RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 UBE2D1P51668 147 aa4.5□□□□□ -1.69
CCL20-202ENST00000409189 HERVK_113P63121 156 aa4.5□□□□□ -1.69
CCL20-202ENST00000409189 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa4.5□□□□□ -1.69
CCL20-202ENST00000409189 TMEM170BQ5T4T1 132 aa4.5□□□□□ -1.69
CCL20-202ENST00000409189 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa4.5□□□□□ -1.69
CCL20-202ENST00000409189 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa4.5□□□□□ -1.69
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CCL20-202ENST00000409189 LINC00242Q5T6M2 205 aa4.45□□□□□ -1.7
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CCL20-202ENST00000409189 CEND1Q8N111 149 aa4.44□□□□□ -1.7
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CCL20-202ENST00000409189 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa4.44□□□□□ -1.7
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CCL20-202ENST00000409189 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.43□□□□□ -1.7
CCL20-202ENST00000409189 C10orf126Q8N4M7 172 aa4.43□□□□□ -1.7
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CCL20-202ENST00000409189 HIST1H4GQ99525 98 aa4.43□□□□□ -1.7
CCL20-202ENST00000409189 NDUFA12Q9UI09 145 aa4.43□□□□□ -1.7
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CCL20-202ENST00000409189 HERV-K104P63124 156 aa4.42□□□□□ -1.7
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CCL20-202ENST00000409189 SPANXDQ9BXN6 97 aa4.42□□□□□ -1.7
CCL20-202ENST00000409189 SPANXCQ9NY87 97 aa4.42□□□□□ -1.7
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