RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427487.5

HDLBP-215, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 924 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-215ENST00000427487 TNP2Q05952 138 aa7.88□□□□□ -1.15
HDLBP-215ENST00000427487 WFDC2Q14508 124 aa7.88□□□□□ -1.15
HDLBP-215ENST00000427487 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.88□□□□□ -1.15
HDLBP-215ENST00000427487 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.88□□□□□ -1.15
HDLBP-215ENST00000427487 DLEU1O43261 78 aa7.87□□□□□ -1.15
HDLBP-215ENST00000427487 SYCNQ0VAF6 134 aa7.87□□□□□ -1.15
HDLBP-215ENST00000427487 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.87□□□□□ -1.15
HDLBP-215ENST00000427487 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.87□□□□□ -1.15
HDLBP-215ENST00000427487 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.87□□□□□ -1.15
HDLBP-215ENST00000427487 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.87□□□□□ -1.15
HDLBP-215ENST00000427487 FAT2Q9NYQ8 4349 aa7.87□□□□□ -1.15
HDLBP-215ENST00000427487 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.86□□□□□ -1.15
HDLBP-215ENST00000427487 COX17Q14061 63 aa7.86□□□□□ -1.15
HDLBP-215ENST00000427487 CARD19Q96LW7 228 aa7.86□□□□□ -1.15
HDLBP-215ENST00000427487 LECT2O14960 151 aa7.85□□□□□ -1.15
HDLBP-215ENST00000427487 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.85□□□□□ -1.15
HDLBP-215ENST00000427487 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.85□□□□□ -1.15
HDLBP-215ENST00000427487 MAJINQ3KP22 176 aa7.85□□□□□ -1.15
HDLBP-215ENST00000427487 SPATA45Q537H7 98 aa7.85□□□□□ -1.15
HDLBP-215ENST00000427487 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.85□□□□□ -1.15
HDLBP-215ENST00000427487 PAM16Q9Y3D7 125 aa7.85□□□□□ -1.15
HDLBP-215ENST00000427487 SLPIP03973 132 aa7.84□□□□□ -1.15
HDLBP-215ENST00000427487 COX8AP10176 69 aa7.84□□□□□ -1.15
HDLBP-215ENST00000427487 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.84□□□□□ -1.15
HDLBP-215ENST00000427487 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.84□□□□□ -1.15
HDLBP-215ENST00000427487 ZNF815PA8K554 130 aa7.83□□□□□ -1.16
HDLBP-215ENST00000427487 TIMM17BO60830 172 aa7.83□□□□□ -1.16
HDLBP-215ENST00000427487 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.83□□□□□ -1.16
HDLBP-215ENST00000427487 Q6ZRU5 148 aa7.83□□□□□ -1.16
HDLBP-215ENST00000427487 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa7.83□□□□□ -1.16
HDLBP-215ENST00000427487 C2orf82Q6UX34 121 aa7.82□□□□□ -1.16
HDLBP-215ENST00000427487 LINC00526Q96FQ7 95 aa7.82□□□□□ -1.16
HDLBP-215ENST00000427487 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.82□□□□□ -1.16
HDLBP-215ENST00000427487 GCSHP23434 173 aa7.81□□□□□ -1.16
HDLBP-215ENST00000427487 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
HDLBP-215ENST00000427487 C10orf25Q5T742 122 aa7.81□□□□□ -1.16
HDLBP-215ENST00000427487 PCP2Q8IVA1 136 aa7.81□□□□□ -1.16
HDLBP-215ENST00000427487 DNAH11Q96DT5 4516 aa7.81□□□□□ -1.16
HDLBP-215ENST00000427487 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
HDLBP-215ENST00000427487 A0A0J9YXY3 114 aa7.8□□□□□ -1.16
HDLBP-215ENST00000427487 A0A1B0GVY2 172 aa7.8□□□□□ -1.16
HDLBP-215ENST00000427487 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.8□□□□□ -1.16
HDLBP-215ENST00000427487 SLC25A34Q6PIV7 304 aa7.8□□□□□ -1.16
HDLBP-215ENST00000427487 Q6ZVH6 145 aa7.8□□□□□ -1.16
HDLBP-215ENST00000427487 LINC00518Q8N0U6 118 aa7.8□□□□□ -1.16
HDLBP-215ENST00000427487 C12orf57Q99622 126 aa7.8□□□□□ -1.16
HDLBP-215ENST00000427487 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.8□□□□□ -1.16
HDLBP-215ENST00000427487 ERG28Q9UKR5 140 aa7.8□□□□□ -1.16
HDLBP-215ENST00000427487 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa7.79□□□□□ -1.16
