RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375425.9

NELFE-201, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene NELFE, Length 1,405 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-201ENST00000375425 Q8IZM0 81 aa8.63□□□□□ -1.03
NELFE-201ENST00000375425 TOMM6Q96B49 74 aa8.63□□□□□ -1.03
NELFE-201ENST00000375425 TIMM17AQ99595 171 aa8.63□□□□□ -1.03
NELFE-201ENST00000375425 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
NELFE-201ENST00000375425 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa8.63□□□□□ -1.03
NELFE-201ENST00000375425 H0Y9J4 135 aa8.62□□□□□ -1.03
NELFE-201ENST00000375425 SEC11AP67812 179 aa8.62□□□□□ -1.03
NELFE-201ENST00000375425 LINC00469Q8N7U9 141 aa8.62□□□□□ -1.03
NELFE-201ENST00000375425 PRR26Q8N8Z3 221 aa8.62□□□□□ -1.03
NELFE-201ENST00000375425 TMEM218A2RU14 115 aa8.61□□□□□ -1.03
NELFE-201ENST00000375425 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
NELFE-201ENST00000375425 UQCC3Q6UW78 93 aa8.6□□□□□ -1.03
NELFE-201ENST00000375425 ERASQ7Z444 233 aa8.6□□□□□ -1.03
NELFE-201ENST00000375425 SCGB3A1Q96QR1 104 aa8.6□□□□□ -1.03
NELFE-201ENST00000375425 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-201ENST00000375425 XAGE1AQ9HD64 81 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-201ENST00000375425 C22orf24Q9Y442 160 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-201ENST00000375425 F8VRH5 84 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-201ENST00000375425 GNB1LQ9BYB4 327 aa8.57□□□□□ -1.04
NELFE-201ENST00000375425 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa8.56□□□□□ -1.04
NELFE-201ENST00000375425 S100PP25815 95 aa8.56□□□□□ -1.04
NELFE-201ENST00000375425 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa8.55□□□□□ -1.04
NELFE-201ENST00000375425 LINC01546A6NGU7 62 aa8.55□□□□□ -1.04
NELFE-201ENST00000375425 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
NELFE-201ENST00000375425 SEC11CQ9BY50 192 aa8.55□□□□□ -1.04
NELFE-201ENST00000375425 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa8.54□□□□□ -1.04
NELFE-201ENST00000375425 LINC01549A6NIU2 74 aa8.54□□□□□ -1.04
NELFE-201ENST00000375425 SMIM1B2RUZ4 78 aa8.54□□□□□ -1.04
NELFE-201ENST00000375425 ZNF861PO60384 105 aa8.54□□□□□ -1.04
NELFE-201ENST00000375425 CXCL5P42830 114 aa8.54□□□□□ -1.04
NELFE-201ENST00000375425 PDZD11Q5EBL8 140 aa8.54□□□□□ -1.04
NELFE-201ENST00000375425 CST9LQ9H4G1 147 aa8.54□□□□□ -1.04
NELFE-201ENST00000375425 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa8.54□□□□□ -1.04
NELFE-201ENST00000375425 COMMD7Q86VX2 200 aa8.54□□□□□ -1.04
NELFE-201ENST00000375425 COX7B2Q8TF08 81 aa8.54□□□□□ -1.04
NELFE-201ENST00000375425 NUPR1O60356 82 aa8.53□□□□□ -1.04
NELFE-201ENST00000375425 FABP9Q0Z7S8 132 aa8.52□□□□□ -1.05
NELFE-201ENST00000375425 COX19Q49B96 90 aa8.52□□□□□ -1.05
NELFE-201ENST00000375425 FA2HQ7L5A8 372 aa8.52□□□□□ -1.05
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NELFE-201ENST00000375425 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
NELFE-201ENST00000375425 TP73-AS1Q9UF72 201 aa8.52□□□□□ -1.05
NELFE-201ENST00000375425 SPINK8P0C7L1 97 aa8.51□□□□□ -1.05
NELFE-201ENST00000375425 RAB5BP61020 215 aa8.51□□□□□ -1.05
NELFE-201ENST00000375425 PMVKQ15126 192 aa8.51□□□□□ -1.05
NELFE-201ENST00000375425 SMCO4Q9NRQ5 59 aa8.51□□□□□ -1.05
NELFE-201ENST00000375425 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
NELFE-201ENST00000375425 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
