□□ -1.25
SREBF2-208ENST00000491541 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa7.23□□□□□ -1.25
SREBF2-208ENST00000491541 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa7.23□□□□□ -1.25
SREBF2-208ENST00000491541 FAM236CP0DP71 79 aa7.23□□□□□ -1.25
SREBF2-208ENST00000491541 Q6ZSN1 163 aa7.23□□□□□ -1.25
SREBF2-208ENST00000491541 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SREBF2-208ENST00000491541 RBM3P98179 157 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SREBF2-208ENST00000491541 LINC00482Q8N8I6 264 aa7.22□□□□□ -1.25
SREBF2-208ENST00000491541 SMIM11BQ8TCY0 68 aa7.22□□□□□ -1.25
SREBF2-208ENST00000491541 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SREBF2-208ENST00000491541 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa7.22□□□□□ -1.25
SREBF2-208ENST00000491541 UBL5Q9BZL1 73 aa7.21□□□□□ -1.25
SREBF2-208ENST00000491541 SNURFQ9Y675 71 aa7.21□□□□□ -1.25
SREBF2-208ENST00000491541 A0A1W2PPR1 153 aa7.21□□□□□ -1.26
SREBF2-208ENST00000491541 SLURP1P55000 103 aa7.21□□□□□ -1.26
SREBF2-208ENST00000491541 FHL2Q14192 279 aa7.21□□□□□ -1.26
SREBF2-208ENST00000491541 ORMDL1Q9P0S3 153 aa7.21□□□□□ -1.26
SREBF2-208ENST00000491541 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.21□□□□□ -1.26
SREBF2-208ENST00000491541 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.21□□□□□ -1.26
SREBF2-208ENST00000491541 A0A096LPF7 62 aa7.2□□□□□ -1.26
SREBF2-208ENST00000491541 PLAC8L1A1L4L8 177 aa7.2□□□□□ -1.26
SREBF2-208ENST00000491541 K7EQD1 137 aa7.2□□□□□ -1.26
SREBF2-208ENST00000491541 COX17Q14061 63 aa7.2□□□□□ -1.26
SREBF2-208ENST00000491541 BRK1Q8WUW1 75 aa7.2□□□□□ -1.26
SREBF2-208ENST00000491541 AKAP13Q12802 2813 aa7.2□□□□□ -1.26
SREBF2-208ENST00000491541 C6orf223Q8N319 242 aa7.2□□□□□ -1.26
SREBF2-208ENST00000491541 CXCL6P80162 114 aa7.2□□□□□ -1.26
SREBF2-208ENST00000491541 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.2□□□□□ -1.26
SREBF2-208ENST00000491541 RELNP78509 3460 aa7.19□□□□□ -1.26
SREBF2-208ENST00000491541 INSP01308 110 aa7.19□□□□□ -1.26
SREBF2-208ENST00000491541 C10orf99Q6UWK7 81 aa7.19□□□□□ -1.26
SREBF2-208ENST00000491541 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.19□□□□□ -1.26
SREBF2-208ENST00000491541 C1orf158Q8N1D5 194 aa7.19□□□□□ -1.26
SREBF2-208ENST00000491541 A0A087WZ39 114 aa7.18□□□□□ -1.26
SREBF2-208ENST00000491541 DEFB114Q30KQ6 69 aa7.18□□□□□ -1.26
SREBF2-208ENST00000491541 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa7.18□□□□□ -1.26
SREBF2-208ENST00000491541 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa7.18□□□□□ -1.26
SREBF2-208ENST00000491541 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa7.18□□□□□ -1.26
SREBF2-208ENST00000491541 J3QKU1 62 aa7.18□□□□□ -1.26
SREBF2-208ENST00000491541 COL12A1Q99715 3063 aa7.18□□□□□ -1.26
SREBF2-208ENST00000491541 A0A1B0GW54 56 aa7.17□□□□□ -1.26
SREBF2-208ENST00000491541 C6orf226Q5I0X4 101 aa7.17□□□□□ -1.26
