RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439128.6

NEK1-201, Transcript of NIMA related kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 5,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK1-201ENST00000439128 TRIAP1O43715 76 aa8.51□□□□□ -1.05
NEK1-201ENST00000439128 ATOX1O00244 68 aa8.51□□□□□ -1.05
NEK1-201ENST00000439128 A0A1B0GUV1 79 aa8.5□□□□□ -1.05
NEK1-201ENST00000439128 RTL8CO15255 209 aa8.5□□□□□ -1.05
NEK1-201ENST00000439128 SMIM20Q8N5G0 67 aa8.5□□□□□ -1.05
NEK1-201ENST00000439128 Q9BRP9 147 aa8.5□□□□□ -1.05
NEK1-201ENST00000439128 PRR3P79522 188 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
NEK1-201ENST00000439128 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
NEK1-201ENST00000439128 SMIM1B2RUZ4 78 aa8.49□□□□□ -1.05
NEK1-201ENST00000439128 PTPRBP23467 1997 aa8.48□□□□□ -1.05
NEK1-201ENST00000439128 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
NEK1-201ENST00000439128 PRLHP81277 87 aa8.48□□□□□ -1.05
NEK1-201ENST00000439128 ENHOQ6UWT2 76 aa8.48□□□□□ -1.05
NEK1-201ENST00000439128 Q6ZVQ6 151 aa8.48□□□□□ -1.05
NEK1-201ENST00000439128 CNFNQ9BYD5 112 aa8.48□□□□□ -1.05
NEK1-201ENST00000439128 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa8.48□□□□□ -1.05
NEK1-201ENST00000439128 LIMD2Q9BT23 127 aa8.48□□□□□ -1.05
NEK1-201ENST00000439128 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
NEK1-201ENST00000439128 IGIPA6NJ69 53 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-201ENST00000439128 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
NEK1-201ENST00000439128 X6R8D5 127 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-201ENST00000439128 K7EIL1 84 aa8.46□□□□□ -1.05
NEK1-201ENST00000439128 SDIM1Q6ZPB5 146 aa8.46□□□□□ -1.06
NEK1-201ENST00000439128 TAX1BP3O14907 124 aa8.46□□□□□ -1.06
NEK1-201ENST00000439128 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa8.46□□□□□ -1.06
NEK1-201ENST00000439128 C3orf22Q8N5N4 141 aa8.45□□□□□ -1.06
NEK1-201ENST00000439128 C2CD3Q4AC94 2353 aa8.45□□□□□ -1.06
NEK1-201ENST00000439128 PRYO14603 147 aa8.45□□□□□ -1.06
NEK1-201ENST00000439128 C22orf24Q9Y442 160 aa8.45□□□□□ -1.06
NEK1-201ENST00000439128 C11orf72Q8NBR9 251 aa8.44□□□□□ -1.06
NEK1-201ENST00000439128 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
NEK1-201ENST00000439128 Q6Q795 121 aa8.44□□□□□ -1.06
NEK1-201ENST00000439128 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa8.44□□□□□ -1.06
NEK1-201ENST00000439128 TP73-AS1Q9UF72 201 aa8.43□□□□□ -1.06
NEK1-201ENST00000439128 LINC00588Q9Y4M8 146 aa8.43□□□□□ -1.06
NEK1-201ENST00000439128 KRTAP10-11P60412 298 aa8.43□□□□□ -1.06
NEK1-201ENST00000439128 Q6JHZ5 121 aa8.43□□□□□ -1.06
NEK1-201ENST00000439128 LINC00643Q86TS7 51 aa8.42□□□□□ -1.06
NEK1-201ENST00000439128 SPACA4Q8TDM5 124 aa8.42□□□□□ -1.06
NEK1-201ENST00000439128 H3BNG1 76 aa8.42□□□□□ -1.06
NEK1-201ENST00000439128 K7ERS5 55 aa8.41□□□□□ -1.06
NEK1-201ENST00000439128 SMCR5Q8TEV8 140 aa8.41□□□□□ -1.06
NEK1-201ENST00000439128 Q8NAQ8 132 aa8.4□□□□□ -1.06
NEK1-201ENST00000439128 PKD1L2Q7Z442 2459 aa8.39□□□□□ -1.07
NEK1-201ENST00000439128 POLQO75417 2590 aa8.39□□□□□ -1.07
NEK1-201ENST00000439128 Q8N9L7 120 aa8.39□□□□□ -1.07
NEK1-201ENST00000439128 FAM30AQ9NZY2 134 aa8.39□□□□□ -1.07
NEK1-201ENST00000439128 SERP1Q9Y6X1 66 aa8.39□□□□□ -1.07
NEK1-201ENST00000439128 F8P00451 2351 aa8.38□□□□□ -1.07
