RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 PTTG1IPP53801 180 aa6.62□□□□□ -1.35
POLR1A-202ENST00000409024 FOXI1Q12951 378 aa6.62□□□□□ -1.35
POLR1A-202ENST00000409024 BATFQ16520 125 aa6.62□□□□□ -1.35
POLR1A-202ENST00000409024 C5orf38Q86SI9 138 aa6.62□□□□□ -1.35
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
POLR1A-202ENST00000409024 APLNQ9ULZ1 77 aa6.62□□□□□ -1.35
POLR1A-202ENST00000409024 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.61□□□□□ -1.35
POLR1A-202ENST00000409024 F8WDY8 70 aa6.61□□□□□ -1.35
POLR1A-202ENST00000409024 PRSS2P07478 247 aa6.61□□□□□ -1.35
POLR1A-202ENST00000409024 MALP21145 153 aa6.61□□□□□ -1.35
POLR1A-202ENST00000409024 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.61□□□□□ -1.35
POLR1A-202ENST00000409024 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.61□□□□□ -1.35
POLR1A-202ENST00000409024 UBE2WQ96B02 151 aa6.61□□□□□ -1.35
POLR1A-202ENST00000409024 RMI2Q96E14 147 aa6.61□□□□□ -1.35
POLR1A-202ENST00000409024 Q9H8V8 135 aa6.61□□□□□ -1.35
POLR1A-202ENST00000409024 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.6□□□□□ -1.35
POLR1A-202ENST00000409024 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.6□□□□□ -1.35
POLR1A-202ENST00000409024 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
POLR1A-202ENST00000409024 Q8N3U1 123 aa6.6□□□□□ -1.35
POLR1A-202ENST00000409024 A0A1B0GWB2 263 aa6.59□□□□□ -1.35
POLR1A-202ENST00000409024 LITAFQ99732 161 aa6.59□□□□□ -1.35
POLR1A-202ENST00000409024 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.59□□□□□ -1.35
POLR1A-202ENST00000409024 COX11Q9Y6N1 276 aa6.59□□□□□ -1.35
POLR1A-202ENST00000409024 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.58□□□□□ -1.36
POLR1A-202ENST00000409024 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
POLR1A-202ENST00000409024 SMIM13P0DJ93 91 aa6.58□□□□□ -1.36
POLR1A-202ENST00000409024 FXYD2P54710 66 aa6.58□□□□□ -1.36
POLR1A-202ENST00000409024 COX17Q14061 63 aa6.58□□□□□ -1.36
POLR1A-202ENST00000409024 KIAA0087Q14695 138 aa6.58□□□□□ -1.36
POLR1A-202ENST00000409024 CFAP161Q6P656 301 aa6.58□□□□□ -1.36
POLR1A-202ENST00000409024 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.58□□□□□ -1.36
POLR1A-202ENST00000409024 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.58□□□□□ -1.36
POLR1A-202ENST00000409024 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.58□□□□□ -1.36
POLR1A-202ENST00000409024 CKS1BP61024 79 aa6.57□□□□□ -1.36
POLR1A-202ENST00000409024 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.57□□□□□ -1.36
POLR1A-202ENST00000409024 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR1A-202ENST00000409024 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR1A-202ENST00000409024 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
POLR1A-202ENST00000409024 A0A0B4J2C4 111 aa6.55□□□□□ -1.36
POLR1A-202ENST00000409024 TAX1BP3O14907 124 aa6.55□□□□□ -1.36
POLR1A-202ENST00000409024 SPAG11BQ08648 103 aa6.55□□□□□ -1.36
POLR1A-202ENST00000409024 TTC32Q5I0X7 151 aa6.55□□□□□ -1.36
POLR1A-202ENST00000409024 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.55□□□□□ -1.36
POLR1A-202ENST00000409024 C2orf48Q96LS8 159 aa6.55□□□□□ -1.36
POLR1A-202ENST00000409024 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.54□□□□□ -1.36
POLR1A-202ENST00000409024 C9orf118A6NHY6 69 aa6.54□□□□□ -1.36
POLR1A-202ENST00000409024 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
POLR1A-202ENST00000409024 ERG28Q9UKR5 140 aa6.54□□□□□ -1.36
POLR1A-202ENST00000409024 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.53□□□□□ -1.36
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.53□□□□□ -1.36
POLR1A-202ENST00000409024 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.53□□□□□ -1.36
POLR1A-202ENST00000409024 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.53□□□□□ -1.36
