RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 AKR1D1P51857 326 aa8.02□□□□□ -1.13
PRAME-212ENST00000485532 SS18Q15532 418 aa8.02□□□□□ -1.13
PRAME-212ENST00000485532 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
PRAME-212ENST00000485532 DPH3Q96FX2 82 aa8.02□□□□□ -1.13
PRAME-212ENST00000485532 A0A087WYN8 130 aa8.01□□□□□ -1.13
PRAME-212ENST00000485532 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa8.01□□□□□ -1.13
PRAME-212ENST00000485532 C20orf202A1L168 122 aa8.01□□□□□ -1.13
PRAME-212ENST00000485532 GAGE12HA6NDE8 117 aa8.01□□□□□ -1.13
PRAME-212ENST00000485532 CCL25O15444 150 aa8.01□□□□□ -1.13
PRAME-212ENST00000485532 COX6A2Q02221 97 aa8.01□□□□□ -1.13
PRAME-212ENST00000485532 C15orf56Q8N910 161 aa8.01□□□□□ -1.13
PRAME-212ENST00000485532 DPM2O94777 84 aa8□□□□□ -1.13
PRAME-212ENST00000485532 XCL1P47992 114 aa8□□□□□ -1.13
PRAME-212ENST00000485532 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PRAME-212ENST00000485532 HIGD2BQ4VC39 106 aa8□□□□□ -1.13
PRAME-212ENST00000485532 SPACA4Q8TDM5 124 aa8□□□□□ -1.13
PRAME-212ENST00000485532 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.99□□□□□ -1.13
PRAME-212ENST00000485532 SCGB1D1O95968 90 aa7.99□□□□□ -1.13
PRAME-212ENST00000485532 IGKCP01834 107 aa7.99□□□□□ -1.13
PRAME-212ENST00000485532 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PRAME-212ENST00000485532 HERVK_113P63121 156 aa7.99□□□□□ -1.13
PRAME-212ENST00000485532 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PRAME-212ENST00000485532 UBR4Q5T4S7 5183 aa7.99□□□□□ -1.13
PRAME-212ENST00000485532 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
PRAME-212ENST00000485532 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa7.98□□□□□ -1.13
PRAME-212ENST00000485532 PLNP26678 52 aa7.98□□□□□ -1.13
PRAME-212ENST00000485532 SEC11AP67812 179 aa7.98□□□□□ -1.13
PRAME-212ENST00000485532 FOXI1Q12951 378 aa7.98□□□□□ -1.13
PRAME-212ENST00000485532 PYY3Q5JQD4 70 aa7.98□□□□□ -1.13
PRAME-212ENST00000485532 CD164L2Q6UWJ8 174 aa7.98□□□□□ -1.13
PRAME-212ENST00000485532 ATOH7Q8N100 152 aa7.98□□□□□ -1.13
PRAME-212ENST00000485532 LINC00469Q8N7U9 141 aa7.98□□□□□ -1.13
PRAME-212ENST00000485532 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa7.98□□□□□ -1.13
PRAME-212ENST00000485532 Q6ZRU5 148 aa7.97□□□□□ -1.13
PRAME-212ENST00000485532 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.96□□□□□ -1.14
PRAME-212ENST00000485532 C5orf38Q86SI9 138 aa7.96□□□□□ -1.14
PRAME-212ENST00000485532 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.96□□□□□ -1.14
PRAME-212ENST00000485532 A0A087WZ39 114 aa7.95□□□□□ -1.14
PRAME-212ENST00000485532 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa7.95□□□□□ -1.14
PRAME-212ENST00000485532 MAJINQ3KP22 176 aa7.95□□□□□ -1.14
PRAME-212ENST00000485532 TMEM223A0PJW6 202 aa7.94□□□□□ -1.14
PRAME-212ENST00000485532 COX7A2LO14548 114 aa7.94□□□□□ -1.14
PRAME-212ENST00000485532 CFAP161Q6P656 301 aa7.94□□□□□ -1.14
PRAME-212ENST00000485532 STPG4Q8N801 248 aa7.94□□□□□ -1.14
PRAME-212ENST00000485532 LINC00526Q96FQ7 95 aa7.94□□□□□ -1.14
PRAME-212ENST00000485532 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.93□□□□□ -1.14
PRAME-212ENST00000485532 H3BRM9 83 aa7.93□□□□□ -1.14
PRAME-212ENST00000485532 SPINK8P0C7L1 97 aa7.93□□□□□ -1.14
PRAME-212ENST00000485532 LINC01561Q8N1V8 128 aa7.93□□□□□ -1.14
PRAME-212ENST00000485532 A0A096LNI7 61 aa7.92□□□□□ -1.14
PRAME-212ENST00000485532 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