NEK1-201ENST00000439128 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
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NEK1-201ENST00000439128 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa8.38□□□□□ -1.07
NEK1-201ENST00000439128 AMELXQ99217 191 aa8.38□□□□□ -1.07
NEK1-201ENST00000439128 CHTF8P0CG12 524 aa8.37□□□□□ -1.07
NEK1-201ENST00000439128 Q6ZRP5 223 aa8.37□□□□□ -1.07
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NEK1-201ENST00000439128 Q8N814 137 aa8.36□□□□□ -1.07
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NEK1-201ENST00000439128 EPG5Q9HCE0 2579 aa8.36□□□□□ -1.07
NEK1-201ENST00000439128 A0A087WSZ3 146 aa8.36□□□□□ -1.07
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NEK1-201ENST00000439128 TYMSOSQ8TAI1 123 aa8.36□□□□□ -1.07
NEK1-201ENST00000439128 CENPFP49454 3210 aa8.35□□□□□ -1.07
NEK1-201ENST00000439128 SPTSSBQ8NFR3 76 aa8.35□□□□□ -1.07
NEK1-201ENST00000439128 MOBPQ13875 183 aa8.35□□□□□ -1.07
NEK1-201ENST00000439128 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa8.35□□□□□ -1.07
NEK1-201ENST00000439128 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa8.35□□□□□ -1.07
NEK1-201ENST00000439128 DEFB116Q30KQ4 102 aa8.35□□□□□ -1.07
NEK1-201ENST00000439128 COX8CQ7Z4L0 72 aa8.34□□□□□ -1.07
NEK1-201ENST00000439128 CRYGAP11844 174 aa8.34□□□□□ -1.07
NEK1-201ENST00000439128 PRR4Q16378 134 aa8.34□□□□□ -1.07
NEK1-201ENST00000439128 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
NEK1-201ENST00000439128 KRTAP10-3P60369 221 aa8.34□□□□□ -1.07
NEK1-201ENST00000439128 Q8N3U1 123 aa8.34□□□□□ -1.07
NEK1-201ENST00000439128 A8MTW9 85 aa8.34□□□□□ -1.08
NEK1-201ENST00000439128 B5MCH6 92 aa8.34□□□□□ -1.08
NEK1-201ENST00000439128 C20orf197Q8N268 126 aa8.34□□□□□ -1.08
NEK1-201ENST00000439128 MTORP42345 2549 aa8.33□□□□□ -1.08
NEK1-201ENST00000439128 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
NEK1-201ENST00000439128 LINC00167Q96N53 147 aa8.33□□□□□ -1.08
NEK1-201ENST00000439128 PRR15LQ9BU68 103 aa8.32□□□□□ -1.08
NEK1-201ENST00000439128 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
NEK1-201ENST00000439128 A0A087WYN8 130 aa8.32□□□□□ -1.08
NEK1-201ENST00000439128 TSPEAR-AS2P59090 65 aa8.32□□□□□ -1.08
NEK1-201ENST00000439128 ACANP16112 2415 aa8.31□□□□□ -1.08
NEK1-201ENST00000439128 NDUFC2O95298 119 aa8.31□□□□□ -1.08
NEK1-201ENST00000439128 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa8.3□□□□□ -1.08
NEK1-201ENST00000439128 A0A096LNT2 108 aa8.3□□□□□ -1.08
NEK1-201ENST00000439128 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
NEK1-201ENST00000439128 C6orf48Q9UBA6 75 aa8.3□□□□□ -1.08
NEK1-201ENST00000439128 SPINK1P00995 79 aa8.29□□□□□ -1.08
NEK1-201ENST00000439128 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
NEK1-201ENST00000439128 DNAH10OSP0CZ25 163 aa8.28□□□□□ -1.08
NEK1-201ENST00000439128 FAM19A4Q96LR4 140 aa8.28□□□□□ -1.08
NEK1-201ENST00000439128 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
NEK1-201ENST00000439128 J3KT08 172 aa8.27□□□□□ -1.09
NEK1-201ENST00000439128 C19orf73Q9NVV2 129 aa8.27□□□□□ -1.09
NEK1-201ENST00000439128 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
NEK1-201ENST00000439128 LINC00575Q6W349 94 aa8.26□□□□□ -1.09
NEK1-201ENST00000439128 PCSK5Q92824 1860 aa8.26□□□□□ -1.09
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