SREBF2-208ENST00000491541 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa7.17□□□□□ -1.26
SREBF2-208ENST00000491541 COX7B2Q8TF08 81 aa7.17□□□□□ -1.26
SREBF2-208ENST00000491541 J3QLI3 93 aa7.16□□□□□ -1.26
SREBF2-208ENST00000491541 SERP1Q9Y6X1 66 aa7.16□□□□□ -1.26
SREBF2-208ENST00000491541 H7BZZ5 65 aa7.16□□□□□ -1.26
SREBF2-208ENST00000491541 A0A1B0GUV1 79 aa7.16□□□□□ -1.26
SREBF2-208ENST00000491541 XCL1P47992 114 aa7.16□□□□□ -1.26
SREBF2-208ENST00000491541 LINC00336Q6ZUF6 198 aa7.16□□□□□ -1.26
SREBF2-208ENST00000491541 TMEM86BQ8N661 226 aa7.15□□□□□ -1.26
SREBF2-208ENST00000491541 MPLKIPQ8TAP9 179 aa7.15□□□□□ -1.26
SREBF2-208ENST00000491541 DEFB113Q30KQ7 82 aa7.15□□□□□ -1.27
SREBF2-208ENST00000491541 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SREBF2-208ENST00000491541 NDUFC1O43677 76 aa7.14□□□□□ -1.27
SREBF2-208ENST00000491541 CCL18P55774 89 aa7.14□□□□□ -1.27
SREBF2-208ENST00000491541 CLPSL2Q6UWE3 100 aa7.14□□□□□ -1.27
SREBF2-208ENST00000491541 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa7.14□□□□□ -1.27
SREBF2-208ENST00000491541 CFAP46Q8IYW2 2715 aa7.14□□□□□ -1.27
SREBF2-208ENST00000491541 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.14□□□□□ -1.27
SREBF2-208ENST00000491541 CCL24O00175 119 aa7.13□□□□□ -1.27
SREBF2-208ENST00000491541 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa7.13□□□□□ -1.27
SREBF2-208ENST00000491541 Q6ZQT0 140 aa7.13□□□□□ -1.27
SREBF2-208ENST00000491541 SCXQ7RTU7 201 aa7.13□□□□□ -1.27
SREBF2-208ENST00000491541 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SREBF2-208ENST00000491541 TRAV7A0A075B6U4 112 aa7.13□□□□□ -1.27
SREBF2-208ENST00000491541 Q8IZM0 81 aa7.13□□□□□ -1.27
SREBF2-208ENST00000491541 PRO0628Q9UI54 55 aa7.13□□□□□ -1.27
SREBF2-208ENST00000491541 F8WEM9 126 aa7.12□□□□□ -1.27
SREBF2-208ENST00000491541 RMI2Q96E14 147 aa7.12□□□□□ -1.27
SREBF2-208ENST00000491541 DNAH3Q8TD57 4116 aa7.12□□□□□ -1.27
SREBF2-208ENST00000491541 ZNF292O60281 2723 aa7.12□□□□□ -1.27
SREBF2-208ENST00000491541 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SREBF2-208ENST00000491541 PDE6GP18545 87 aa7.11□□□□□ -1.27
SREBF2-208ENST00000491541 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa7.11□□□□□ -1.27
SREBF2-208ENST00000491541 Q6ZTI0 123 aa7.11□□□□□ -1.27
SREBF2-208ENST00000491541 ZNF702PQ9H963 129 aa7.11□□□□□ -1.27
SREBF2-208ENST00000491541 CUBNO60494 3623 aa7.1□□□□□ -1.27
SREBF2-208ENST00000491541 DEFB4AO15263 64 aa7.1□□□□□ -1.27
SREBF2-208ENST00000491541 KIAA0087Q14695 138 aa7.1□□□□□ -1.27
SREBF2-208ENST00000491541 C4orf3Q8WVX3 66 aa7.1□□□□□ -1.27
SREBF2-208ENST00000491541 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
SREBF2-208ENST00000491541 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa7.09□□□□□ -1.28
SREBF2-208ENST00000491541 Q8N814 137 aa7.09□□□□□ -1.28
SREBF2-208ENST00000491541 F8WDY8 70 aa7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 178.7 ms