RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 hDV102S1A0JD36 115 aa4.1□□□□□ -1.75
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HOXD8-202ENST00000429017 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
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HOXD8-202ENST00000429017 PLNP26678 52 aa4.04□□□□□ -1.76
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HOXD8-202ENST00000429017 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa4.04□□□□□ -1.76
HOXD8-202ENST00000429017 SLC25A34Q6PIV7 304 aa4.04□□□□□ -1.76
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HOXD8-202ENST00000429017 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
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HOXD8-202ENST00000429017 KRTAP5-9P26371 169 aa4.03□□□□□ -1.76
HOXD8-202ENST00000429017 SMAGPQ0VAQ4 97 aa4.03□□□□□ -1.76
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HOXD8-202ENST00000429017 CFAP161Q6P656 301 aa4.03□□□□□ -1.76
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HOXD8-202ENST00000429017 F8VRH5 84 aa4.02□□□□□ -1.77
HOXD8-202ENST00000429017 TSHBP01222 138 aa4.02□□□□□ -1.77
HOXD8-202ENST00000429017 PMVKQ15126 192 aa4.02□□□□□ -1.77
HOXD8-202ENST00000429017 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.02□□□□□ -1.77
HOXD8-202ENST00000429017 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
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HOXD8-202ENST00000429017 IGIPA6NJ69 53 aa4.01□□□□□ -1.77
HOXD8-202ENST00000429017 FGF6P10767 208 aa4.01□□□□□ -1.77
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