POLR1A-202ENST00000409024 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
POLR1A-202ENST00000409024 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.52□□□□□ -1.37
POLR1A-202ENST00000409024 A4D1N5 150 aa6.52□□□□□ -1.37
POLR1A-202ENST00000409024 CFC1BP0CG36 223 aa6.52□□□□□ -1.37
POLR1A-202ENST00000409024 CFC1P0CG37 223 aa6.52□□□□□ -1.37
POLR1A-202ENST00000409024 LINC00158P58513 81 aa6.52□□□□□ -1.37
POLR1A-202ENST00000409024 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.51□□□□□ -1.37
POLR1A-202ENST00000409024 A0A1B0GV90 55 aa6.51□□□□□ -1.37
POLR1A-202ENST00000409024 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.51□□□□□ -1.37
POLR1A-202ENST00000409024 RAB37Q96AX2 223 aa6.51□□□□□ -1.37
POLR1A-202ENST00000409024 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.51□□□□□ -1.37
POLR1A-202ENST00000409024 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR1A-202ENST00000409024 RNF151Q2KHN1 245 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR1A-202ENST00000409024 C2orf82Q6UX34 121 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR1A-202ENST00000409024 C15orf56Q8N910 161 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR1A-202ENST00000409024 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.49□□□□□ -1.37
POLR1A-202ENST00000409024 NDUFC2O95298 119 aa6.49□□□□□ -1.37
POLR1A-202ENST00000409024 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.49□□□□□ -1.37
POLR1A-202ENST00000409024 Q9HAA7 133 aa6.49□□□□□ -1.37
POLR1A-202ENST00000409024 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.48□□□□□ -1.37
POLR1A-202ENST00000409024 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.48□□□□□ -1.37
POLR1A-202ENST00000409024 A0A1W2PPM0 123 aa6.48□□□□□ -1.37
POLR1A-202ENST00000409024 FABP2P12104 132 aa6.48□□□□□ -1.37
POLR1A-202ENST00000409024 PFN2P35080 140 aa6.48□□□□□ -1.37
POLR1A-202ENST00000409024 C14orf177Q52M58 125 aa6.48□□□□□ -1.37
POLR1A-202ENST00000409024 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.48□□□□□ -1.37
POLR1A-202ENST00000409024 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.48□□□□□ -1.37
POLR1A-202ENST00000409024 A0A0U1RRA0 63 aa6.47□□□□□ -1.37
POLR1A-202ENST00000409024 H3BUT2 72 aa6.47□□□□□ -1.37
POLR1A-202ENST00000409024 K7ERJ3 54 aa6.47□□□□□ -1.37
POLR1A-202ENST00000409024 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.47□□□□□ -1.37
POLR1A-202ENST00000409024 DAND5Q8N907 189 aa6.47□□□□□ -1.37
POLR1A-202ENST00000409024 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.47□□□□□ -1.37
POLR1A-202ENST00000409024 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.47□□□□□ -1.37
POLR1A-202ENST00000409024 SYCNQ0VAF6 134 aa6.46□□□□□ -1.38
POLR1A-202ENST00000409024 VAMP3Q15836 100 aa6.46□□□□□ -1.38
POLR1A-202ENST00000409024 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.46□□□□□ -1.38
POLR1A-202ENST00000409024 C6orf223Q8N319 242 aa6.46□□□□□ -1.38
POLR1A-202ENST00000409024 USP17L23D6RBM5 183 aa6.45□□□□□ -1.38
POLR1A-202ENST00000409024 TSPAN13O95857 204 aa6.45□□□□□ -1.38
POLR1A-202ENST00000409024 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.45□□□□□ -1.38
POLR1A-202ENST00000409024 NPC2P61916 151 aa6.45□□□□□ -1.38
POLR1A-202ENST00000409024 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.45□□□□□ -1.38
POLR1A-202ENST00000409024 C10orf25Q5T742 122 aa6.45□□□□□ -1.38
POLR1A-202ENST00000409024 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.45□□□□□ -1.38
POLR1A-202ENST00000409024 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.45□□□□□ -1.38
POLR1A-202ENST00000409024 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.44□□□□□ -1.38
POLR1A-202ENST00000409024 GAGE10A6NGK3 116 aa6.44□□□□□ -1.38
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