PRAME-212ENST00000485532 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.92□□□□□ -1.14
PRAME-212ENST00000485532 SMIM6P0DI80 62 aa7.92□□□□□ -1.14
PRAME-212ENST00000485532 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.92□□□□□ -1.14
PRAME-212ENST00000485532 C7orf33Q8WU49 177 aa7.92□□□□□ -1.14
PRAME-212ENST00000485532 MALP21145 153 aa7.9□□□□□ -1.14
PRAME-212ENST00000485532 HERVK_113P61574 105 aa7.9□□□□□ -1.14
PRAME-212ENST00000485532 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
PRAME-212ENST00000485532 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.89□□□□□ -1.15
PRAME-212ENST00000485532 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.89□□□□□ -1.15
PRAME-212ENST00000485532 E9PLD3 99 aa7.89□□□□□ -1.15
PRAME-212ENST00000485532 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.89□□□□□ -1.15
PRAME-212ENST00000485532 ORAOV1Q8WV07 137 aa7.89□□□□□ -1.15
PRAME-212ENST00000485532 VAMP8Q9BV40 100 aa7.89□□□□□ -1.15
PRAME-212ENST00000485532 TNXBP22105 4242 aa7.89□□□□□ -1.15
PRAME-212ENST00000485532 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.88□□□□□ -1.15
PRAME-212ENST00000485532 LEPROTO15243 131 aa7.88□□□□□ -1.15
PRAME-212ENST00000485532 PAM16Q9Y3D7 125 aa7.88□□□□□ -1.15
PRAME-212ENST00000485532 APOMO95445 188 aa7.87□□□□□ -1.15
PRAME-212ENST00000485532 SPAG11BQ08648 103 aa7.87□□□□□ -1.15
PRAME-212ENST00000485532 KIAA0087Q14695 138 aa7.87□□□□□ -1.15
PRAME-212ENST00000485532 SPATA45Q537H7 98 aa7.87□□□□□ -1.15
PRAME-212ENST00000485532 COX7B2Q8TF08 81 aa7.87□□□□□ -1.15
PRAME-212ENST00000485532 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.87□□□□□ -1.15
PRAME-212ENST00000485532 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.87□□□□□ -1.15
PRAME-212ENST00000485532 J3QQQ9 107 aa7.86□□□□□ -1.15
PRAME-212ENST00000485532 Q8IZM0 81 aa7.86□□□□□ -1.15
PRAME-212ENST00000485532 CARD19Q96LW7 228 aa7.86□□□□□ -1.15
PRAME-212ENST00000485532 LINC01600Q96MT4 127 aa7.86□□□□□ -1.15
PRAME-212ENST00000485532 NMUP48645 174 aa7.85□□□□□ -1.15
PRAME-212ENST00000485532 C12orf57Q99622 126 aa7.85□□□□□ -1.15
PRAME-212ENST00000485532 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.85□□□□□ -1.15
PRAME-212ENST00000485532 PRSS2P07478 247 aa7.84□□□□□ -1.15
PRAME-212ENST00000485532 S100A12P80511 92 aa7.84□□□□□ -1.15
PRAME-212ENST00000485532 SYCNQ0VAF6 134 aa7.84□□□□□ -1.15
PRAME-212ENST00000485532 PCP2Q8IVA1 136 aa7.84□□□□□ -1.15
PRAME-212ENST00000485532 LINC00518Q8N0U6 118 aa7.84□□□□□ -1.15
PRAME-212ENST00000485532 LRP2P98164 4655 aa7.83□□□□□ -1.16
PRAME-212ENST00000485532 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.83□□□□□ -1.16
PRAME-212ENST00000485532 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
PRAME-212ENST00000485532 C6orf226Q5I0X4 101 aa7.83□□□□□ -1.16
PRAME-212ENST00000485532 C2orf82Q6UX34 121 aa7.83□□□□□ -1.16
PRAME-212ENST00000485532 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
PRAME-212ENST00000485532 C10orf25Q5T742 122 aa7.82□□□□□ -1.16
PRAME-212ENST00000485532 C2orf48Q96LS8 159 aa7.82□□□□□ -1.16
PRAME-212ENST00000485532 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.82□□□□□ -1.16
PRAME-212ENST00000485532 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.82□□□□□ -1.16
PRAME-212ENST00000485532 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.82□□□□□ -1.16
PRAME-212ENST00000485532 A0A1W2PNN7 141 aa7.81□□□□□ -1.16
PRAME-212ENST00000485532 NDUFA1O15239 70 aa7.81□□□□□ -1.16
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