NELFE-201ENST00000375425 LINC00167Q96N53 147 aa8.49□□□□□ -1.05
NELFE-201ENST00000375425 RPL37AP8A6NKH3 93 aa8.48□□□□□ -1.05
NELFE-201ENST00000375425 C10orf91Q5T1B1 145 aa8.48□□□□□ -1.05
NELFE-201ENST00000375425 RPS10P5Q9NQ39 176 aa8.48□□□□□ -1.05
NELFE-201ENST00000375425 BCE1O60756 84 aa8.47□□□□□ -1.05
NELFE-201ENST00000375425 GAGE10A6NGK3 116 aa8.46□□□□□ -1.05
NELFE-201ENST00000375425 H3BRM9 83 aa8.46□□□□□ -1.05
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NELFE-201ENST00000375425 RHEBQ15382 184 aa8.46□□□□□ -1.05
NELFE-201ENST00000375425 ATP5LO75964 103 aa8.46□□□□□ -1.06
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NELFE-201ENST00000375425 A0A096LNJ9 63 aa8.45□□□□□ -1.06
NELFE-201ENST00000375425 LINC00614P0C842 121 aa8.45□□□□□ -1.06
NELFE-201ENST00000375425 IGLC3P0DOY3 106 aa8.45□□□□□ -1.06
NELFE-201ENST00000375425 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa8.45□□□□□ -1.06
NELFE-201ENST00000375425 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-201ENST00000375425 PFN2P35080 140 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-201ENST00000375425 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-201ENST00000375425 A0A087X002 238 aa8.43□□□□□ -1.06
NELFE-201ENST00000375425 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa8.43□□□□□ -1.06
NELFE-201ENST00000375425 PRR4Q16378 134 aa8.43□□□□□ -1.06
NELFE-201ENST00000375425 NKAPP1Q8N9T2 125 aa8.43□□□□□ -1.06
NELFE-201ENST00000375425 C18orf32Q8TCD1 76 aa8.43□□□□□ -1.06
NELFE-201ENST00000375425 MUC2Q02817 5179 aa8.42□□□□□ -1.06
NELFE-201ENST00000375425 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
NELFE-201ENST00000375425 TSPAN13O95857 204 aa8.41□□□□□ -1.06
NELFE-201ENST00000375425 HBDP02042 147 aa8.41□□□□□ -1.06
NELFE-201ENST00000375425 PMCHL1Q16048 86 aa8.41□□□□□ -1.06
NELFE-201ENST00000375425 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-201ENST00000375425 SCO1O75880 301 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-201ENST00000375425 IGKV2D-28P01615 120 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-201ENST00000375425 CRYGAP11844 174 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-201ENST00000375425 UBE2AP49459 152 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-201ENST00000375425 ANAPC11Q9NYG5 84 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-201ENST00000375425 BAGE3Q86Y29 109 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-201ENST00000375425 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa8.39□□□□□ -1.07
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NELFE-201ENST00000375425 ERG28Q9UKR5 140 aa8.39□□□□□ -1.07
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NELFE-201ENST00000375425 APOC3P02656 99 aa8.37□□□□□ -1.07
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NELFE-201ENST00000375425 TMEM170BQ5T4T1 132 aa8.37□□□□□ -1.07
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NELFE-201ENST00000375425 RPL24P83731 157 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
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NELFE-201ENST00000375425 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
NELFE-201ENST00000375425 TMEM238C9JI98 176 aa8.34□□□□□ -1.07
NELFE-201ENST00000375425 SNAPINO95295 136 aa8.34□□□□□ -1.07
NELFE-201ENST00000375425 PRLHP81277 87 aa8.34□□□□□ -1.07
NELFE-201ENST00000375425 SFTA2Q6UW10 78 aa8.34□□□□□ -1.07
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