HDLBP-215ENST00000427487 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.79□□□□□ -1.16
HDLBP-215ENST00000427487 HIGD1BQ9P298 99 aa7.79□□□□□ -1.16
HDLBP-215ENST00000427487 TMEM238C9JI98 176 aa7.78□□□□□ -1.16
HDLBP-215ENST00000427487 PTTG1IPP53801 180 aa7.78□□□□□ -1.16
HDLBP-215ENST00000427487 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.78□□□□□ -1.16
HDLBP-215ENST00000427487 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.78□□□□□ -1.16
HDLBP-215ENST00000427487 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.78□□□□□ -1.16
HDLBP-215ENST00000427487 UQCR10Q9UDW1 63 aa7.78□□□□□ -1.16
HDLBP-215ENST00000427487 PKD1P98161 4303 aa7.77□□□□□ -1.16
HDLBP-215ENST00000427487 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.77□□□□□ -1.17
HDLBP-215ENST00000427487 C16orf90A8MZG2 172 aa7.77□□□□□ -1.17
HDLBP-215ENST00000427487 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7.77□□□□□ -1.17
HDLBP-215ENST00000427487 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.77□□□□□ -1.17
HDLBP-215ENST00000427487 COPS9Q8WXC6 57 aa7.77□□□□□ -1.17
HDLBP-215ENST00000427487 C14orf144Q96I85 54 aa7.77□□□□□ -1.17
HDLBP-215ENST00000427487 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.77□□□□□ -1.17
HDLBP-215ENST00000427487 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
HDLBP-215ENST00000427487 KRTAP10-2P60368 255 aa7.76□□□□□ -1.17
HDLBP-215ENST00000427487 LITAFQ99732 161 aa7.76□□□□□ -1.17
HDLBP-215ENST00000427487 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.76□□□□□ -1.17
HDLBP-215ENST00000427487 SPANXCQ9NY87 97 aa7.76□□□□□ -1.17
HDLBP-215ENST00000427487 SMIM13P0DJ93 91 aa7.75□□□□□ -1.17
HDLBP-215ENST00000427487 IFITM1P13164 125 aa7.75□□□□□ -1.17
HDLBP-215ENST00000427487 LINC00158P58513 81 aa7.75□□□□□ -1.17
HDLBP-215ENST00000427487 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
HDLBP-215ENST00000427487 Q6ZRP5 223 aa7.75□□□□□ -1.17
HDLBP-215ENST00000427487 TSTD3H0UI37 97 aa7.74□□□□□ -1.17
HDLBP-215ENST00000427487 PFN2P35080 140 aa7.74□□□□□ -1.17
HDLBP-215ENST00000427487 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.74□□□□□ -1.17
HDLBP-215ENST00000427487 DNAH5Q8TE73 4624 aa7.73□□□□□ -1.17
HDLBP-215ENST00000427487 TAL2Q16559 108 aa7.73□□□□□ -1.17
HDLBP-215ENST00000427487 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.73□□□□□ -1.17
HDLBP-215ENST00000427487 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.73□□□□□ -1.17
HDLBP-215ENST00000427487 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.73□□□□□ -1.17
HDLBP-215ENST00000427487 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
HDLBP-215ENST00000427487 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.72□□□□□ -1.17
HDLBP-215ENST00000427487 C2orf91Q6ZV80 131 aa7.72□□□□□ -1.17
HDLBP-215ENST00000427487 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.72□□□□□ -1.17
HDLBP-215ENST00000427487 EPM2AB3EWF7 344 aa7.71□□□□□ -1.18
HDLBP-215ENST00000427487 Q6ZSA8 131 aa7.71□□□□□ -1.18
HDLBP-215ENST00000427487 A0A096LNI7 61 aa7.7□□□□□ -1.18
HDLBP-215ENST00000427487 NDUFC2O95298 119 aa7.7□□□□□ -1.18
HDLBP-215ENST00000427487 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.7□□□□□ -1.18
HDLBP-215ENST00000427487 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
HDLBP-215ENST00000427487 GAGE2BQ13066 116 aa7.69□□□□□ -1.18
HDLBP-215ENST00000427487 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.69□□□□□ -1.18
HDLBP-215ENST00000427487 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.69□□□□□ -1.18
HDLBP-215ENST00000427487 PKHD1P08F94 4074 aa7.69□□□□□ -1.18
HDLBP-215ENST00000427487 DNAH8Q96JB1 4490 aa7.69□□□□□ -1.18
HDLBP-215ENST00000427487 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.68□□□□□ -1.18
HDLBP-215ENST00000427487 A0A0U1RRA0 63 aa7.68□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.3 ms